26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_2862 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_2862  Zinc finger-domain-containing protein  100 
 
 		 273 aa  535  1e-151  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3088  MJ0042 family finger-like protein  98.41 
 
 		 251 aa  480  1e-134  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.148898  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2982  MJ0042 family finger-like protein  77.69 
 
 		 244 aa  318  7.999999999999999e-86  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.739181  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2979  Zinc finger-domain-containing protein  51.01 
 
 		 255 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0278166  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2196  Zinc finger-domain-containing protein  43.25 
 
 		 236 aa  173  2.9999999999999996e-42  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.676163  normal  0.693925 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1155  MJ0042 family finger-like protein  46.89 
 
 		 237 aa  173  2.9999999999999996e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.967228  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1175  hypothetical protein  34.03 
 
 		 306 aa  141  9.999999999999999e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.757777 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0666  Zinc finger/thioredoxin putative  34.04 
 
 		 284 aa  133  3.9999999999999996e-30  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.248868  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0575  hypothetical protein  31.47 
 
 		 285 aa  130  2.0000000000000002e-29  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5219  MJ0042 family finger-like protein  33.55 
 
 		 298 aa  130  3e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.61677  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0833  Zinc finger/thioredoxin putative  30.51 
 
 		 293 aa  115  8.999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0939857  normal  0.925505 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0942  Zinc finger/thioredoxin putative  28.91 
 
 		 293 aa  113  3e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1596  Zinc finger-domain-containing protein  29.37 
 
 		 318 aa  102  5e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.889508 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2373  Zinc finger-domain-containing protein  28.08 
 
 		 297 aa  94  3e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.202349 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3216  Zinc finger-domain-containing protein  29.15 
 
 		 308 aa  91.3  2e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.639596  normal  0.370858 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4868  Zinc finger/thioredoxin putative  36.92 
 
 		 306 aa  85.1  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.186444  normal  0.75995 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0702  Zinc finger/thioredoxin putative  37.33 
 
 		 294 aa  53.5  0.000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0479  Zinc finger/thioredoxin putative  47.22 
 
 		 274 aa  50.1  0.00004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0030  hypothetical protein  19.21 
 
 		 221 aa  49.3  0.00007  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0411  MJ0042 family finger-like protein  37.04 
 
 		 547 aa  47.8  0.0002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.839191  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2893  Zinc finger/thioredoxin putative  44.44 
 
 		 254 aa  47  0.0004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0057  zinc finger-like domain-containing protein  45.71 
 
 		 221 aa  46.2  0.0005  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3497  Zinc finger/thioredoxin putative  34.88 
 
 		 304 aa  46.2  0.0006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.557897 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1855  MJ0042 family finger-like protein  33.8 
 
 		 383 aa  45.4  0.001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3141  response regulator receiver protein  39.47 
 
 		 324 aa  43.9  0.003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3253  hypothetical protein  40 
 
 		 361 aa  43.1  0.004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.2134  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>