37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_0942 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007958  RPD_0942  Zinc finger/thioredoxin putative  100 
 
 		 293 aa  590  1e-167  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0833  Zinc finger/thioredoxin putative  82.15 
 
 		 293 aa  492  9.999999999999999e-139  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0939857  normal  0.925505 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5219  MJ0042 family finger-like protein  70.23 
 
 		 298 aa  417  9.999999999999999e-116  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.61677  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4868  Zinc finger/thioredoxin putative  56.82 
 
 		 306 aa  299  4e-80  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.186444  normal  0.75995 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0666  Zinc finger/thioredoxin putative  50.84 
 
 		 284 aa  286  4e-76  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.248868  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1175  hypothetical protein  52.01 
 
 		 306 aa  277  1e-73  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.757777 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0575  hypothetical protein  50.82 
 
 		 285 aa  276  2e-73  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1596  Zinc finger-domain-containing protein  29.76 
 
 		 318 aa  108  8.000000000000001e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.889508 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3088  MJ0042 family finger-like protein  31.06 
 
 		 251 aa  105  1e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.148898  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1155  MJ0042 family finger-like protein  32.39 
 
 		 237 aa  100  3e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.967228  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2862  Zinc finger-domain-containing protein  30.72 
 
 		 273 aa  100  3e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2979  Zinc finger-domain-containing protein  30.93 
 
 		 255 aa  99.4  7e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0278166  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2196  Zinc finger-domain-containing protein  42.02 
 
 		 236 aa  81.3  0.00000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.676163  normal  0.693925 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3216  Zinc finger-domain-containing protein  24.3 
 
 		 308 aa  73.2  0.000000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.639596  normal  0.370858 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2373  Zinc finger-domain-containing protein  29.69 
 
 		 297 aa  65.5  0.000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.202349 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1855  MJ0042 family finger-like protein  36.36 
 
 		 383 aa  53.5  0.000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2982  MJ0042 family finger-like protein  40.91 
 
 		 244 aa  52.8  0.000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.739181  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2015  Zinc finger-domain-containing protein  33.04 
 
 		 538 aa  50.8  0.00003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0713  hypothetical protein  38.1 
 
 		 142 aa  47.8  0.0002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4144  Zinc finger-domain-containing protein  43.9 
 
 		 1124 aa  48.1  0.0002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000494225 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0702  Zinc finger/thioredoxin putative  37.29 
 
 		 294 aa  48.1  0.0002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3253  hypothetical protein  27.96 
 
 		 361 aa  47.4  0.0003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.2134  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0454  MJ0042 family finger-like protein  42.86 
 
 		 1163 aa  46.2  0.0007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.75357  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0453  MJ0042 family finger-like protein  42.86 
 
 		 1144 aa  45.8  0.0008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.13216  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0425  zinc finger/thioredoxin putative  41.46 
 
 		 1139 aa  45.1  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2386  Zinc finger-domain-containing protein  32.61 
 
 		 368 aa  43.5  0.004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.814986  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1423  Zinc finger-domain-containing protein  45.24 
 
 		 248 aa  43.5  0.005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.328628  normal  0.281869 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2048  MJ0042 family finger-like protein  46.15 
 
 		 532 aa  43.1  0.005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.121287  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1032  Zinc finger/thioredoxin putative  37.5 
 
 		 501 aa  43.5  0.005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000300649  hitchhiker  0.0000540788 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3397  Zinc finger-domain-containing protein  42.5 
 
 		 560 aa  43.1  0.005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000473344  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2118  MJ0042 family finger-like protein  46.15 
 
 		 530 aa  43.1  0.005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.000277169  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0732  hypothetical protein  31.91 
 
 		 304 aa  43.1  0.006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.738577  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0057  zinc finger-like domain-containing protein  35.9 
 
 		 221 aa  42.7  0.007  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2893  Zinc finger/thioredoxin putative  41.67 
 
 		 254 aa  42.7  0.007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0479  Zinc finger/thioredoxin putative  36.11 
 
 		 274 aa  42.7  0.008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0411  MJ0042 family finger-like protein  40.43 
 
 		 547 aa  42.4  0.009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.839191  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3605  Zinc finger-domain-containing protein  32.43 
 
 		 1244 aa  42.4  0.01  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.188848  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>