51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_1855 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013173  Dbac_1855  MJ0042 family finger-like protein  100 
 
 		 383 aa  775    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0472  hypothetical protein  35.17 
 
 		 322 aa  174  2.9999999999999996e-42  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0337887 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0863  MJ0042 family finger-like protein  53.42 
 
 		 256 aa  156  5.0000000000000005e-37  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.305233 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2111  hypothetical protein  44.57 
 
 		 256 aa  148  2.0000000000000003e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0575068  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1544  Zinc finger-domain-containing protein  50.39 
 
 		 262 aa  143  4e-33  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.314739  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1439  MJ0042 family finger-like protein  46.22 
 
 		 239 aa  125  1e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2546  hypothetical protein  26.35 
 
 		 417 aa  113  5e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  3.73982e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3397  Zinc finger-domain-containing protein  35.23 
 
 		 560 aa  106  7e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000473344  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2497  MJ0042 family finger-like protein  29.05 
 
 		 707 aa  87.4  4e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2710  hypothetical protein  31.03 
 
 		 418 aa  84.3  0.000000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.253212  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0411  MJ0042 family finger-like protein  29.79 
 
 		 547 aa  83.6  0.000000000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.839191  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1751  MJ0042 family finger-like protein  28.1 
 
 		 694 aa  81.6  0.00000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000114935  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1032  Zinc finger/thioredoxin putative  30.59 
 
 		 501 aa  78.6  0.0000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000300649  hitchhiker  0.0000540788 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0024  Zinc finger-domain-containing protein  30.83 
 
 		 547 aa  66.6  0.0000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1424  Zinc finger-domain-containing protein  27.81 
 
 		 635 aa  60.1  0.00000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0877101  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2015  Zinc finger-domain-containing protein  43.06 
 
 		 538 aa  57.4  0.0000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2048  MJ0042 family finger-like protein  50.98 
 
 		 532 aa  55.8  0.000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.121287  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2118  MJ0042 family finger-like protein  50.98 
 
 		 530 aa  55.8  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.000277169  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1423  Zinc finger-domain-containing protein  24.12 
 
 		 248 aa  55.5  0.000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.328628  normal  0.281869 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3141  response regulator receiver protein  36.67 
 
 		 324 aa  54.7  0.000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0942  Zinc finger/thioredoxin putative  36.36 
 
 		 293 aa  54.3  0.000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1812  zinc finger/thioredoxin putative  52.78 
 
 		 531 aa  53.5  0.000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0136465  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0833  Zinc finger/thioredoxin putative  37.5 
 
 		 293 aa  53.1  0.000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0939857  normal  0.925505 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0454  MJ0042 family finger-like protein  44 
 
 		 1163 aa  52.8  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.75357  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0453  MJ0042 family finger-like protein  44 
 
 		 1144 aa  52.8  0.00001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.13216  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0995  MJ0042 family finger-like protein  48.65 
 
 		 597 aa  52.4  0.00001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.688512  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0935  zinc finger/thioredoxin putative  48.65 
 
 		 594 aa  52.8  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5219  MJ0042 family finger-like protein  38.57 
 
 		 298 aa  51.6  0.00002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.61677  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0425  zinc finger/thioredoxin putative  45 
 
 		 1139 aa  51.2  0.00003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1175  hypothetical protein  46.67 
 
 		 306 aa  50.8  0.00004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.757777 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0702  Zinc finger/thioredoxin putative  43.86 
 
 		 294 aa  50.4  0.00005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0976  Zinc finger-domain-containing protein  44.74 
 
 		 588 aa  50.1  0.00006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.470669  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3216  Zinc finger-domain-containing protein  47.22 
 
 		 308 aa  50.1  0.00006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.639596  normal  0.370858 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0992  MJ0042 family finger-like protein  45.95 
 
 		 593 aa  50.1  0.00006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.973925  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2979  Zinc finger-domain-containing protein  40.54 
 
 		 255 aa  49.7  0.0001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0278166  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4144  Zinc finger-domain-containing protein  37.14 
 
 		 1124 aa  48.9  0.0001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000494225 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0575  hypothetical protein  32.26 
 
 		 285 aa  49.3  0.0001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4868  Zinc finger/thioredoxin putative  40.98 
 
 		 306 aa  46.6  0.0007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.186444  normal  0.75995 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2373  Zinc finger-domain-containing protein  41.67 
 
 		 297 aa  46.2  0.001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.202349 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0666  Zinc finger/thioredoxin putative  45.71 
 
 		 284 aa  46.2  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.248868  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1155  MJ0042 family finger-like protein  40 
 
 		 237 aa  45.4  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.967228  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3253  hypothetical protein  37.14 
 
 		 361 aa  45.1  0.002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.2134  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3088  MJ0042 family finger-like protein  35.14 
 
 		 251 aa  44.7  0.003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.148898  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2982  MJ0042 family finger-like protein  35.14 
 
 		 244 aa  44.7  0.003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.739181  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2862  Zinc finger-domain-containing protein  35.14 
 
 		 273 aa  44.7  0.003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3310  zinc finger/thioredoxin putative  39.53 
 
 		 605 aa  44.7  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1839  MJ0042 family finger-like protein  38.46 
 
 		 986 aa  44.3  0.004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0213586  normal  0.108328 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2018  Zinc finger-domain-containing protein  38.33 
 
 		 319 aa  44.3  0.004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.574059  normal  0.668736 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3390  MJ0042 family finger-like protein  39.53 
 
 		 610 aa  43.9  0.005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0666747  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3936  hypothetical protein  36.73 
 
 		 357 aa  43.9  0.005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00733105  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0030  hypothetical protein  44.44 
 
 		 221 aa  42.7  0.01  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>