28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nwi_0575 on replicon NC_007406
Organism: Nitrobacter winogradskyi Nb-255



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007406  Nwi_0575  hypothetical protein  100 
 
 		 285 aa  584  1e-166  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0666  Zinc finger/thioredoxin putative  72.32 
 
 		 284 aa  401  1e-111  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.248868  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0833  Zinc finger/thioredoxin putative  51.67 
 
 		 293 aa  286  4e-76  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0939857  normal  0.925505 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0942  Zinc finger/thioredoxin putative  51.85 
 
 		 293 aa  275  6e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5219  MJ0042 family finger-like protein  49.34 
 
 		 298 aa  274  2.0000000000000002e-72  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.61677  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1175  hypothetical protein  49.51 
 
 		 306 aa  269  5e-71  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.757777 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4868  Zinc finger/thioredoxin putative  51.96 
 
 		 306 aa  261  8.999999999999999e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.186444  normal  0.75995 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1596  Zinc finger-domain-containing protein  30.24 
 
 		 318 aa  121  9.999999999999999e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.889508 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1155  MJ0042 family finger-like protein  28.16 
 
 		 237 aa  105  8e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.967228  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2979  Zinc finger-domain-containing protein  28.42 
 
 		 255 aa  94.4  2e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0278166  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3088  MJ0042 family finger-like protein  37.01 
 
 		 251 aa  90.5  2e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.148898  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3216  Zinc finger-domain-containing protein  24.82 
 
 		 308 aa  90.5  3e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.639596  normal  0.370858 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2862  Zinc finger-domain-containing protein  36.22 
 
 		 273 aa  88.6  1e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2982  MJ0042 family finger-like protein  39.83 
 
 		 244 aa  87.8  2e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.739181  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2196  Zinc finger-domain-containing protein  40.34 
 
 		 236 aa  81.6  0.00000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.676163  normal  0.693925 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2373  Zinc finger-domain-containing protein  30.71 
 
 		 297 aa  63.9  0.000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.202349 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3253  hypothetical protein  29.82 
 
 		 361 aa  49.7  0.00006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.2134  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1855  MJ0042 family finger-like protein  32.68 
 
 		 383 aa  49.3  0.00007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0702  Zinc finger/thioredoxin putative  48.57 
 
 		 294 aa  45.8  0.0008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3141  response regulator receiver protein  30.77 
 
 		 324 aa  44.3  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0479  Zinc finger/thioredoxin putative  42.86 
 
 		 274 aa  43.9  0.003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0057  zinc finger-like domain-containing protein  43.18 
 
 		 221 aa  43.9  0.003  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0713  hypothetical protein  34.88 
 
 		 142 aa  43.9  0.003  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0454  MJ0042 family finger-like protein  38 
 
 		 1163 aa  43.5  0.004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.75357  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0453  MJ0042 family finger-like protein  38 
 
 		 1144 aa  43.1  0.005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.13216  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0425  zinc finger/thioredoxin putative  40 
 
 		 1139 aa  43.1  0.005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3605  Zinc finger-domain-containing protein  37.84 
 
 		 1244 aa  42.4  0.008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.188848  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1423  Zinc finger-domain-containing protein  48.57 
 
 		 248 aa  42.4  0.01  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.328628  normal  0.281869 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>