30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_3216 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_3216  Zinc finger-domain-containing protein  100 
 
 
308 aa  616  1e-175  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.639596  normal  0.370858 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2373  Zinc finger-domain-containing protein  30.16 
 
 
297 aa  110  4.0000000000000004e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.202349 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1596  Zinc finger-domain-containing protein  28.4 
 
 
318 aa  96.7  5e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.889508 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0575  hypothetical protein  24.82 
 
 
285 aa  90.5  4e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0666  Zinc finger/thioredoxin putative  24.91 
 
 
284 aa  87.8  2e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.248868  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1175  hypothetical protein  25.64 
 
 
306 aa  85.5  0.000000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.757777 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2979  Zinc finger-domain-containing protein  28.46 
 
 
255 aa  78.6  0.0000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0278166  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5219  MJ0042 family finger-like protein  24.66 
 
 
298 aa  77.8  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.61677  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0942  Zinc finger/thioredoxin putative  24.3 
 
 
293 aa  72.4  0.000000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3088  MJ0042 family finger-like protein  25.98 
 
 
251 aa  70.5  0.00000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.148898  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2862  Zinc finger-domain-containing protein  25.82 
 
 
273 aa  70.5  0.00000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0833  Zinc finger/thioredoxin putative  23.59 
 
 
293 aa  68.9  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0939857  normal  0.925505 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0030  hypothetical protein  23.62 
 
 
221 aa  59.3  0.00000008  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4868  Zinc finger/thioredoxin putative  37.35 
 
 
306 aa  55.8  0.0000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.186444  normal  0.75995 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3253  hypothetical protein  47.83 
 
 
361 aa  53.1  0.000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.2134  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0057  zinc finger-like domain-containing protein  20.33 
 
 
221 aa  52.4  0.00001  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2982  MJ0042 family finger-like protein  44.9 
 
 
244 aa  52  0.00001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.739181  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2893  Zinc finger/thioredoxin putative  57.14 
 
 
254 aa  51.6  0.00002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0702  Zinc finger/thioredoxin putative  54.29 
 
 
294 aa  51.2  0.00002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1855  MJ0042 family finger-like protein  47.22 
 
 
383 aa  50.1  0.00005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1155  MJ0042 family finger-like protein  25 
 
 
237 aa  49.3  0.00008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.967228  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2018  Zinc finger-domain-containing protein  48.57 
 
 
319 aa  48.5  0.0002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.574059  normal  0.668736 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1032  Zinc finger/thioredoxin putative  45 
 
 
501 aa  47.8  0.0003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000300649  hitchhiker  0.0000540788 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0479  Zinc finger/thioredoxin putative  48.57 
 
 
274 aa  47  0.0004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2546  hypothetical protein  40 
 
 
417 aa  47  0.0005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  3.73982e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3057  MJ0042 family finger-like protein  48.57 
 
 
248 aa  45.4  0.001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2196  Zinc finger-domain-containing protein  48.57 
 
 
236 aa  44.3  0.003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.676163  normal  0.693925 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0024  Zinc finger-domain-containing protein  41.67 
 
 
547 aa  43.9  0.003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0411  MJ0042 family finger-like protein  37.5 
 
 
547 aa  43.5  0.004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.839191  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3397  Zinc finger-domain-containing protein  35 
 
 
560 aa  42.7  0.007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000473344  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>