34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_1155 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_1155  MJ0042 family finger-like protein  100 
 
 		 237 aa  453  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.967228  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2196  Zinc finger-domain-containing protein  71.31 
 
 		 236 aa  289  3e-77  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.676163  normal  0.693925 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3088  MJ0042 family finger-like protein  45.38 
 
 		 251 aa  172  2.9999999999999996e-42  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.148898  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2979  Zinc finger-domain-containing protein  44.67 
 
 		 255 aa  167  1e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0278166  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2982  MJ0042 family finger-like protein  47.44 
 
 		 244 aa  166  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.739181  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2862  Zinc finger-domain-containing protein  44.96 
 
 		 273 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0575  hypothetical protein  28.16 
 
 		 285 aa  114  1.0000000000000001e-24  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5219  MJ0042 family finger-like protein  31.49 
 
 		 298 aa  102  6e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.61677  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0666  Zinc finger/thioredoxin putative  39.29 
 
 		 284 aa  90.5  2e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.248868  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1175  hypothetical protein  38.82 
 
 		 306 aa  86.3  3e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.757777 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4868  Zinc finger/thioredoxin putative  37.8 
 
 		 306 aa  85.5  7e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.186444  normal  0.75995 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0942  Zinc finger/thioredoxin putative  38.1 
 
 		 293 aa  81.3  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0833  Zinc finger/thioredoxin putative  37.59 
 
 		 293 aa  80.5  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0939857  normal  0.925505 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1596  Zinc finger-domain-containing protein  37.78 
 
 		 318 aa  79.3  0.00000000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.889508 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2373  Zinc finger-domain-containing protein  31.96 
 
 		 297 aa  67.8  0.0000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.202349 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3216  Zinc finger-domain-containing protein  24.59 
 
 		 308 aa  53.5  0.000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.639596  normal  0.370858 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0453  MJ0042 family finger-like protein  35.38 
 
 		 1144 aa  50.8  0.00002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.13216  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0454  MJ0042 family finger-like protein  35.38 
 
 		 1163 aa  50.8  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.75357  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2386  Zinc finger-domain-containing protein  47.22 
 
 		 368 aa  49.7  0.00004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.814986  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0732  hypothetical protein  47.22 
 
 		 304 aa  49.7  0.00005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.738577  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0057  zinc finger-like domain-containing protein  17.26 
 
 		 221 aa  48.9  0.00006  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0030  hypothetical protein  21.13 
 
 		 221 aa  48.1  0.0001  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2450  Zinc finger-domain-containing protein  44.44 
 
 		 256 aa  47.8  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.761228  normal  0.24393 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2893  Zinc finger/thioredoxin putative  52.78 
 
 		 254 aa  48.1  0.0001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0702  Zinc finger/thioredoxin putative  47.5 
 
 		 294 aa  47.4  0.0002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3253  hypothetical protein  48.78 
 
 		 361 aa  47  0.0003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.2134  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0713  hypothetical protein  42.86 
 
 		 142 aa  46.6  0.0004  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0479  Zinc finger/thioredoxin putative  37.5 
 
 		 274 aa  45.8  0.0005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1855  MJ0042 family finger-like protein  40 
 
 		 383 aa  45.4  0.0007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3141  response regulator receiver protein  44.74 
 
 		 324 aa  45.4  0.0008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0425  zinc finger/thioredoxin putative  39.53 
 
 		 1139 aa  44.3  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3497  Zinc finger/thioredoxin putative  38.89 
 
 		 304 aa  43.1  0.003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.557897 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3605  Zinc finger-domain-containing protein  34.21 
 
 		 1244 aa  42.7  0.005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.188848  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3371  Zinc finger-domain-containing protein  45.16 
 
 		 571 aa  41.6  0.01  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>