More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_3141 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_3141  response regulator receiver protein  100 
 
 		 324 aa  659    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2217  response regulator  41.21 
 
 		 316 aa  256  4e-67  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0760  response regulator receiver protein  54.55 
 
 		 367 aa  239  5e-62  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0668721 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0745  response regulator receiver protein  54.11 
 
 		 375 aa  238  1e-61  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0627  response regulator receiver protein  34.13 
 
 		 163 aa  78.2  0.0000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.143116  hitchhiker  0.00307044 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0436  response regulator receiver protein  35.45 
 
 		 370 aa  77.4  0.0000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0221  response regulator PleD  32.2 
 
 		 460 aa  76.6  0.0000000000005  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0987  response regulator receiver protein  30 
 
 		 414 aa  76.6  0.0000000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.332272 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0918  response regulator receiver protein  36.08 
 
 		 458 aa  75.5  0.000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0873  response regulator receiver domain-containing protein  36.08 
 
 		 483 aa  75.1  0.000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0633299  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0922  response regulator receiver protein  36.08 
 
 		 459 aa  75.1  0.000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2427  two component LuxR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 245 aa  73.6  0.000000000004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.27075  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0171  two component LuxR family transcriptional regulator  29.27 
 
 		 242 aa  73.6  0.000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2649  response regulator receiver protein  36.19 
 
 		 122 aa  73.2  0.000000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.857048  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01891  two-component response regulator  29.27 
 
 		 242 aa  73.2  0.000000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.991625  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1149  response regulator receiver protein  34.17 
 
 		 130 aa  73.2  0.000000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1331  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.86 
 
 		 576 aa  73.2  0.000000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1061  response regulator receiver protein  26.79 
 
 		 427 aa  73.2  0.000000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.609626  hitchhiker  0.0000494803 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3778  response regulator receiver domain-containing protein  36.19 
 
 		 124 aa  72.4  0.00000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0702  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  34.62 
 
 		 331 aa  72  0.00000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.140022  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0695  response regulator receiver  33.59 
 
 		 170 aa  72.4  0.00000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.412637  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5113  response regulator receiver protein  33.05 
 
 		 121 aa  72  0.00000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0930  response regulator receiver protein  30.1 
 
 		 456 aa  72  0.00000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.139996  normal  0.100238 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2107  two component LuxR family transcriptional regulator  30.08 
 
 		 245 aa  71.2  0.00000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3728  response regulator receiver protein  31.97 
 
 		 128 aa  71.2  0.00000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.445342 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2752  multi-component transcriptional regulator, winged helix family  26.35 
 
 		 799 aa  70.9  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1556  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  38.61 
 
 		 300 aa  70.1  0.00000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3134  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.25 
 
 		 500 aa  70.1  0.00000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.952243  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0359  CheA signal transduction histidine kinases  34.68 
 
 		 1834 aa  70.5  0.00000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.505566  normal  0.609353 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01981  two-component response regulator  29.27 
 
 		 242 aa  70.5  0.00000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.125891  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1003  response regulator receiver protein  31.15 
 
 		 128 aa  70.1  0.00000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01871  two-component response regulator  27.64 
 
 		 242 aa  70.1  0.00000000005  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.528311  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1220  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.45 
 
 		 233 aa  69.7  0.00000000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00991602 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2180  response regulator receiver  26.92 
 
 		 151 aa  69.7  0.00000000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.269305  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0163  multi-component transcriptional regulator  30 
 
 		 725 aa  69.7  0.00000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.892768  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1562  response regulator receiver Signal transduction histidine kinase  31.93 
 
 		 369 aa  69.7  0.00000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.847548  normal  0.236297 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1632  response regulator receiver  33.06 
 
 		 123 aa  69.3  0.00000000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2427  response regulator receiver protein  31.58 
 
 		 159 aa  69.3  0.00000000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.468058 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1501  response regulator receiver protein  27.34 
 
 		 132 aa  68.9  0.0000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.153095  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0304  response regulator PleD  31.73 
 
 		 458 aa  68.9  0.0000000001  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0864091  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0399  two component transcriptional regulator  30.3 
 
 		 272 aa  68.9  0.0000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.802217  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0493  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  28.1 
 
 		 440 aa  68.9  0.0000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.274957  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2951  two component transcriptional regulator  32.81 
 
 		 236 aa  68.9  0.0000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2570  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  31.88 
 
 		 381 aa  68.6  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2107  two component transcriptional regulator, AraC family  28.57 
 
 		 1349 aa  68.6  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.000288147  normal  0.419692 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0508  response regulator receiver domain-containing protein  30.83 
 
 		 121 aa  67.8  0.0000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.481314  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3637  response regulator receiver  34.26 
 
 		 225 aa  68.2  0.0000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.135674  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1802  two component transcriptional regulator, winged helix family  33.09 
 
 		 232 aa  67.8  0.0000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.150286  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0367  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.73 
 
 		 503 aa  68.6  0.0000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0540164 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13275  two component system sensor transduction transcriptional regulatory protein mtrA  34.26 
 
 		 228 aa  67.8  0.0000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.656178 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2152  putative response regulator, putative serine phosphatase  34.15 
 
 		 434 aa  68.6  0.0000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3747  response regulator receiver protein  29.75 
 
 		 121 aa  68.2  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19400  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  28.22 
 
 		 279 aa  68.6  0.0000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0470356  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1537  two component LuxR family transcriptional regulator  29.27 
 
 		 242 aa  67.4  0.0000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0238  multi-component transcriptional regulator  26.04 
 
 		 1629 aa  67.8  0.0000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4952  response regulator receiver protein  30 
 
 		 121 aa  67.8  0.0000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.699568  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3248  response regulator receiver protein  28.57 
 
 		 121 aa  67.4  0.0000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.500247 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0669  response regulator receiver protein  37.14 
 
 		 123 aa  67.4  0.0000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09580  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  30.81 
 
 		 244 aa  67  0.0000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.132168 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0855  response regulator receiver domain-containing protein  28.35 
 
 		 417 aa  67  0.0000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00541919 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4555  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  30.25 
 
 		 406 aa  67  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.330139  normal  0.677797 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0804  two component LuxR family transcriptional regulator  29.49 
 
 		 204 aa  67  0.0000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2199  response regulator receiver/SARP domain-containing protein  29.57 
 
 		 344 aa  67  0.0000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.425276 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1487  response regulator receiver protein  26.49 
 
 		 499 aa  67  0.0000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.10241 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02441  two-component response regulator  29.27 
 
 		 242 aa  67  0.0000000004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.72299  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20650  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  33.04 
 
 		 231 aa  66.6  0.0000000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0260682  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0773  response regulator PleD  30.77 
 
 		 458 aa  66.6  0.0000000005  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2155  CheA signal transduction histidine kinase  26.86 
 
 		 1609 aa  66.6  0.0000000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2544  DNA binding domain protein, excisionase family  30.83 
 
 		 264 aa  67  0.0000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0361834  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2309  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  33.98 
 
 		 434 aa  66.6  0.0000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.484645  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0751  response regulator receiver protein  28.81 
 
 		 121 aa  66.6  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0355  response regulator receiver protein  26.23 
 
 		 161 aa  66.6  0.0000000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.384709  normal  0.97064 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2397  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  33.98 
 
 		 434 aa  66.6  0.0000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.593336  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0722  response regulator receiver protein  28.81 
 
 		 121 aa  66.6  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0488  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.58 
 
 		 235 aa  66.2  0.0000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00220414 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4015  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  29.36 
 
 		 315 aa  66.2  0.0000000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1011  two component transcriptional regulator, winged helix family  29.82 
 
 		 231 aa  66.2  0.0000000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4207  response regulator receiver protein  33.65 
 
 		 120 aa  66.2  0.0000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.771701  normal  0.140814 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0391  response regulator receiver (CheY-like) modulated CheW protein  32.52 
 
 		 318 aa  66.2  0.0000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1394  two component transcriptional regulator  37 
 
 		 236 aa  65.9  0.0000000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000024965  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4712  two component transcriptional regulator  32.41 
 
 		 228 aa  65.1  0.000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.541483  normal  0.0134498 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1381  two component transcriptional regulator  32.41 
 
 		 228 aa  65.1  0.000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.497022 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0494  CheA signal transduction histidine kinases  33.88 
 
 		 798 aa  65.1  0.000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2486  response regulator receiver protein  29.91 
 
 		 385 aa  65.5  0.000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1849  response regulator receiver protein  27.5 
 
 		 263 aa  65.9  0.000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.468098  normal  0.46427 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1347  two component transcriptional regulator  32.41 
 
 		 228 aa  65.1  0.000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5389  histidine kinase  22.9 
 
 		 1414 aa  65.5  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.157534 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1365  two component transcriptional regulator  32.41 
 
 		 228 aa  65.1  0.000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1752  two component transcriptional regulator  32.41 
 
 		 228 aa  65.1  0.000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.581522 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6310  two component transcriptional regulator, winged helix family  31.75 
 
 		 261 aa  65.5  0.000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.534044  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01871  two-component response regulator  29.27 
 
 		 242 aa  65.1  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1474  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  32.04 
 
 		 345 aa  64.7  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0476  CheA signal transduction histidine kinase  30.95 
 
 		 1629 aa  64.7  0.000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1798  response regulator receiver protein  26.05 
 
 		 421 aa  64.7  0.000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0425033  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2360  response regulator receiver protein  29.03 
 
 		 523 aa  65.1  0.000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0962  response regulator receiver protein  29.09 
 
 		 304 aa  65.1  0.000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.512477  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1849  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.62 
 
 		 229 aa  65.1  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13280  two component transcriptional regulator, winged helix family  31.36 
 
 		 227 aa  64.3  0.000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000536961  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0713  response regulator receiver protein  29.91 
 
 		 321 aa  64.7  0.000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1237  two component transcriptional regulator, winged helix family  33.62 
 
 		 234 aa  64.7  0.000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.178035  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>