24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_0732 on replicon NC_007493
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007493  RSP_0732  hypothetical protein  100 
 
 		 304 aa  567  1e-160  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.738577  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2386  Zinc finger-domain-containing protein  86.67 
 
 		 368 aa  382  1e-105  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.814986  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2450  Zinc finger-domain-containing protein  77.42 
 
 		 256 aa  100  3e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.761228  normal  0.24393 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3057  MJ0042 family finger-like protein  79.49 
 
 		 248 aa  79.7  0.00000000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3497  Zinc finger/thioredoxin putative  75.68 
 
 		 304 aa  71.6  0.00000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.557897 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0479  Zinc finger/thioredoxin putative  64.86 
 
 		 274 aa  66.2  0.0000000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2018  Zinc finger-domain-containing protein  62.16 
 
 		 319 aa  61.2  0.00000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.574059  normal  0.668736 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2893  Zinc finger/thioredoxin putative  55.26 
 
 		 254 aa  53.1  0.000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1155  MJ0042 family finger-like protein  47.22 
 
 		 237 aa  49.3  0.00008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.967228  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1596  Zinc finger-domain-containing protein  43.59 
 
 		 318 aa  49.3  0.00008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.889508 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0702  Zinc finger/thioredoxin putative  47.37 
 
 		 294 aa  48.5  0.0001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4341  Zinc finger-domain-containing protein  41.86 
 
 		 479 aa  48.5  0.0001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.75184  normal  0.874697 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0057  zinc finger-like domain-containing protein  41.03 
 
 		 221 aa  47  0.0004  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2015  Zinc finger-domain-containing protein  34.57 
 
 		 538 aa  45.8  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3390  MJ0042 family finger-like protein  45.45 
 
 		 610 aa  45.1  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0666747  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3371  Zinc finger-domain-containing protein  46.88 
 
 		 571 aa  45.4  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3310  zinc finger/thioredoxin putative  45.45 
 
 		 605 aa  45.4  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3605  Zinc finger-domain-containing protein  40.54 
 
 		 1244 aa  45.1  0.001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.188848  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0833  Zinc finger/thioredoxin putative  33.9 
 
 		 293 aa  44.3  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0939857  normal  0.925505 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0030  hypothetical protein  42.86 
 
 		 221 aa  44.7  0.002  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3253  hypothetical protein  42.86 
 
 		 361 aa  45.1  0.002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.2134  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2196  Zinc finger-domain-containing protein  38.46 
 
 		 236 aa  43.9  0.003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.676163  normal  0.693925 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2979  Zinc finger-domain-containing protein  32.56 
 
 		 255 aa  43.5  0.004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0278166  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0942  Zinc finger/thioredoxin putative  32.61 
 
 		 293 aa  42.7  0.008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>