29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_0992 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011891  A2cp1_0992  MJ0042 family finger-like protein  100 
 
 
593 aa  1058    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.973925  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0995  MJ0042 family finger-like protein  94.81 
 
 
597 aa  642    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.688512  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0935  zinc finger/thioredoxin putative  82.17 
 
 
594 aa  589  1e-167  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0976  Zinc finger-domain-containing protein  37.37 
 
 
588 aa  89  2e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.470669  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1032  Zinc finger/thioredoxin putative  48.72 
 
 
501 aa  59.3  0.0000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000300649  hitchhiker  0.0000540788 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1855  MJ0042 family finger-like protein  38.1 
 
 
383 aa  57  0.0000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2546  hypothetical protein  31.82 
 
 
417 aa  57  0.000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  3.73982e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2497  MJ0042 family finger-like protein  54.29 
 
 
707 aa  55.8  0.000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3397  Zinc finger-domain-containing protein  48.72 
 
 
560 aa  55.8  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000473344  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1751  MJ0042 family finger-like protein  54.29 
 
 
694 aa  55.5  0.000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000114935  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3310  zinc finger/thioredoxin putative  51.28 
 
 
605 aa  55.1  0.000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3371  Zinc finger-domain-containing protein  51.28 
 
 
571 aa  53.9  0.000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0454  MJ0042 family finger-like protein  45.83 
 
 
1163 aa  53.9  0.000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.75357  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3390  MJ0042 family finger-like protein  51.28 
 
 
610 aa  53.9  0.000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0666747  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3141  response regulator receiver protein  45.16 
 
 
324 aa  53.1  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0453  MJ0042 family finger-like protein  45.83 
 
 
1144 aa  53.5  0.00001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.13216  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1424  Zinc finger-domain-containing protein  51.43 
 
 
635 aa  52.4  0.00002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0877101  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0425  zinc finger/thioredoxin putative  48.78 
 
 
1139 aa  52  0.00003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2710  hypothetical protein  24.26 
 
 
418 aa  47  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.253212  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0602  Zinc finger-domain-containing protein  25.78 
 
 
466 aa  45.1  0.003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0119  Zinc finger/thioredoxin putative  25.78 
 
 
466 aa  45.1  0.003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2196  Zinc finger-domain-containing protein  36.51 
 
 
236 aa  44.7  0.005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.676163  normal  0.693925 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0571  Zinc finger-domain-containing protein  33.33 
 
 
460 aa  44.3  0.006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000224872 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2782  Zinc finger-domain-containing protein  32.35 
 
 
479 aa  44.3  0.007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3685  hypothetical protein  33.33 
 
 
456 aa  43.9  0.007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.738999  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3636  Zinc finger-domain-containing protein  42.86 
 
 
445 aa  44.3  0.007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.45648  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2946  MJ0042 family finger-like protein  42.86 
 
 
445 aa  44.3  0.007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4694  Zinc finger-domain-containing protein  40 
 
 
451 aa  43.9  0.008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.725918  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4819  Zinc finger-domain-containing protein  40 
 
 
451 aa  43.9  0.008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>