46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_4570 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_4570  hypothetical protein  100 
 
 		 135 aa  278  3e-74  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1427  decaheme cytochrome c  95.38 
 
 		 318 aa  134  4e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3675  cytochrome C family protein  53.85 
 
 		 315 aa  77.8  0.00000000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0268  cytochrome C family protein  53.85 
 
 		 314 aa  77.4  0.00000000000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3130  cytochrome C family protein  56.67 
 
 		 317 aa  67.4  0.00000000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.849943  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0352  cytochrome c family protein  55 
 
 		 317 aa  64.3  0.0000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.101331 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0231  cytochrome C family protein  50 
 
 		 316 aa  63.9  0.0000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2820  cytochrome C family protein  53.57 
 
 		 312 aa  62.8  0.000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0227  cytochrome c family protein  47.62 
 
 		 316 aa  62.4  0.000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2519  cytochrome C family protein  54.9 
 
 		 322 aa  61.2  0.000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.589751  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2579  cytochrome C family protein  45.71 
 
 		 329 aa  59.7  0.00000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.069167  normal  0.0206665 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1611  cytochrome C family protein  50 
 
 		 333 aa  59.3  0.00000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.173927  normal  0.248798 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1577  cytochrome C family protein  50 
 
 		 333 aa  59.3  0.00000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000354628  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1588  cytochrome C family protein  50 
 
 		 333 aa  59.3  0.00000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00373932  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1777  decaheme cytochrome c MtrA  48.28 
 
 		 333 aa  58.5  0.00000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2511  cytochrome C family protein  44.29 
 
 		 329 aa  58.2  0.00000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.115309  hitchhiker  0.00672893 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2677  cytochrome C family protein  44.29 
 
 		 329 aa  58.2  0.00000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.376662  normal  0.0163011 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2766  cytochrome C family protein  48.28 
 
 		 333 aa  57.4  0.00000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0218266  hitchhiker  0.000000422231 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2692  cytochrome C family protein  38.55 
 
 		 319 aa  55.8  0.0000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3686  cytochrome C family protein  43.86 
 
 		 314 aa  54.3  0.0000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2699  cytochrome C family protein  45.45 
 
 		 328 aa  53.5  0.0000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.840713  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1524  cytochrome c family protein  46.67 
 
 		 333 aa  53.5  0.0000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.462693  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003777  decaheme cytochrome c MtrA  41.79 
 
 		 326 aa  53.1  0.000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3126  cytochrome C family protein  46.67 
 
 		 333 aa  53.5  0.000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00631921  hitchhiker  0.0000243395 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1530  cytochrome c family protein  34.48 
 
 		 321 aa  53.1  0.000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.892773  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2672  cytochrome C family protein  43.28 
 
 		 321 aa  52.4  0.000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.655979  normal  0.0486911 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1593  cytochrome C family protein  39.71 
 
 		 321 aa  52.4  0.000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000481816  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2925  cytochrome c family protein  39.34 
 
 		 315 aa  52.8  0.000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1582  cytochrome C family protein  39.71 
 
 		 321 aa  52  0.000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000911408  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1616  cytochrome C family protein  39.71 
 
 		 321 aa  52  0.000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.093642  normal  0.713619 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1402  cytochrome c family protein  40 
 
 		 316 aa  51.6  0.000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2761  cytochrome C family protein  47.37 
 
 		 319 aa  51.6  0.000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.309572  hitchhiker  0.000367908 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2638  cytochrome C family protein  51.02 
 
 		 329 aa  51.2  0.000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.838087  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1477  cytochrome C family protein  40.85 
 
 		 334 aa  50.8  0.000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000779097  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2506  cytochrome C family protein  41.79 
 
 		 321 aa  50.4  0.000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.365224  hitchhiker  0.00105775 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2574  cytochrome C family protein  41.79 
 
 		 321 aa  50.4  0.000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.448859  hitchhiker  0.00699839 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3859  cytochrome C family protein  39.34 
 
 		 287 aa  50.1  0.000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00158078  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1207  decaheme cytochrome c MtrA  43.28 
 
 		 326 aa  50.4  0.000009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0298799  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1782  decaheme cytochrome c MtrD  49.02 
 
 		 306 aa  49.7  0.00001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1213  decaheme cytochrome c MtrD  68.97 
 
 		 318 aa  49.7  0.00001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.766107  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2526  cytochrome C family protein  41.54 
 
 		 329 aa  48.1  0.00004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2230  cytochrome C family protein  36.84 
 
 		 309 aa  46.6  0.0001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0468166  decreased coverage  0.000802637 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0361  decaheme cytochrome c MtrA  60.71 
 
 		 286 aa  44.7  0.0004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.162857  hitchhiker  0.000223849 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1305  cytochrome c family protein  48.89 
 
 		 310 aa  43.1  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000952698 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4360  decaheme cytochrome c  36.92 
 
 		 304 aa  42  0.003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2149  cytochrome c family protein  66.67 
 
 		 304 aa  41.6  0.004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0950345  normal  0.491991 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>