95 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A3383 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A3383  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiG protein  100 
 
 		 464 aa  896    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.538003  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3235  hypothetical protein  42.53 
 
 		 305 aa  192  8e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.658837 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2455  putative molybdopterin-guanine dinucleotide biosynthesis protein MobB/unknown domain fusion protein  42.47 
 
 		 452 aa  174  2.9999999999999996e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0879303  normal  0.577866 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0172  precorrin-8X methylmutase  42.76 
 
 		 512 aa  171  2e-41  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00890226  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2639  precorrin isomerase  41.98 
 
 		 499 aa  171  3e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0523957  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2391  putative molybdopterin-guanine dinucleotide biosynthesis protein MobB/unknown domain fusion protein  40.41 
 
 		 452 aa  167  4e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0737  putative molybdopterin-guanine dinucleotide biosynthesis protein MobB/unknown domain fusion protein  40.41 
 
 		 452 aa  167  4e-40  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0463  hypothetical protein  39.37 
 
 		 277 aa  132  1.0000000000000001e-29  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.842135  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0232  hypothetical protein  29.7 
 
 		 336 aa  132  2.0000000000000002e-29  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2636  precorrin-3B C17-methyltransferase  45.19 
 
 		 612 aa  111  3e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.168127  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3752  hypothetical protein  37.5 
 
 		 270 aa  110  5e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1747  putative cobalamin biosynthesis protein  47.93 
 
 		 145 aa  104  3e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.161178 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2368  putative precorrin-3B C17-methyltransferase protein  49.6 
 
 		 143 aa  90.9  4e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.450162  normal  0.0563077 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2126  precorrin-3B C17-methyltransferase protein  44.8 
 
 		 139 aa  88.2  3e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.66936  normal  0.0232718 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3373  cobalamin biosynthesis protein CbiG  35.71 
 
 		 258 aa  84.3  0.000000000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.143651 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25930  hypothetical protein  45.8 
 
 		 142 aa  82.4  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00192848  normal  0.0649917 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1264  putative precorrin-3B C17-methyltransferase  50 
 
 		 131 aa  79.3  0.0000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2778  cobalamin biosynthesis protein CobE  41.09 
 
 		 137 aa  79.7  0.0000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.43283  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1301  precorrin-3B C17-methyltransferase, putative  50 
 
 		 131 aa  79.3  0.0000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0643  precorrin-3 methyltransferase  43.75 
 
 		 561 aa  72.8  0.00000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0184568  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2214  hypothetical protein  44.7 
 
 		 142 aa  72.8  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.693941  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3019  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiG protein  38.28 
 
 		 149 aa  70.9  0.00000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.108721  normal  0.148561 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1882  precorrin-3B C17-methyltransferase, putative  55.29 
 
 		 137 aa  70.9  0.00000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.809661  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0040  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiG protein  30.18 
 
 		 353 aa  69.7  0.0000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2084  cobalamin biosynthesis protein CbiG-like protein  36.36 
 
 		 508 aa  68.2  0.0000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0211  cobalamin biosynthesis protein CbiG/precorrin-4 C11-methyltransferase  34.78 
 
 		 614 aa  66.6  0.0000000009  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3230  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiG protein  31.19 
 
 		 357 aa  65.9  0.000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.106675  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3540  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiG protein  38.28 
 
 		 347 aa  65.9  0.000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0175  precorrin-3B C17-methyltransferase  47.24 
 
 		 601 aa  64.7  0.000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.120567  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17041  bifunctional cbiH protein and precorrin-3B C17-methyltransferase  30.66 
 
 		 604 aa  63.9  0.000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1997  precorrin-3B C17-methyltransferase region  38.94 
 
 		 537 aa  63.9  0.000000006  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0124664  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1251  hypothetical protein  39.55 
 
 		 286 aa  63.9  0.000000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.294808  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4477  precorrin-4 C11-methyltransferase  31.48 
 
 		 610 aa  63.2  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00717843  normal  0.120162 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2702  precorrin-3B C17-methyltransferase  41.6 
 
 		 574 aa  62.4  0.00000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000152397 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1617  precorrin-3 methyltransferase  31.86 
 
 		 606 aa  62  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.481163  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3606  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiG protein  37.4 
 
 		 347 aa  62.4  0.00000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2993  cobalamin biosynthesis protein CbiG, putative  29.47 
 
 		 351 aa  61.2  0.00000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1377  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiG protein  27.27 
 
 		 351 aa  60.8  0.00000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0484  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiG protein  35.94 
 
 		 351 aa  60.5  0.00000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17171  bifunctional cbiH protein and precorrin-3B C17-methyltransferase  31.86 
 
 		 600 aa  59.7  0.00000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1558  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiG protein  28.32 
 
 		 357 aa  59.3  0.0000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16381  bifunctional cbiH protein and precorrin-3B C18-methyltransferace  34.09 
 
 		 620 aa  59.3  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1093  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiG protein  39.23 
 
 		 365 aa  59.7  0.0000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0572  precorrin-3B C17-methyltransferase  36.72 
 
 		 800 aa  59.7  0.0000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19561  bifunctional cbiH protein and precorrin-3B C17-methyltransferase  30.97 
 
 		 593 aa  58.9  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1288  precorrin-4 C11-methyltransferase  35.45 
 
 		 626 aa  58.5  0.0000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0844  hypothetical protein  28.28 
 
 		 262 aa  58.5  0.0000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.322943 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0314  cobalamin biosynthesis protein CbiG  29.27 
 
 		 349 aa  58.2  0.0000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17291  bifunctional cbiH protein and precorrin-3B C17-methyltransferase  29.01 
 
 		 600 aa  58.2  0.0000004  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.792145  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2608  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiG protein  29.03 
 
 		 399 aa  57.4  0.0000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0934  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiG protein  28 
 
 		 425 aa  57  0.0000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00611922 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1081  precorrin-3 methyltransferase  30.09 
 
 		 593 aa  57.4  0.0000006  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2531  cobalamin biosynthesis protein CobE  35.23 
 
 		 128 aa  56.6  0.0000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.573883  hitchhiker  0.00728118 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6033  precorrin-3B C17-methyltransferase  38.66 
 
 		 810 aa  55.8  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.038685  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4366  precorrin-3 methyltransferase  31.25 
 
 		 663 aa  56.6  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.216409 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3628  precorrin-3B C17-methyltransferase  31.88 
 
 		 623 aa  55.8  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0379  precorrin-3B C17-methyltransferase  27.38 
 
 		 631 aa  55.8  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2485  precorrin-3B C17-methyltransferase  31.88 
 
 		 623 aa  55.8  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1295  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiG protein  32.31 
 
 		 368 aa  55.5  0.000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0452493 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2353  hypothetical protein  37.5 
 
 		 128 aa  55.5  0.000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1718  precorrin-4 C11-methyltransferase  33.07 
 
 		 598 aa  55.1  0.000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.956767  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3102  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiG protein  36.51 
 
 		 137 aa  55.1  0.000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3151  putative CobE protein  35.25 
 
 		 134 aa  54.7  0.000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.409186  normal  0.274603 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2520  precorrin-3B C17-methyltransferase  41.59 
 
 		 577 aa  53.1  0.000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3155  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiG protein  36.61 
 
 		 144 aa  53.1  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.418613  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1429  cobalamin biosynthesis protein CbiG  26.98 
 
 		 332 aa  52.8  0.00001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00979138  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4162  precorrin-4 C11-methyltransferase  36.84 
 
 		 958 aa  52.8  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.329616  normal  0.542159 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3409  cobalamin biosynthesis protein cobE, putative  36.36 
 
 		 129 aa  52.8  0.00001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.34231 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1264  precorrin-3B C17-methyltransferase  36.3 
 
 		 778 aa  52.4  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0935  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiG protein  33.58 
 
 		 350 aa  51.6  0.00003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4588  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiG protein  35.54 
 
 		 142 aa  50.8  0.00004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.0000406351  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1715  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiG protein  27.84 
 
 		 351 aa  50.8  0.00005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1299  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiG protein  25.2 
 
 		 379 aa  50.4  0.00006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0802  precorrin-3B C17-methyltransferase  37.01 
 
 		 547 aa  50.1  0.00009  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0804272  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0637  precorrin-3B C17-methyltransferase  33.81 
 
 		 837 aa  49.7  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.647433 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21210  precorrin-4 C11-methyltransferase  31.17 
 
 		 867 aa  49.3  0.0001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1345  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiG protein  36.72 
 
 		 132 aa  49.3  0.0002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.49198  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3129  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiG protein  36.13 
 
 		 132 aa  48.9  0.0002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1014  precorrin-4 C11-methyltransferase  33.96 
 
 		 626 aa  48.5  0.0002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3475  cobalamin biosynthesis protein CbiG  30.89 
 
 		 335 aa  48.9  0.0002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4089  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiG protein  28.85 
 
 		 141 aa  48.1  0.0003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1235  cobalamin biosynthesis protein CbiG  25.4 
 
 		 284 aa  47.8  0.0004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1273  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiG protein  30.16 
 
 		 340 aa  47  0.0006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2501  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiG protein  34.62 
 
 		 427 aa  47  0.0007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0472  cobalamin biosynthesis protein CbiG  34.43 
 
 		 276 aa  46.6  0.0009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23501  bifunctional cbiH protein and precorrin-3B C17-methyltransferase  42.98 
 
 		 594 aa  46.6  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.659645 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3261  putative CobE protein  38.67 
 
 		 127 aa  45.4  0.002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.175493 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2356  cobalamin biosynthesis protein CbiG  38.74 
 
 		 264 aa  45.4  0.002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.194675  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3649  cobalamin biosynthesis protein CbiG  33.61 
 
 		 259 aa  45.1  0.003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0291  cobalamin biosynthesis protein CbiG  30.99 
 
 		 319 aa  45.1  0.003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.539865  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1317  precorrin-3B C17-methyltransferase  43.48 
 
 		 611 aa  45.1  0.003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.161327  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3514  putative CobE protein  29.84 
 
 		 125 aa  44.7  0.004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.374002 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0329  precorrin-3 methyltransferase  34.51 
 
 		 579 aa  44.3  0.005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.189951 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0343  methyltransferase type 12  30.04 
 
 		 575 aa  43.5  0.007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0113  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiG protein  27.78 
 
 		 329 aa  43.5  0.008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.205342  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>