51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_3261 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_3261  putative CobE protein  100 
 
 		 127 aa  243  9e-64  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.175493 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3514  putative CobE protein  53.28 
 
 		 125 aa  119  1.9999999999999998e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.374002 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3151  putative CobE protein  42.74 
 
 		 134 aa  81.3  0.000000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.409186  normal  0.274603 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2636  precorrin-3B C17-methyltransferase  35.54 
 
 		 612 aa  60.1  0.000000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.168127  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1747  putative cobalamin biosynthesis protein  35.54 
 
 		 145 aa  57.4  0.00000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.161178 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2156  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiG protein  44.72 
 
 		 184 aa  57  0.00000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0631744  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1035  putative CobE protein  44.26 
 
 		 135 aa  54.3  0.0000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.166379 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3279  cobalamin biosynthesis protein G cbiG  54.76 
 
 		 129 aa  53.9  0.0000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0511  cobalamin biosynthesis protein CbiG  38.66 
 
 		 290 aa  53.9  0.0000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5686  putative CobE protein  40.8 
 
 		 122 aa  52.4  0.000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.215685  normal  1 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3649  cobalamin biosynthesis protein CbiG  33.33 
 
 		 259 aa  52.4  0.000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2778  cobalamin biosynthesis protein CobE  34.68 
 
 		 137 aa  50.8  0.000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.43283  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3606  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiG protein  33.06 
 
 		 347 aa  50.8  0.000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3540  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiG protein  34.68 
 
 		 347 aa  50.4  0.000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3212  cobalamin biosynthesis protein CbiG  30.58 
 
 		 290 aa  49.7  0.00001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3373  cobalamin biosynthesis protein CbiG  29.03 
 
 		 258 aa  50.1  0.00001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.143651 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16381  bifunctional cbiH protein and precorrin-3B C18-methyltransferace  31.53 
 
 		 620 aa  48.9  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2353  hypothetical protein  40.79 
 
 		 128 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4588  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiG protein  33.87 
 
 		 142 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.0000406351  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1093  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiG protein  36.67 
 
 		 365 aa  47.8  0.00006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3230  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiG protein  31.97 
 
 		 357 aa  47.4  0.00007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.106675  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0643  precorrin-3 methyltransferase  38.84 
 
 		 561 aa  46.6  0.0001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0184568  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3383  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiG protein  37.7 
 
 		 464 aa  46.2  0.0001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.538003  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6033  precorrin-3B C17-methyltransferase  38.14 
 
 		 810 aa  46.6  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.038685  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0935  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiG protein  33.33 
 
 		 350 aa  46.2  0.0001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2531  cobalamin biosynthesis protein CobE  33.88 
 
 		 128 aa  46.2  0.0001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.573883  hitchhiker  0.00728118 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4162  precorrin-4 C11-methyltransferase  32.48 
 
 		 958 aa  47  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.329616  normal  0.542159 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0807  putative cobalamin biosynthesis protein  41.6 
 
 		 142 aa  45.8  0.0002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2084  cobalamin biosynthesis protein CbiG-like protein  33.33 
 
 		 508 aa  45.8  0.0002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0472  cobalamin biosynthesis protein CbiG  32.79 
 
 		 276 aa  45.1  0.0003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1264  precorrin-3B C17-methyltransferase  32.81 
 
 		 778 aa  44.7  0.0004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3409  cobalamin biosynthesis protein cobE, putative  36.84 
 
 		 129 aa  44.3  0.0006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.34231 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1295  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiG protein  26.92 
 
 		 368 aa  43.5  0.0009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0452493 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1718  precorrin-4 C11-methyltransferase  30.89 
 
 		 598 aa  43.9  0.0009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.956767  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1301  precorrin-3B C17-methyltransferase, putative  30 
 
 		 131 aa  43.5  0.001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3155  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiG protein  32.5 
 
 		 144 aa  43.5  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.418613  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1264  putative precorrin-3B C17-methyltransferase  30 
 
 		 131 aa  43.5  0.001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1227  cobalamin biosynthesis protein CbiG  31.31 
 
 		 290 aa  43.1  0.001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.382267  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0934  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiG protein  28.69 
 
 		 425 aa  42.7  0.002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00611922 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0480  cobalamin biosynthesis protein  36.62 
 
 		 135 aa  42.4  0.002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2126  precorrin-3B C17-methyltransferase protein  31.93 
 
 		 139 aa  42.7  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.66936  normal  0.0232718 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0445  cobalamin biosynthesis protein  36.62 
 
 		 135 aa  42.4  0.002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.281465  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2445  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiG protein  40.65 
 
 		 171 aa  42  0.003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0185961  normal  0.116973 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2702  precorrin-3B C17-methyltransferase  34.65 
 
 		 574 aa  42  0.003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000152397 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0145  cobalamin biosynthesis protein CbiG  30.84 
 
 		 254 aa  41.6  0.004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.685754  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0967  putative CobE protein  47.11 
 
 		 140 aa  41.2  0.005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.333911  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2710  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiG protein  30.33 
 
 		 354 aa  40.4  0.008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.329819  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19561  bifunctional cbiH protein and precorrin-3B C17-methyltransferase  28.7 
 
 		 593 aa  40.4  0.008  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3129  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiG protein  35.92 
 
 		 132 aa  40.4  0.008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1081  precorrin-3 methyltransferase  28.7 
 
 		 593 aa  40.4  0.008  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1997  precorrin-3B C17-methyltransferase region  37.04 
 
 		 537 aa  40  0.01  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0124664  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>