89 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_3129 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008576  Mmc1_3129  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiG protein  100 
 
 		 132 aa  263  5e-70  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1345  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiG protein  53.85 
 
 		 132 aa  114  5e-25  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.49198  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1686  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiG protein  52.31 
 
 		 131 aa  114  6e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.474342  normal  0.413121 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0480  cobalamin biosynthesis protein  52.34 
 
 		 135 aa  111  3e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0445  cobalamin biosynthesis protein  52.34 
 
 		 135 aa  111  3e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.281465  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1017  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiG protein  50.38 
 
 		 134 aa  109  1.0000000000000001e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.959197  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0075  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiG protein  54.62 
 
 		 152 aa  108  3e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3743  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiG protein  47.76 
 
 		 401 aa  107  6e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2769  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiG protein  50.37 
 
 		 152 aa  104  5e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.189555  normal  0.117586 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2156  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiG protein  51.88 
 
 		 144 aa  98.6  3e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.563547  normal  0.0478382 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19561  bifunctional cbiH protein and precorrin-3B C17-methyltransferase  47.06 
 
 		 593 aa  98.2  3e-20  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1081  precorrin-3 methyltransferase  46.08 
 
 		 593 aa  97.4  5e-20  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1997  precorrin-3B C17-methyltransferase region  40.8 
 
 		 537 aa  92.4  2e-18  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0124664  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16381  bifunctional cbiH protein and precorrin-3B C18-methyltransferace  40.8 
 
 		 620 aa  86.3  1e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6033  precorrin-3B C17-methyltransferase  41.59 
 
 		 810 aa  81.6  0.000000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.038685  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17041  bifunctional cbiH protein and precorrin-3B C17-methyltransferase  34.88 
 
 		 604 aa  80.9  0.000000000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17291  bifunctional cbiH protein and precorrin-3B C17-methyltransferase  36.8 
 
 		 600 aa  80.5  0.000000000000008  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.792145  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17171  bifunctional cbiH protein and precorrin-3B C17-methyltransferase  38.74 
 
 		 600 aa  79.7  0.00000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0643  precorrin-3 methyltransferase  43.41 
 
 		 561 aa  76.6  0.0000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0184568  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0329  precorrin-3 methyltransferase  44 
 
 		 579 aa  75.9  0.0000000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.189951 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4162  precorrin-4 C11-methyltransferase  43.48 
 
 		 958 aa  75.5  0.0000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.329616  normal  0.542159 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3373  cobalamin biosynthesis protein CbiG  40 
 
 		 258 aa  73.9  0.0000000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.143651 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1617  precorrin-3 methyltransferase  34.11 
 
 		 606 aa  73.2  0.000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.481163  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1558  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiG protein  35.35 
 
 		 357 aa  73.2  0.000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3230  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiG protein  40.35 
 
 		 357 aa  71.2  0.000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.106675  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4089  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiG protein  34.51 
 
 		 141 aa  70.5  0.000000000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2296  putative bifunctional protein (CbiGH)  34.48 
 
 		 158 aa  69.7  0.00000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.192633  normal  0.0156989 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4477  precorrin-4 C11-methyltransferase  35.2 
 
 		 610 aa  68.9  0.00000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00717843  normal  0.120162 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0379  precorrin-3B C17-methyltransferase  40 
 
 		 631 aa  68.9  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2084  cobalamin biosynthesis protein CbiG-like protein  33.59 
 
 		 508 aa  67.4  0.00000000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3628  precorrin-3B C17-methyltransferase  31.25 
 
 		 623 aa  66.6  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0539  hypothetical protein  43 
 
 		 140 aa  65.9  0.0000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2485  precorrin-3B C17-methyltransferase  30.47 
 
 		 623 aa  65.1  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0040  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiG protein  37.62 
 
 		 353 aa  65.1  0.0000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2608  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiG protein  32.8 
 
 		 399 aa  65.1  0.0000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1014  precorrin-4 C11-methyltransferase  37.17 
 
 		 626 aa  65.5  0.0000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2702  precorrin-3B C17-methyltransferase  40.77 
 
 		 574 aa  64.7  0.0000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000152397 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4366  precorrin-3 methyltransferase  36.73 
 
 		 663 aa  64.7  0.0000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.216409 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3606  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiG protein  38.28 
 
 		 347 aa  64.7  0.0000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1675  precorrin-3B C17-methyltransferase  37.78 
 
 		 629 aa  64.7  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2520  precorrin-3B C17-methyltransferase  43.24 
 
 		 577 aa  63.9  0.0000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2636  precorrin-3B C17-methyltransferase  39.17 
 
 		 612 aa  62.8  0.000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.168127  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0217  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiG protein  39.47 
 
 		 398 aa  62.8  0.000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1718  precorrin-4 C11-methyltransferase  35.79 
 
 		 598 aa  62  0.000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.956767  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3540  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiG protein  38.28 
 
 		 347 aa  61.2  0.000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23501  bifunctional cbiH protein and precorrin-3B C17-methyltransferase  46.03 
 
 		 594 aa  60.8  0.000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.659645 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1317  precorrin-3B C17-methyltransferase  45.79 
 
 		 611 aa  58.2  0.00000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.161327  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0082  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiG protein  30 
 
 		 350 aa  58.9  0.00000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.243954 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2778  cobalamin biosynthesis protein CobE  37.72 
 
 		 137 aa  57.8  0.00000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.43283  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3181  precorrin-3 methyltransferase  39.08 
 
 		 655 aa  57.4  0.00000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0472  cobalamin biosynthesis protein CbiG  35.66 
 
 		 276 aa  55.8  0.0000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0211  cobalamin biosynthesis protein CbiG/precorrin-4 C11-methyltransferase  29.23 
 
 		 614 aa  55.1  0.0000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1747  putative cobalamin biosynthesis protein  36.67 
 
 		 145 aa  55.1  0.0000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.161178 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2501  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiG protein  42.37 
 
 		 427 aa  54.7  0.0000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0802  precorrin-3B C17-methyltransferase  40.18 
 
 		 547 aa  55.1  0.0000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0804272  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2993  cobalamin biosynthesis protein CbiG, putative  35.09 
 
 		 351 aa  53.5  0.0000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1288  precorrin-4 C11-methyltransferase  34.51 
 
 		 626 aa  53.1  0.000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0314  cobalamin biosynthesis protein CbiG  31.37 
 
 		 349 aa  52.4  0.000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0572  precorrin-3B C17-methyltransferase  33.04 
 
 		 800 aa  52.4  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0934  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiG protein  28.12 
 
 		 425 aa  52.4  0.000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00611922 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3409  cobalamin biosynthesis protein cobE, putative  43.08 
 
 		 129 aa  51.6  0.000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.34231 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1273  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiG protein  33.33 
 
 		 340 aa  51.2  0.000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21210  precorrin-4 C11-methyltransferase  40 
 
 		 867 aa  49.7  0.00001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1429  cobalamin biosynthesis protein CbiG  28.45 
 
 		 332 aa  50.1  0.00001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00979138  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2126  precorrin-3B C17-methyltransferase protein  32.06 
 
 		 139 aa  49.7  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.66936  normal  0.0232718 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3155  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiG protein  35.59 
 
 		 144 aa  48.9  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.418613  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0484  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiG protein  33.33 
 
 		 351 aa  49.3  0.00002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1264  precorrin-3B C17-methyltransferase  35.4 
 
 		 778 aa  48.9  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0637  precorrin-3B C17-methyltransferase  36.61 
 
 		 837 aa  48.9  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.647433 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3151  putative CobE protein  35.29 
 
 		 134 aa  49.3  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.409186  normal  0.274603 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2353  hypothetical protein  41.54 
 
 		 128 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0619  cobalamin biosynthesis protein CbiG  36.73 
 
 		 254 aa  48.1  0.00004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.25706  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2214  hypothetical protein  36.26 
 
 		 142 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.693941  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1299  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiG protein  31.96 
 
 		 379 aa  47.8  0.00006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4998  cobalamin biosynthesis protein CbiG  29.67 
 
 		 162 aa  46.6  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0542565  hitchhiker  0.0000351412 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25930  hypothetical protein  36.43 
 
 		 142 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00192848  normal  0.0649917 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3649  cobalamin biosynthesis protein CbiG  34 
 
 		 259 aa  46.6  0.0001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1093  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiG protein  33.33 
 
 		 365 aa  45.4  0.0002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2531  cobalamin biosynthesis protein CobE  37.68 
 
 		 128 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.573883  hitchhiker  0.00728118 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0935  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiG protein  34.43 
 
 		 350 aa  44.7  0.0004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0703  cobalamin biosynthesis protein CbiG  21.21 
 
 		 320 aa  44.3  0.0005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1295  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiG protein  28.93 
 
 		 368 aa  44.3  0.0005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0452493 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1377  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiG protein  28.91 
 
 		 351 aa  43.5  0.0009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1235  cobalamin biosynthesis protein CbiG  26.72 
 
 		 284 aa  42.4  0.002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3514  putative CobE protein  32.35 
 
 		 125 aa  41.2  0.004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.374002 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0615  cobalamin biosynthesis protein CbiG  28.57 
 
 		 347 aa  41.2  0.004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000212021  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2015  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiG protein  34 
 
 		 424 aa  41.2  0.005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00297302  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3102  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiG protein  35.9 
 
 		 137 aa  41.2  0.005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3019  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiG protein  31.9 
 
 		 149 aa  40.4  0.008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.108721  normal  0.148561 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>