87 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_25930 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008463  PA14_25930  hypothetical protein  100 
 
 		 142 aa  269  9e-72  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00192848  normal  0.0649917 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2214  hypothetical protein  92.25 
 
 		 142 aa  228  2e-59  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.693941  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2778  cobalamin biosynthesis protein CobE  47.69 
 
 		 137 aa  95.9  2e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.43283  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3019  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiG protein  47.2 
 
 		 149 aa  92  2e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.108721  normal  0.148561 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3102  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiG protein  48 
 
 		 137 aa  80.9  0.000000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4588  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiG protein  42.03 
 
 		 142 aa  79.7  0.00000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.0000406351  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3383  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiG protein  45.04 
 
 		 464 aa  79  0.00000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.538003  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3409  cobalamin biosynthesis protein cobE, putative  50.55 
 
 		 129 aa  75.5  0.0000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.34231 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2531  cobalamin biosynthesis protein CobE  46.15 
 
 		 128 aa  75.1  0.0000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.573883  hitchhiker  0.00728118 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2353  hypothetical protein  48.35 
 
 		 128 aa  74.7  0.0000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19561  bifunctional cbiH protein and precorrin-3B C17-methyltransferase  38.32 
 
 		 593 aa  70.5  0.000000000007  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2636  precorrin-3B C17-methyltransferase  40.78 
 
 		 612 aa  70.1  0.00000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.168127  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1081  precorrin-3 methyltransferase  35 
 
 		 593 aa  70.1  0.00000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1747  putative cobalamin biosynthesis protein  36.43 
 
 		 145 aa  68.6  0.00000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.161178 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2702  precorrin-3B C17-methyltransferase  41.09 
 
 		 574 aa  67  0.00000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000152397 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0935  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiG protein  36.09 
 
 		 350 aa  66.6  0.0000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1718  precorrin-4 C11-methyltransferase  36.22 
 
 		 598 aa  65.9  0.0000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.956767  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0572  precorrin-3B C17-methyltransferase  38.76 
 
 		 800 aa  65.9  0.0000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1558  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiG protein  30.71 
 
 		 357 aa  64.7  0.0000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2520  precorrin-3B C17-methyltransferase  43.59 
 
 		 577 aa  63.5  0.000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16381  bifunctional cbiH protein and precorrin-3B C18-methyltransferace  38 
 
 		 620 aa  59.3  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0217  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiG protein  39.69 
 
 		 398 aa  58.5  0.00000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3373  cobalamin biosynthesis protein CbiG  31.71 
 
 		 258 aa  58.5  0.00000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.143651 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0314  cobalamin biosynthesis protein CbiG  30.3 
 
 		 349 aa  58.5  0.00000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2608  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiG protein  31.5 
 
 		 399 aa  58.9  0.00000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2368  putative precorrin-3B C17-methyltransferase protein  38.4 
 
 		 143 aa  58.5  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.450162  normal  0.0563077 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1345  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiG protein  42.42 
 
 		 132 aa  58.5  0.00000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.49198  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0643  precorrin-3 methyltransferase  39.23 
 
 		 561 aa  57.8  0.00000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0184568  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1299  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiG protein  32.06 
 
 		 379 aa  57.8  0.00000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3129  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiG protein  36.17 
 
 		 132 aa  56.2  0.0000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6033  precorrin-3B C17-methyltransferase  37.37 
 
 		 810 aa  56.2  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.038685  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1617  precorrin-3 methyltransferase  35.04 
 
 		 606 aa  55.5  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.481163  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2126  precorrin-3B C17-methyltransferase protein  33.59 
 
 		 139 aa  54.7  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.66936  normal  0.0232718 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0040  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiG protein  31.34 
 
 		 353 aa  54.7  0.0000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17041  bifunctional cbiH protein and precorrin-3B C17-methyltransferase  30.51 
 
 		 604 aa  54.3  0.0000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0637  precorrin-3B C17-methyltransferase  37.01 
 
 		 837 aa  53.9  0.0000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.647433 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0934  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiG protein  31.78 
 
 		 425 aa  53.5  0.000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00611922 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0472  cobalamin biosynthesis protein CbiG  34.92 
 
 		 276 aa  53.1  0.000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1295  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiG protein  25.95 
 
 		 368 aa  53.1  0.000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0452493 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17291  bifunctional cbiH protein and precorrin-3B C17-methyltransferase  33.05 
 
 		 600 aa  53.1  0.000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.792145  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17171  bifunctional cbiH protein and precorrin-3B C17-methyltransferase  33.9 
 
 		 600 aa  52.8  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2485  precorrin-3B C17-methyltransferase  32.04 
 
 		 623 aa  52  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3628  precorrin-3B C17-methyltransferase  32.04 
 
 		 623 aa  52  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4366  precorrin-3 methyltransferase  29.52 
 
 		 663 aa  52  0.000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.216409 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1093  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiG protein  36.09 
 
 		 365 aa  52  0.000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2084  cobalamin biosynthesis protein CbiG-like protein  30.66 
 
 		 508 aa  50.4  0.000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2150  cobalamin biosynthesis protein CbiG  31.39 
 
 		 351 aa  50.4  0.000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.118541  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2710  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiG protein  28.24 
 
 		 354 aa  50.4  0.000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.329819  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2197  cobalamin biosynthesis protein CbiG  31.78 
 
 		 351 aa  50.4  0.000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3743  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiG protein  37.78 
 
 		 401 aa  50.1  0.00001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2363  cobalamin biosynthesis protein CbiG  31.78 
 
 		 351 aa  49.7  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.518108  normal  0.79543 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3540  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiG protein  34.68 
 
 		 347 aa  49.7  0.00001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2250  cobalamin biosynthesis protein CbiG  31.78 
 
 		 351 aa  49.7  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.662898  normal  0.279224 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2204  cobalamin biosynthesis protein CbiG  31.78 
 
 		 351 aa  49.7  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1720  cobalamin biosynthesis protein CbiG  30.4 
 
 		 290 aa  48.5  0.00003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2501  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiG protein  35.94 
 
 		 427 aa  48.9  0.00003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1377  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiG protein  25.38 
 
 		 351 aa  48.1  0.00004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0379  precorrin-3B C17-methyltransferase  31.73 
 
 		 631 aa  47.8  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1997  precorrin-3B C17-methyltransferase region  33.03 
 
 		 537 aa  47.4  0.00006  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0124664  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3606  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiG protein  33.06 
 
 		 347 aa  47.4  0.00007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3649  cobalamin biosynthesis protein CbiG  33.33 
 
 		 259 aa  47  0.00008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1017  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiG protein  38.89 
 
 		 134 aa  47  0.0001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.959197  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0211  cobalamin biosynthesis protein CbiG/precorrin-4 C11-methyltransferase  32.17 
 
 		 614 aa  46.2  0.0001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3151  putative CobE protein  36.08 
 
 		 134 aa  46.6  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.409186  normal  0.274603 
 
 
-
 
NC_004310  BR1301  precorrin-3B C17-methyltransferase, putative  35.71 
 
 		 131 aa  45.8  0.0002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1264  precorrin-3B C17-methyltransferase  34.11 
 
 		 778 aa  45.8  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1264  putative precorrin-3B C17-methyltransferase  35.71 
 
 		 131 aa  45.8  0.0002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4477  precorrin-4 C11-methyltransferase  30.1 
 
 		 610 aa  45.8  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00717843  normal  0.120162 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4089  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiG protein  25.96 
 
 		 141 aa  45.4  0.0003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1273  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiG protein  30.69 
 
 		 340 aa  45.1  0.0003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0145  cobalamin biosynthesis protein CbiG  31.07 
 
 		 254 aa  44.3  0.0005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.685754  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1715  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiG protein  27.48 
 
 		 351 aa  43.9  0.0007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2769  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiG protein  34.34 
 
 		 152 aa  43.9  0.0007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.189555  normal  0.117586 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21210  precorrin-4 C11-methyltransferase  31.96 
 
 		 867 aa  43.9  0.0008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3181  precorrin-3 methyltransferase  35.71 
 
 		 655 aa  42.7  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0802  precorrin-3B C17-methyltransferase  34.85 
 
 		 547 aa  43.5  0.001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0804272  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0445  cobalamin biosynthesis protein  38.2 
 
 		 135 aa  42.7  0.002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.281465  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0480  cobalamin biosynthesis protein  38.2 
 
 		 135 aa  42.7  0.002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0511  cobalamin biosynthesis protein CbiG  32 
 
 		 290 aa  42.4  0.002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3155  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiG protein  36.22 
 
 		 144 aa  42.4  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.418613  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1852  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiG protein  29.41 
 
 		 279 aa  41.6  0.003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0484  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiG protein  33.59 
 
 		 351 aa  41.2  0.004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0619  cobalamin biosynthesis protein CbiG  31.75 
 
 		 254 aa  41.6  0.004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.25706  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1227  cobalamin biosynthesis protein CbiG  27.64 
 
 		 290 aa  41.2  0.005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.382267  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3514  putative CobE protein  33.33 
 
 		 125 aa  40.4  0.008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.374002 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1288  precorrin-4 C11-methyltransferase  29.46 
 
 		 626 aa  40.4  0.009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2356  cobalamin biosynthesis protein CbiG  35.05 
 
 		 264 aa  40  0.01  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.194675  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>