80 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_2126 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011369  Rleg2_2126  precorrin-3B C17-methyltransferase protein  100 
 
 		 139 aa  270  6e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.66936  normal  0.0232718 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2368  putative precorrin-3B C17-methyltransferase protein  81.16 
 
 		 143 aa  207  5e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.450162  normal  0.0563077 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2636  precorrin-3B C17-methyltransferase  61.98 
 
 		 612 aa  140  6e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.168127  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1747  putative cobalamin biosynthesis protein  62.5 
 
 		 145 aa  140  8e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.161178 
 
 
-
 
NC_004310  BR1301  precorrin-3B C17-methyltransferase, putative  45.16 
 
 		 131 aa  91.7  3e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1264  putative precorrin-3B C17-methyltransferase  45.16 
 
 		 131 aa  91.7  3e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1882  precorrin-3B C17-methyltransferase, putative  48.36 
 
 		 137 aa  86.7  1e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.809661  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3373  cobalamin biosynthesis protein CbiG  36.51 
 
 		 258 aa  82.4  0.000000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.143651 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3383  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiG protein  44.8 
 
 		 464 aa  80.1  0.00000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.538003  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2702  precorrin-3B C17-methyltransferase  45.08 
 
 		 574 aa  74.7  0.0000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000152397 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2778  cobalamin biosynthesis protein CobE  44.21 
 
 		 137 aa  71.6  0.000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.43283  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3102  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiG protein  44 
 
 		 137 aa  70.1  0.000000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3019  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiG protein  40.32 
 
 		 149 aa  68.6  0.00000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.108721  normal  0.148561 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0643  precorrin-3 methyltransferase  40.98 
 
 		 561 aa  68.6  0.00000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0184568  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2520  precorrin-3B C17-methyltransferase  45.45 
 
 		 577 aa  67.8  0.00000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3540  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiG protein  36.96 
 
 		 347 aa  67.4  0.00000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0040  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiG protein  40.65 
 
 		 353 aa  65.9  0.0000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4477  precorrin-4 C11-methyltransferase  33.33 
 
 		 610 aa  65.1  0.0000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00717843  normal  0.120162 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3606  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiG protein  35.77 
 
 		 347 aa  64.3  0.0000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3514  putative CobE protein  35.29 
 
 		 125 aa  63.5  0.0000000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.374002 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0934  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiG protein  31.67 
 
 		 425 aa  62.4  0.000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00611922 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1093  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiG protein  37.12 
 
 		 365 aa  61.6  0.000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17041  bifunctional cbiH protein and precorrin-3B C17-methyltransferase  35.11 
 
 		 604 aa  62  0.000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1617  precorrin-3 methyltransferase  33.85 
 
 		 606 aa  60.8  0.000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.481163  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3230  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiG protein  35.71 
 
 		 357 aa  60.8  0.000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.106675  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1345  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiG protein  38.93 
 
 		 132 aa  60.8  0.000000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.49198  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3409  cobalamin biosynthesis protein cobE, putative  37.19 
 
 		 129 aa  58.9  0.00000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.34231 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1273  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiG protein  33.06 
 
 		 340 aa  59.3  0.00000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2608  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiG protein  32 
 
 		 399 aa  58.9  0.00000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1718  precorrin-4 C11-methyltransferase  32.54 
 
 		 598 aa  58.2  0.00000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.956767  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0484  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiG protein  36 
 
 		 351 aa  57.8  0.00000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1429  cobalamin biosynthesis protein CbiG  27.78 
 
 		 332 aa  57.4  0.00000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00979138  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17291  bifunctional cbiH protein and precorrin-3B C17-methyltransferase  32.26 
 
 		 600 aa  57.4  0.00000007  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.792145  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2531  cobalamin biosynthesis protein CobE  34.83 
 
 		 128 aa  57  0.00000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.573883  hitchhiker  0.00728118 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17171  bifunctional cbiH protein and precorrin-3B C17-methyltransferase  33.03 
 
 		 600 aa  57  0.00000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1558  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiG protein  28.33 
 
 		 357 aa  56.2  0.0000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1017  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiG protein  35.88 
 
 		 134 aa  55.5  0.0000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.959197  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1720  cobalamin biosynthesis protein CbiG  34.43 
 
 		 290 aa  55.1  0.0000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16381  bifunctional cbiH protein and precorrin-3B C18-methyltransferace  36.36 
 
 		 620 aa  55.5  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3129  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiG protein  35.38 
 
 		 132 aa  54.7  0.0000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1295  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiG protein  29.27 
 
 		 368 aa  53.9  0.0000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0452493 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19561  bifunctional cbiH protein and precorrin-3B C17-methyltransferase  29.59 
 
 		 593 aa  53.1  0.000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2993  cobalamin biosynthesis protein CbiG, putative  34.11 
 
 		 351 aa  53.1  0.000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0472  cobalamin biosynthesis protein CbiG  33.07 
 
 		 276 aa  53.1  0.000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1227  cobalamin biosynthesis protein CbiG  30.33 
 
 		 290 aa  52.4  0.000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.382267  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1081  precorrin-3 methyltransferase  28.57 
 
 		 593 aa  52.4  0.000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1299  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiG protein  29.75 
 
 		 379 aa  52  0.000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1317  precorrin-3B C17-methyltransferase  41.74 
 
 		 611 aa  51.2  0.000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.161327  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0511  cobalamin biosynthesis protein CbiG  36.07 
 
 		 290 aa  50.8  0.000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3151  putative CobE protein  34.45 
 
 		 134 aa  50.8  0.000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.409186  normal  0.274603 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1235  cobalamin biosynthesis protein CbiG  26.19 
 
 		 284 aa  50.1  0.000009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2353  hypothetical protein  35.54 
 
 		 128 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6033  precorrin-3B C17-methyltransferase  37.39 
 
 		 810 aa  50.1  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.038685  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25930  hypothetical protein  34.11 
 
 		 142 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00192848  normal  0.0649917 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4366  precorrin-3 methyltransferase  35.35 
 
 		 663 aa  48.9  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.216409 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0314  cobalamin biosynthesis protein CbiG  28.97 
 
 		 349 aa  49.3  0.00002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2084  cobalamin biosynthesis protein CbiG-like protein  35.54 
 
 		 508 aa  49.3  0.00002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21210  precorrin-4 C11-methyltransferase  35.79 
 
 		 867 aa  49.3  0.00002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0075  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiG protein  38.54 
 
 		 152 aa  48.9  0.00002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0175  precorrin-3B C17-methyltransferase  45.16 
 
 		 601 aa  48.5  0.00003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.120567  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4588  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiG protein  34.96 
 
 		 142 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.0000406351  normal  1 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3649  cobalamin biosynthesis protein CbiG  30.53 
 
 		 259 aa  47.8  0.00005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1288  precorrin-4 C11-methyltransferase  30 
 
 		 626 aa  47.8  0.00005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2214  hypothetical protein  36 
 
 		 142 aa  47.4  0.00006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.693941  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2356  cobalamin biosynthesis protein CbiG  35.78 
 
 		 264 aa  46.6  0.0001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.194675  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0802  precorrin-3B C17-methyltransferase  36.8 
 
 		 547 aa  46.6  0.0001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0804272  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0615  cobalamin biosynthesis protein CbiG  27.73 
 
 		 347 aa  46.2  0.0001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000212021  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1377  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiG protein  28.33 
 
 		 351 aa  46.6  0.0001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2710  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiG protein  27.91 
 
 		 354 aa  46.2  0.0002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.329819  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4162  precorrin-4 C11-methyltransferase  31.08 
 
 		 958 aa  45.8  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.329616  normal  0.542159 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0291  cobalamin biosynthesis protein CbiG  35.54 
 
 		 319 aa  45.1  0.0003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.539865  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3743  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiG protein  35.42 
 
 		 401 aa  44.7  0.0004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1997  precorrin-3B C17-methyltransferase region  32.41 
 
 		 537 aa  44.7  0.0005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0124664  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0480  cobalamin biosynthesis protein  31.11 
 
 		 135 aa  43.9  0.0007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0445  cobalamin biosynthesis protein  31.11 
 
 		 135 aa  43.9  0.0007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.281465  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2769  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiG protein  37.78 
 
 		 152 aa  43.1  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.189555  normal  0.117586 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3212  cobalamin biosynthesis protein CbiG  30.25 
 
 		 290 aa  42.7  0.002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3181  precorrin-3 methyltransferase  32.14 
 
 		 655 aa  40.4  0.008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1686  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiG protein  37.21 
 
 		 131 aa  40.4  0.008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.474342  normal  0.413121 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2296  putative bifunctional protein (CbiGH)  31.21 
 
 		 158 aa  40  0.01  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.192633  normal  0.0156989 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>