62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_2296 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_2296  putative bifunctional protein (CbiGH)  100 
 
 		 158 aa  295  2e-79  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.192633  normal  0.0156989 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0539  hypothetical protein  55.67 
 
 		 140 aa  84.7  5e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6033  precorrin-3B C17-methyltransferase  46.72 
 
 		 810 aa  82.8  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.038685  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4162  precorrin-4 C11-methyltransferase  45.27 
 
 		 958 aa  80.5  0.000000000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.329616  normal  0.542159 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3129  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiG protein  34.48 
 
 		 132 aa  68.9  0.00000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1345  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiG protein  38.03 
 
 		 132 aa  67  0.0000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.49198  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1317  precorrin-3B C17-methyltransferase  40.8 
 
 		 611 aa  67  0.0000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.161327  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4089  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiG protein  34.31 
 
 		 141 aa  65.5  0.0000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2520  precorrin-3B C17-methyltransferase  45.83 
 
 		 577 aa  64.3  0.0000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2702  precorrin-3B C17-methyltransferase  38.67 
 
 		 574 aa  63.5  0.000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000152397 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1558  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiG protein  29.67 
 
 		 357 aa  62.8  0.000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1017  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiG protein  35.21 
 
 		 134 aa  62  0.000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.959197  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0643  precorrin-3 methyltransferase  38.97 
 
 		 561 aa  62  0.000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0184568  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3743  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiG protein  37.23 
 
 		 401 aa  59.7  0.00000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19561  bifunctional cbiH protein and precorrin-3B C17-methyltransferase  29.17 
 
 		 593 aa  57.8  0.00000006  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1718  precorrin-4 C11-methyltransferase  35.17 
 
 		 598 aa  57.4  0.00000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.956767  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1081  precorrin-3 methyltransferase  28.12 
 
 		 593 aa  56.6  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3230  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiG protein  37.76 
 
 		 357 aa  56.2  0.0000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.106675  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1997  precorrin-3B C17-methyltransferase region  33.33 
 
 		 537 aa  55.5  0.0000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0124664  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0075  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiG protein  38.04 
 
 		 152 aa  54.7  0.0000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2015  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiG protein  43.56 
 
 		 424 aa  53.9  0.0000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00297302  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0637  precorrin-3B C17-methyltransferase  33.33 
 
 		 837 aa  53.1  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.647433 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2769  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiG protein  34.75 
 
 		 152 aa  53.1  0.000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.189555  normal  0.117586 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1686  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiG protein  32.39 
 
 		 131 aa  52.4  0.000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.474342  normal  0.413121 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17041  bifunctional cbiH protein and precorrin-3B C17-methyltransferase  29.17 
 
 		 604 aa  52.4  0.000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0802  precorrin-3B C17-methyltransferase  35.71 
 
 		 547 aa  52.4  0.000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0804272  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0379  precorrin-3B C17-methyltransferase  28.17 
 
 		 631 aa  51.6  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5856  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiG protein  39 
 
 		 419 aa  51.2  0.000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.302662  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17291  bifunctional cbiH protein and precorrin-3B C17-methyltransferase  28.12 
 
 		 600 aa  51.2  0.000006  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.792145  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17171  bifunctional cbiH protein and precorrin-3B C17-methyltransferase  28 
 
 		 600 aa  50.8  0.000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4366  precorrin-3 methyltransferase  33.33 
 
 		 663 aa  50.4  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.216409 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1617  precorrin-3 methyltransferase  31.71 
 
 		 606 aa  49.3  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.481163  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16381  bifunctional cbiH protein and precorrin-3B C18-methyltransferace  28.12 
 
 		 620 aa  49.3  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2608  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiG protein  25.27 
 
 		 399 aa  48.9  0.00002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0484  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiG protein  36.56 
 
 		 351 aa  49.7  0.00002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1295  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiG protein  26.06 
 
 		 368 aa  48.9  0.00003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0452493 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1429  cobalamin biosynthesis protein CbiG  22.45 
 
 		 332 aa  48.5  0.00003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00979138  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3606  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiG protein  37.76 
 
 		 347 aa  48.5  0.00004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1235  cobalamin biosynthesis protein CbiG  21.43 
 
 		 284 aa  48.1  0.00004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0572  precorrin-3B C17-methyltransferase  34.04 
 
 		 800 aa  48.1  0.00005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1299  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiG protein  23.36 
 
 		 379 aa  47.8  0.00006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3181  precorrin-3 methyltransferase  40 
 
 		 655 aa  47.8  0.00007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2156  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiG protein  33.8 
 
 		 144 aa  47  0.0001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.563547  normal  0.0478382 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3540  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiG protein  37.89 
 
 		 347 aa  46.2  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3019  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiG protein  29.93 
 
 		 149 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.108721  normal  0.148561 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1675  precorrin-3B C17-methyltransferase  31.18 
 
 		 629 aa  46.2  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0445  cobalamin biosynthesis protein  34.74 
 
 		 135 aa  45.1  0.0004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.281465  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2501  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiG protein  37.96 
 
 		 427 aa  45.1  0.0004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1747  putative cobalamin biosynthesis protein  33.33 
 
 		 145 aa  45.1  0.0004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.161178 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0480  cobalamin biosynthesis protein  34.74 
 
 		 135 aa  45.1  0.0004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2778  cobalamin biosynthesis protein CobE  32.99 
 
 		 137 aa  44.7  0.0005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.43283  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0040  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiG protein  30.61 
 
 		 353 aa  44.7  0.0005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0314  cobalamin biosynthesis protein CbiG  22.08 
 
 		 349 aa  44.7  0.0006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3628  precorrin-3B C17-methyltransferase  28.42 
 
 		 623 aa  43.9  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21210  precorrin-4 C11-methyltransferase  32.14 
 
 		 867 aa  43.5  0.001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2485  precorrin-3B C17-methyltransferase  27.37 
 
 		 623 aa  42.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2084  cobalamin biosynthesis protein CbiG-like protein  29.17 
 
 		 508 aa  43.1  0.002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0619  cobalamin biosynthesis protein CbiG  33.62 
 
 		 254 aa  42.7  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.25706  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3155  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiG protein  32.37 
 
 		 144 aa  42  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.418613  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1553  cobalamin biosynthesis protein CbiG  38.03 
 
 		 125 aa  40.8  0.008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.272579  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2710  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiG protein  33.87 
 
 		 354 aa  40.8  0.008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.329819  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0082  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiG protein  26.04 
 
 		 350 aa  40.4  0.01  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.243954 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>