98 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_3019 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007005  Psyr_3019  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiG protein  100 
 
 
149 aa  291  2e-78  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.108721  normal  0.148561 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3102  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiG protein  59.2 
 
 
137 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2778  cobalamin biosynthesis protein CobE  47.37 
 
 
137 aa  103  6e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.43283  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2531  cobalamin biosynthesis protein CobE  51.59 
 
 
128 aa  93.2  1e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.573883  hitchhiker  0.00728118 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2353  hypothetical protein  51.59 
 
 
128 aa  92.8  1e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3409  cobalamin biosynthesis protein cobE, putative  51.59 
 
 
129 aa  92  2e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.34231 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2214  hypothetical protein  47.2 
 
 
142 aa  82  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.693941  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4588  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiG protein  45.74 
 
 
142 aa  81.3  0.000000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.0000406351  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25930  hypothetical protein  47.2 
 
 
142 aa  79.3  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00192848  normal  0.0649917 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1747  putative cobalamin biosynthesis protein  42.64 
 
 
145 aa  74.3  0.0000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.161178 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2368  putative precorrin-3B C17-methyltransferase protein  41.27 
 
 
143 aa  72.4  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.450162  normal  0.0563077 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1558  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiG protein  30.07 
 
 
357 aa  70.9  0.000000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3373  cobalamin biosynthesis protein CbiG  35.77 
 
 
258 aa  69.3  0.00000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.143651 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2608  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiG protein  31.71 
 
 
399 aa  65.9  0.0000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2702  precorrin-3B C17-methyltransferase  39.85 
 
 
574 aa  65.1  0.0000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000152397 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0643  precorrin-3 methyltransferase  36.88 
 
 
561 aa  64.3  0.0000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0184568  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2636  precorrin-3B C17-methyltransferase  37.8 
 
 
612 aa  63.9  0.0000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.168127  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0217  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiG protein  37.8 
 
 
398 aa  63.5  0.0000000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2126  precorrin-3B C17-methyltransferase protein  39.52 
 
 
139 aa  63.5  0.0000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.66936  normal  0.0232718 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0572  precorrin-3B C17-methyltransferase  36.51 
 
 
800 aa  61.6  0.000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1718  precorrin-4 C11-methyltransferase  33.06 
 
 
598 aa  60.5  0.000000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.956767  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2501  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiG protein  37.98 
 
 
427 aa  60.5  0.000000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0615  cobalamin biosynthesis protein CbiG  30 
 
 
347 aa  58.5  0.00000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000212021  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1017  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiG protein  41.11 
 
 
134 aa  58.5  0.00000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.959197  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0637  precorrin-3B C17-methyltransferase  41 
 
 
837 aa  58.5  0.00000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.647433 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3606  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiG protein  31.97 
 
 
347 aa  58.2  0.00000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3540  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiG protein  35.25 
 
 
347 aa  57.4  0.00000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2710  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiG protein  29.2 
 
 
354 aa  57.4  0.00000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.329819  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2363  cobalamin biosynthesis protein CbiG  37.01 
 
 
351 aa  57.4  0.00000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.518108  normal  0.79543 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0314  cobalamin biosynthesis protein CbiG  31.93 
 
 
349 aa  56.6  0.0000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2204  cobalamin biosynthesis protein CbiG  42.67 
 
 
351 aa  56.2  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2250  cobalamin biosynthesis protein CbiG  42.67 
 
 
351 aa  56.2  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.662898  normal  0.279224 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2197  cobalamin biosynthesis protein CbiG  42.67 
 
 
351 aa  56.6  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2150  cobalamin biosynthesis protein CbiG  42.67 
 
 
351 aa  56.2  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.118541  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0040  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiG protein  32 
 
 
353 aa  56.6  0.0000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0211  cobalamin biosynthesis protein CbiG/precorrin-4 C11-methyltransferase  36.76 
 
 
614 aa  56.2  0.0000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3383  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiG protein  38.28 
 
 
464 aa  56.6  0.0000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.538003  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6033  precorrin-3B C17-methyltransferase  33.9 
 
 
810 aa  55.8  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.038685  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1014  precorrin-4 C11-methyltransferase  31.01 
 
 
626 aa  56.2  0.0000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21210  precorrin-4 C11-methyltransferase  44.12 
 
 
867 aa  55.5  0.0000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4477  precorrin-4 C11-methyltransferase  31.03 
 
 
610 aa  55.5  0.0000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00717843  normal  0.120162 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1345  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiG protein  37.93 
 
 
132 aa  55.5  0.0000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.49198  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2520  precorrin-3B C17-methyltransferase  39.13 
 
 
577 aa  54.3  0.0000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3155  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiG protein  36.43 
 
 
144 aa  54.7  0.0000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.418613  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1429  cobalamin biosynthesis protein CbiG  29.13 
 
 
332 aa  53.5  0.0000009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00979138  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1295  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiG protein  29.85 
 
 
368 aa  53.5  0.000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0452493 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1299  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiG protein  30.89 
 
 
379 aa  53.1  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16381  bifunctional cbiH protein and precorrin-3B C18-methyltransferace  33.33 
 
 
620 aa  52.8  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0379  precorrin-3B C17-methyltransferase  31.85 
 
 
631 aa  52.8  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2485  precorrin-3B C17-methyltransferase  32.76 
 
 
623 aa  52  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1235  cobalamin biosynthesis protein CbiG  29.13 
 
 
284 aa  51.6  0.000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17171  bifunctional cbiH protein and precorrin-3B C17-methyltransferase  29.46 
 
 
600 aa  50.1  0.00001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1617  precorrin-3 methyltransferase  29.23 
 
 
606 aa  49.7  0.00001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.481163  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3628  precorrin-3B C17-methyltransferase  31.54 
 
 
623 aa  50.1  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1997  precorrin-3B C17-methyltransferase region  32.03 
 
 
537 aa  48.9  0.00002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0124664  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1675  precorrin-3B C17-methyltransferase  32.2 
 
 
629 aa  49.3  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0934  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiG protein  29.77 
 
 
425 aa  48.9  0.00002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00611922 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1093  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiG protein  36.22 
 
 
365 aa  48.9  0.00002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1081  precorrin-3 methyltransferase  30.3 
 
 
593 aa  48.5  0.00003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1264  precorrin-3B C17-methyltransferase  39.76 
 
 
778 aa  48.5  0.00003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0480  cobalamin biosynthesis protein  34.51 
 
 
135 aa  48.1  0.00004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2015  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiG protein  41.18 
 
 
424 aa  48.1  0.00004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00297302  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0445  cobalamin biosynthesis protein  34.51 
 
 
135 aa  48.1  0.00004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.281465  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17291  bifunctional cbiH protein and precorrin-3B C17-methyltransferase  27.41 
 
 
600 aa  47.8  0.00005  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.792145  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19561  bifunctional cbiH protein and precorrin-3B C17-methyltransferase  30.3 
 
 
593 aa  47.8  0.00005  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0036  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiG protein  24.32 
 
 
329 aa  47.4  0.00007  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.384647  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3230  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiG protein  28.57 
 
 
357 aa  47.4  0.00007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.106675  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4366  precorrin-3 methyltransferase  30.19 
 
 
663 aa  47  0.00008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.216409 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1288  precorrin-4 C11-methyltransferase  30.23 
 
 
626 aa  47  0.00009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1377  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiG protein  28.69 
 
 
351 aa  47  0.00009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0935  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiG protein  32.81 
 
 
350 aa  47  0.00009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1818  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiG protein  25.47 
 
 
323 aa  46.2  0.0001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0802  precorrin-3B C17-methyltransferase  31.06 
 
 
547 aa  46.2  0.0001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0804272  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2156  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiG protein  36.44 
 
 
144 aa  46.6  0.0001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.563547  normal  0.0478382 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0472  cobalamin biosynthesis protein CbiG  37.11 
 
 
276 aa  47  0.0001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0703  cobalamin biosynthesis protein CbiG  28.43 
 
 
320 aa  46.6  0.0001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2356  cobalamin biosynthesis protein CbiG  39.18 
 
 
264 aa  45.8  0.0002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.194675  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17041  bifunctional cbiH protein and precorrin-3B C17-methyltransferase  32.48 
 
 
604 aa  45.4  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0484  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiG protein  29.69 
 
 
351 aa  45.4  0.0003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3649  cobalamin biosynthesis protein CbiG  41.67 
 
 
259 aa  45.1  0.0003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1301  precorrin-3B C17-methyltransferase, putative  34.71 
 
 
131 aa  44.7  0.0005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1264  putative precorrin-3B C17-methyltransferase  34.71 
 
 
131 aa  44.7  0.0005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2296  putative bifunctional protein (CbiGH)  29.93 
 
 
158 aa  43.9  0.0007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.192633  normal  0.0156989 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0175  precorrin-3B C17-methyltransferase  40.48 
 
 
601 aa  43.9  0.0007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.120567  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3151  putative CobE protein  34.43 
 
 
134 aa  43.9  0.0008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.409186  normal  0.274603 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3181  precorrin-3 methyltransferase  35.71 
 
 
655 aa  43.5  0.0009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0838  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiG protein  21.13 
 
 
323 aa  43.5  0.001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.167438  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0511  cobalamin biosynthesis protein CbiG  29.84 
 
 
290 aa  42.7  0.002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2084  cobalamin biosynthesis protein CbiG-like protein  28.12 
 
 
508 aa  42.4  0.002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0619  cobalamin biosynthesis protein CbiG  36.36 
 
 
254 aa  42.7  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.25706  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1273  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiG protein  27.84 
 
 
340 aa  42  0.003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0075  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiG protein  32.32 
 
 
152 aa  42  0.003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3743  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiG protein  36.56 
 
 
401 aa  42  0.003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4089  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiG protein  29.57 
 
 
141 aa  41.6  0.004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1852  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiG protein  32.54 
 
 
279 aa  41.6  0.004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4162  precorrin-4 C11-methyltransferase  31.54 
 
 
958 aa  40.4  0.008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.329616  normal  0.542159 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3129  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiG protein  31.9 
 
 
132 aa  40.4  0.009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0539  hypothetical protein  32.28 
 
 
140 aa  40  0.01  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>