41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_1553 on replicon NC_008390
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008390  Bamb_1553  cobalamin biosynthesis protein CbiG  100 
 
 		 125 aa  236  6.999999999999999e-62  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.272579  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1572  cobalamin biosynthesis protein CbiG  94.4 
 
 		 125 aa  218  3e-56  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.138843 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4801  cobalamin biosynthesis protein CbiG  88.8 
 
 		 125 aa  203  7e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.585361  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1173  cobalamin biosynthesis protein CbiG  86.4 
 
 		 125 aa  192  2e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.16786  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1653  cobalamin biosynthesis protein CbiG  86.4 
 
 		 125 aa  192  2e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.990326  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1627  cobalamin biosynthesis protein CbiG  86.29 
 
 		 124 aa  191  3e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.502118  normal  0.0158089 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1586  cobalamin biosynthesis protein CbiG  83.06 
 
 		 124 aa  155  2e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0533401 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1618  cobalamin biosynthesis protein CbiG  54 
 
 		 150 aa  87  8e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0280  cobalamin biosynthesis protein CbiG  54 
 
 		 150 aa  87  8e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00198469  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1174  cobalamin biosynthesis protein CbiG  54 
 
 		 276 aa  85.5  2e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0356012  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1950  cobalamin biosynthesis protein CbiG  53.42 
 
 		 146 aa  80.9  0.000000000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.418515  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1934  cobalamin biosynthesis protein CbiG  54.11 
 
 		 146 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0439527  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2095  cobalamin biosynthesis protein CbiG  52.35 
 
 		 149 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.336042  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3155  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiG protein  43.9 
 
 		 144 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.418613  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2410  cobalamin biosynthesis protein CbiG  53.52 
 
 		 318 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00863167  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0619  cobalamin biosynthesis protein CbiG  39.83 
 
 		 254 aa  67.4  0.00000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.25706  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4998  cobalamin biosynthesis protein CbiG  37.41 
 
 		 162 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0542565  hitchhiker  0.0000351412 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2356  cobalamin biosynthesis protein CbiG  41.88 
 
 		 264 aa  63.9  0.0000000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.194675  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1295  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiG protein  29.84 
 
 		 368 aa  57.8  0.00000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0452493 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1558  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiG protein  29.75 
 
 		 357 aa  52  0.000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2778  cobalamin biosynthesis protein CobE  37.7 
 
 		 137 aa  51.6  0.000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.43283  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3606  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiG protein  34.15 
 
 		 347 aa  50.1  0.00001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3540  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiG protein  38.02 
 
 		 347 aa  50.1  0.00001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2015  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiG protein  39.55 
 
 		 424 aa  49.3  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00297302  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0484  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiG protein  33.61 
 
 		 351 aa  48.5  0.00003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1264  precorrin-3B C17-methyltransferase  40.98 
 
 		 778 aa  48.5  0.00003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0511  cobalamin biosynthesis protein CbiG  40.83 
 
 		 290 aa  47.8  0.00005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1093  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiG protein  39.17 
 
 		 365 aa  47.8  0.00005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2608  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiG protein  28.1 
 
 		 399 aa  45.4  0.0003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1852  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiG protein  38.02 
 
 		 279 aa  45.4  0.0003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2531  cobalamin biosynthesis protein CobE  40.65 
 
 		 128 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.573883  hitchhiker  0.00728118 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0802  precorrin-3B C17-methyltransferase  40 
 
 		 547 aa  44.7  0.0005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0804272  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1299  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiG protein  28.57 
 
 		 379 aa  43.9  0.0008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3230  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiG protein  33.65 
 
 		 357 aa  42.7  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.106675  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1227  cobalamin biosynthesis protein CbiG  35.25 
 
 		 290 aa  42.4  0.002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.382267  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0040  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiG protein  27.87 
 
 		 353 aa  42.4  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0572  precorrin-3B C17-methyltransferase  36.13 
 
 		 800 aa  42  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2993  cobalamin biosynthesis protein CbiG, putative  31.97 
 
 		 351 aa  41.2  0.004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3212  cobalamin biosynthesis protein CbiG  28.33 
 
 		 290 aa  41.2  0.004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6033  precorrin-3B C17-methyltransferase  37.72 
 
 		 810 aa  40.4  0.009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.038685  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4089  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiG protein  32.14 
 
 		 141 aa  40  0.01  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>