40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_A4801 on replicon NC_007510
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007510  Bcep18194_A4801  cobalamin biosynthesis protein CbiG  100 
 
 
125 aa  233  4e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.585361  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1653  cobalamin biosynthesis protein CbiG  95.2 
 
 
125 aa  221  3e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.990326  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1173  cobalamin biosynthesis protein CbiG  95.2 
 
 
125 aa  221  3e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.16786  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1627  cobalamin biosynthesis protein CbiG  95.16 
 
 
124 aa  219  7e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.502118  normal  0.0158089 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1553  cobalamin biosynthesis protein CbiG  88.8 
 
 
125 aa  203  7e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.272579  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1572  cobalamin biosynthesis protein CbiG  87.2 
 
 
125 aa  199  9e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.138843 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1586  cobalamin biosynthesis protein CbiG  82.26 
 
 
124 aa  157  6e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0533401 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1934  cobalamin biosynthesis protein CbiG  50.66 
 
 
146 aa  84  7e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0439527  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1618  cobalamin biosynthesis protein CbiG  53.33 
 
 
150 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0280  cobalamin biosynthesis protein CbiG  53.33 
 
 
150 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00198469  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1950  cobalamin biosynthesis protein CbiG  50.66 
 
 
146 aa  82.8  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.418515  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1174  cobalamin biosynthesis protein CbiG  50.67 
 
 
276 aa  81.6  0.000000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0356012  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2095  cobalamin biosynthesis protein CbiG  49.03 
 
 
149 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.336042  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3155  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiG protein  43.9 
 
 
144 aa  78.2  0.00000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.418613  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2410  cobalamin biosynthesis protein CbiG  51.41 
 
 
318 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00863167  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0619  cobalamin biosynthesis protein CbiG  41.53 
 
 
254 aa  68.9  0.00000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.25706  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4998  cobalamin biosynthesis protein CbiG  35.97 
 
 
162 aa  67  0.00000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0542565  hitchhiker  0.0000351412 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2356  cobalamin biosynthesis protein CbiG  41.88 
 
 
264 aa  63.9  0.0000000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.194675  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1295  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiG protein  29.03 
 
 
368 aa  53.5  0.0000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0452493 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1558  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiG protein  28.1 
 
 
357 aa  50.4  0.000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2608  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiG protein  28.1 
 
 
399 aa  49.7  0.00001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1093  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiG protein  38.52 
 
 
365 aa  48.9  0.00002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1227  cobalamin biosynthesis protein CbiG  34.17 
 
 
290 aa  48.5  0.00003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.382267  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3606  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiG protein  33.87 
 
 
347 aa  48.5  0.00003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0484  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiG protein  34.43 
 
 
351 aa  47.8  0.00006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0040  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiG protein  31.2 
 
 
353 aa  47  0.00009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3540  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiG protein  34.68 
 
 
347 aa  46.6  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1852  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiG protein  37.19 
 
 
279 aa  46.2  0.0001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1079  cobalamin biosynthesis protein CbiG  30.25 
 
 
289 aa  45.4  0.0002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1299  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiG protein  27.5 
 
 
379 aa  44.3  0.0006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0511  cobalamin biosynthesis protein CbiG  39.5 
 
 
290 aa  43.9  0.0007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3212  cobalamin biosynthesis protein CbiG  30.83 
 
 
290 aa  43.9  0.0007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3649  cobalamin biosynthesis protein CbiG  33.87 
 
 
259 aa  43.5  0.0009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0572  precorrin-3B C17-methyltransferase  36.29 
 
 
800 aa  43.5  0.0009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2778  cobalamin biosynthesis protein CobE  37.86 
 
 
137 aa  43.1  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.43283  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0802  precorrin-3B C17-methyltransferase  40.83 
 
 
547 aa  42.7  0.002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0804272  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6033  precorrin-3B C17-methyltransferase  36.61 
 
 
810 aa  42  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.038685  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1264  precorrin-3B C17-methyltransferase  38.21 
 
 
778 aa  41.2  0.004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3230  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiG protein  31.97 
 
 
357 aa  40.8  0.005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.106675  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0075  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiG protein  34.74 
 
 
152 aa  40.8  0.006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>