32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_1572 on replicon NC_010551
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010551  BamMC406_1572  cobalamin biosynthesis protein CbiG  100 
 
 		 125 aa  235  1e-61  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.138843 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1553  cobalamin biosynthesis protein CbiG  94.4 
 
 		 125 aa  218  3e-56  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.272579  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4801  cobalamin biosynthesis protein CbiG  87.2 
 
 		 125 aa  199  9e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.585361  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1173  cobalamin biosynthesis protein CbiG  85.6 
 
 		 125 aa  189  9e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.16786  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1653  cobalamin biosynthesis protein CbiG  85.6 
 
 		 125 aa  189  9e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.990326  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1627  cobalamin biosynthesis protein CbiG  85.48 
 
 		 124 aa  189  1e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.502118  normal  0.0158089 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1586  cobalamin biosynthesis protein CbiG  81.45 
 
 		 124 aa  149  1e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0533401 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0280  cobalamin biosynthesis protein CbiG  51.33 
 
 		 150 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00198469  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1618  cobalamin biosynthesis protein CbiG  51.33 
 
 		 150 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1174  cobalamin biosynthesis protein CbiG  50.67 
 
 		 276 aa  77.4  0.00000000000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0356012  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1950  cobalamin biosynthesis protein CbiG  51.02 
 
 		 146 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.418515  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1934  cobalamin biosynthesis protein CbiG  46.71 
 
 		 146 aa  70.9  0.000000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0439527  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3155  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiG protein  42.28 
 
 		 144 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.418613  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2095  cobalamin biosynthesis protein CbiG  46.67 
 
 		 149 aa  68.2  0.00000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.336042  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2410  cobalamin biosynthesis protein CbiG  49.3 
 
 		 318 aa  68.2  0.00000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00863167  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4998  cobalamin biosynthesis protein CbiG  37.41 
 
 		 162 aa  65.5  0.0000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0542565  hitchhiker  0.0000351412 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0619  cobalamin biosynthesis protein CbiG  38.14 
 
 		 254 aa  60.1  0.00000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.25706  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2356  cobalamin biosynthesis protein CbiG  40.17 
 
 		 264 aa  56.2  0.0000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.194675  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1295  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiG protein  27.42 
 
 		 368 aa  49.3  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0452493 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3540  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiG protein  38.02 
 
 		 347 aa  47.8  0.00005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0511  cobalamin biosynthesis protein CbiG  39.17 
 
 		 290 aa  47.4  0.00007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2608  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiG protein  28.1 
 
 		 399 aa  47  0.00009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1558  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiG protein  28.1 
 
 		 357 aa  45.8  0.0002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2015  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiG protein  38.35 
 
 		 424 aa  44.7  0.0004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00297302  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1264  precorrin-3B C17-methyltransferase  40.16 
 
 		 778 aa  44.3  0.0005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3606  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiG protein  32.52 
 
 		 347 aa  43.9  0.0007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1852  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiG protein  38.02 
 
 		 279 aa  42.7  0.001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1093  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiG protein  37.5 
 
 		 365 aa  42.7  0.002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2778  cobalamin biosynthesis protein CobE  35.25 
 
 		 137 aa  42.7  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.43283  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3230  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiG protein  31.15 
 
 		 357 aa  41.6  0.003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.106675  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0484  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiG protein  31.97 
 
 		 351 aa  41.6  0.004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3212  cobalamin biosynthesis protein CbiG  30 
 
 		 290 aa  40  0.01  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>