60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BMA1174 on replicon NC_006348
Organism: Burkholderia mallei ATCC 23344



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006348  BMA1174  cobalamin biosynthesis protein CbiG  100 
 
 
276 aa  514  1.0000000000000001e-145  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0356012  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0280  cobalamin biosynthesis protein CbiG  100 
 
 
150 aa  282  3.0000000000000004e-75  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00198469  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1618  cobalamin biosynthesis protein CbiG  100 
 
 
150 aa  282  3.0000000000000004e-75  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2095  cobalamin biosynthesis protein CbiG  99.33 
 
 
149 aa  276  3e-73  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.336042  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2410  cobalamin biosynthesis protein CbiG  66.79 
 
 
318 aa  220  1.9999999999999999e-56  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00863167  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1934  cobalamin biosynthesis protein CbiG  91.33 
 
 
146 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0439527  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1950  cobalamin biosynthesis protein CbiG  92.67 
 
 
146 aa  183  3e-45  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.418515  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3155  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiG protein  47.97 
 
 
144 aa  105  1e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.418613  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4801  cobalamin biosynthesis protein CbiG  53.64 
 
 
125 aa  103  4e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.585361  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0619  cobalamin biosynthesis protein CbiG  43.09 
 
 
254 aa  102  5e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.25706  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1553  cobalamin biosynthesis protein CbiG  54 
 
 
125 aa  101  1e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.272579  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1627  cobalamin biosynthesis protein CbiG  52.67 
 
 
124 aa  99.4  5e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.502118  normal  0.0158089 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1173  cobalamin biosynthesis protein CbiG  52.32 
 
 
125 aa  96.7  4e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.16786  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1653  cobalamin biosynthesis protein CbiG  52.32 
 
 
125 aa  96.7  4e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.990326  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1572  cobalamin biosynthesis protein CbiG  50.67 
 
 
125 aa  92.8  5e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.138843 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4998  cobalamin biosynthesis protein CbiG  39.63 
 
 
162 aa  90.1  4e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0542565  hitchhiker  0.0000351412 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1586  cobalamin biosynthesis protein CbiG  49.66 
 
 
124 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0533401 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1295  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiG protein  32.41 
 
 
368 aa  69.3  0.00000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0452493 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1852  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiG protein  40.97 
 
 
279 aa  67  0.0000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0445  cobalamin biosynthesis protein  49.32 
 
 
135 aa  67  0.0000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.281465  normal 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0480  cobalamin biosynthesis protein  49.32 
 
 
135 aa  67  0.0000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2356  cobalamin biosynthesis protein CbiG  39.44 
 
 
264 aa  65.9  0.0000000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.194675  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3606  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiG protein  37.8 
 
 
347 aa  65.5  0.0000000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3540  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiG protein  36.42 
 
 
347 aa  65.1  0.000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1093  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiG protein  37.82 
 
 
365 aa  63.2  0.000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1377  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiG protein  27.08 
 
 
351 aa  61.6  0.00000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2993  cobalamin biosynthesis protein CbiG, putative  35.86 
 
 
351 aa  59.7  0.00000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1558  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiG protein  40 
 
 
357 aa  57  0.0000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0484  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiG protein  33.79 
 
 
351 aa  56.6  0.0000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2608  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiG protein  40.58 
 
 
399 aa  56.6  0.0000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2710  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiG protein  31.37 
 
 
354 aa  56.2  0.0000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.329819  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1017  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiG protein  43.06 
 
 
134 aa  55.8  0.0000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.959197  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0040  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiG protein  27.23 
 
 
353 aa  54.3  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3230  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiG protein  33.79 
 
 
357 aa  52.8  0.000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.106675  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0572  precorrin-3B C17-methyltransferase  35.44 
 
 
800 aa  52  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19561  bifunctional cbiH protein and precorrin-3B C17-methyltransferase  32.86 
 
 
593 aa  48.5  0.0001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21210  precorrin-4 C11-methyltransferase  42.03 
 
 
867 aa  47.8  0.0002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1429  cobalamin biosynthesis protein CbiG  25.69 
 
 
332 aa  48.1  0.0002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00979138  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0637  precorrin-3B C17-methyltransferase  34 
 
 
837 aa  47.8  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.647433 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1264  precorrin-3B C17-methyltransferase  33.07 
 
 
778 aa  47.8  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1299  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiG protein  27.46 
 
 
379 aa  47.8  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3743  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiG protein  44.59 
 
 
401 aa  48.1  0.0002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1081  precorrin-3 methyltransferase  31.43 
 
 
593 aa  47.4  0.0003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0075  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiG protein  42.11 
 
 
152 aa  46.6  0.0004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3129  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiG protein  38.36 
 
 
132 aa  47  0.0004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1014  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiG protein  30 
 
 
332 aa  45.8  0.0007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1686  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiG protein  40.91 
 
 
131 aa  45.8  0.0007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.474342  normal  0.413121 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3373  cobalamin biosynthesis protein CbiG  27.11 
 
 
258 aa  45.8  0.0008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.143651 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2769  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiG protein  42.25 
 
 
152 aa  45.1  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.189555  normal  0.117586 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3649  cobalamin biosynthesis protein CbiG  32.65 
 
 
259 aa  44.3  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1345  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiG protein  44.59 
 
 
132 aa  44.3  0.002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.49198  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0934  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiG protein  27.78 
 
 
425 aa  43.1  0.005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00611922 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2156  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiG protein  38.36 
 
 
144 aa  43.1  0.005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.563547  normal  0.0478382 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2778  cobalamin biosynthesis protein CobE  34.78 
 
 
137 aa  43.1  0.005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.43283  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2353  hypothetical protein  42.62 
 
 
128 aa  43.1  0.005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1227  cobalamin biosynthesis protein CbiG  30.34 
 
 
290 aa  42.4  0.007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.382267  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17171  bifunctional cbiH protein and precorrin-3B C17-methyltransferase  21.29 
 
 
600 aa  42.4  0.008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3212  cobalamin biosynthesis protein CbiG  26.57 
 
 
290 aa  42.4  0.008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2296  putative bifunctional protein (CbiGH)  42.86 
 
 
158 aa  42.4  0.009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.192633  normal  0.0156989 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4089  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiG protein  33.82 
 
 
141 aa  42.4  0.009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>