97 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_4998 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010676  Bphyt_4998  cobalamin biosynthesis protein CbiG  100 
 
 
162 aa  323  5e-88  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0542565  hitchhiker  0.0000351412 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3155  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiG protein  48.41 
 
 
144 aa  113  1.0000000000000001e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.418613  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0619  cobalamin biosynthesis protein CbiG  41.89 
 
 
254 aa  100  6e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.25706  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2356  cobalamin biosynthesis protein CbiG  42.86 
 
 
264 aa  92.8  2e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.194675  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1174  cobalamin biosynthesis protein CbiG  40 
 
 
276 aa  75.1  0.0000000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0356012  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0280  cobalamin biosynthesis protein CbiG  40 
 
 
150 aa  74.3  0.0000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00198469  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1618  cobalamin biosynthesis protein CbiG  40 
 
 
150 aa  74.3  0.0000000000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2410  cobalamin biosynthesis protein CbiG  43.31 
 
 
318 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00863167  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4801  cobalamin biosynthesis protein CbiG  36.43 
 
 
125 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.585361  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1627  cobalamin biosynthesis protein CbiG  37.23 
 
 
124 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.502118  normal  0.0158089 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1553  cobalamin biosynthesis protein CbiG  37.86 
 
 
125 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.272579  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1572  cobalamin biosynthesis protein CbiG  37.86 
 
 
125 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.138843 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1653  cobalamin biosynthesis protein CbiG  36.43 
 
 
125 aa  66.2  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.990326  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1718  precorrin-4 C11-methyltransferase  32.12 
 
 
598 aa  65.9  0.0000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.956767  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1295  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiG protein  34.51 
 
 
368 aa  65.9  0.0000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0452493 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2608  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiG protein  29.23 
 
 
399 aa  66.2  0.0000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1173  cobalamin biosynthesis protein CbiG  36.43 
 
 
125 aa  66.2  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.16786  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1934  cobalamin biosynthesis protein CbiG  39.26 
 
 
146 aa  65.5  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0439527  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1950  cobalamin biosynthesis protein CbiG  41.36 
 
 
146 aa  65.5  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.418515  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3540  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiG protein  37.96 
 
 
347 aa  65.1  0.0000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0472  cobalamin biosynthesis protein CbiG  35.37 
 
 
276 aa  65.9  0.0000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0040  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiG protein  33.09 
 
 
353 aa  64.7  0.0000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2993  cobalamin biosynthesis protein CbiG, putative  36.43 
 
 
351 aa  64.3  0.0000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3606  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiG protein  36.23 
 
 
347 aa  63.2  0.000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2095  cobalamin biosynthesis protein CbiG  38.65 
 
 
149 aa  63.2  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.336042  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2710  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiG protein  36.73 
 
 
354 aa  62.4  0.000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.329819  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0484  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiG protein  37.14 
 
 
351 aa  62.4  0.000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1558  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiG protein  30.1 
 
 
357 aa  60.8  0.000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0572  precorrin-3B C17-methyltransferase  33.96 
 
 
800 aa  60.8  0.000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1377  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiG protein  31.65 
 
 
351 aa  60.8  0.000000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1852  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiG protein  40.59 
 
 
279 aa  60.5  0.000000009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1299  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiG protein  30.99 
 
 
379 aa  60.1  0.00000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0934  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiG protein  32.14 
 
 
425 aa  60.1  0.00000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00611922 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1997  precorrin-3B C17-methyltransferase region  34.62 
 
 
537 aa  59.7  0.00000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0124664  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0903  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiG protein  28.37 
 
 
323 aa  57  0.00000009  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17171  bifunctional cbiH protein and precorrin-3B C17-methyltransferase  29.08 
 
 
600 aa  57.4  0.00000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1617  precorrin-3 methyltransferase  27.97 
 
 
606 aa  56.6  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.481163  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1017  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiG protein  35.56 
 
 
134 aa  55.8  0.0000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.959197  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4089  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiG protein  34 
 
 
141 aa  55.8  0.0000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3230  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiG protein  34.13 
 
 
357 aa  56.2  0.0000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.106675  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3628  precorrin-3B C17-methyltransferase  28.47 
 
 
623 aa  55.5  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2485  precorrin-3B C17-methyltransferase  28.47 
 
 
623 aa  55.8  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17291  bifunctional cbiH protein and precorrin-3B C17-methyltransferase  29.79 
 
 
600 aa  55.5  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.792145  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0480  cobalamin biosynthesis protein  37.08 
 
 
135 aa  55.1  0.0000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0445  cobalamin biosynthesis protein  37.08 
 
 
135 aa  55.1  0.0000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.281465  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19561  bifunctional cbiH protein and precorrin-3B C17-methyltransferase  31.31 
 
 
593 aa  55.1  0.0000004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1264  precorrin-3B C17-methyltransferase  35.71 
 
 
778 aa  55.1  0.0000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0075  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiG protein  32.97 
 
 
152 aa  54.7  0.0000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21210  precorrin-4 C11-methyltransferase  39.36 
 
 
867 aa  54.7  0.0000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1081  precorrin-3 methyltransferase  30.3 
 
 
593 aa  53.9  0.0000009  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1079  cobalamin biosynthesis protein CbiG  35.07 
 
 
289 aa  53.1  0.000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4366  precorrin-3 methyltransferase  32 
 
 
663 aa  52.8  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.216409 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2778  cobalamin biosynthesis protein CobE  36.04 
 
 
137 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.43283  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1079  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiG protein  28.47 
 
 
323 aa  52.8  0.000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1014  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiG protein  31.06 
 
 
332 aa  53.1  0.000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0838  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiG protein  26.95 
 
 
323 aa  53.1  0.000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.167438  normal 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3649  cobalamin biosynthesis protein CbiG  32.86 
 
 
259 aa  52.4  0.000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3743  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiG protein  39.36 
 
 
401 aa  52.4  0.000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2531  cobalamin biosynthesis protein CobE  35.11 
 
 
128 aa  52  0.000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.573883  hitchhiker  0.00728118 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2769  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiG protein  40.22 
 
 
152 aa  52  0.000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.189555  normal  0.117586 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1686  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiG protein  34.07 
 
 
131 aa  51.2  0.000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.474342  normal  0.413121 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0637  precorrin-3B C17-methyltransferase  36.08 
 
 
837 aa  51.2  0.000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.647433 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1227  cobalamin biosynthesis protein CbiG  30.66 
 
 
290 aa  51.2  0.000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.382267  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3129  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiG protein  29.23 
 
 
132 aa  50.8  0.000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1818  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiG protein  26.95 
 
 
323 aa  50.8  0.000008  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0511  cobalamin biosynthesis protein CbiG  35.07 
 
 
290 aa  50.8  0.000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17041  bifunctional cbiH protein and precorrin-3B C17-methyltransferase  25.87 
 
 
604 aa  50.1  0.00001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2156  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiG protein  35.16 
 
 
144 aa  49.7  0.00002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.563547  normal  0.0478382 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2501  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiG protein  38.73 
 
 
427 aa  48.9  0.00003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1675  precorrin-3B C17-methyltransferase  32.97 
 
 
629 aa  48.9  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0615  cobalamin biosynthesis protein CbiG  29.08 
 
 
347 aa  48.9  0.00003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000212021  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1345  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiG protein  38.1 
 
 
132 aa  48.9  0.00003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.49198  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1093  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiG protein  37.86 
 
 
365 aa  48.5  0.00004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6033  precorrin-3B C17-methyltransferase  30.47 
 
 
810 aa  48.1  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.038685  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3373  cobalamin biosynthesis protein CbiG  28 
 
 
258 aa  47.8  0.00006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.143651 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16381  bifunctional cbiH protein and precorrin-3B C18-methyltransferace  30.28 
 
 
620 aa  47.8  0.00007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2015  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiG protein  32.72 
 
 
424 aa  47.4  0.00008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00297302  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3212  cobalamin biosynthesis protein CbiG  32.59 
 
 
290 aa  46.6  0.0001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0539  hypothetical protein  34.33 
 
 
140 aa  47  0.0001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0379  precorrin-3B C17-methyltransferase  29 
 
 
631 aa  45.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0036  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiG protein  27.46 
 
 
329 aa  45.8  0.0002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.384647  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4477  precorrin-4 C11-methyltransferase  28.12 
 
 
610 aa  46.2  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00717843  normal  0.120162 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0935  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiG protein  30.77 
 
 
350 aa  45.8  0.0003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1586  cobalamin biosynthesis protein CbiG  38.69 
 
 
124 aa  44.7  0.0005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0533401 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1720  cobalamin biosynthesis protein CbiG  31.34 
 
 
290 aa  45.1  0.0005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4162  precorrin-4 C11-methyltransferase  32 
 
 
958 aa  44.7  0.0006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.329616  normal  0.542159 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2353  hypothetical protein  31.91 
 
 
128 aa  44.3  0.0007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2084  cobalamin biosynthesis protein CbiG-like protein  32.29 
 
 
508 aa  43.9  0.0009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1429  cobalamin biosynthesis protein CbiG  26.26 
 
 
332 aa  43.5  0.001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00979138  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3019  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiG protein  31.25 
 
 
149 aa  43.9  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.108721  normal  0.148561 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0049  Uroporphyrin-III C/tetrapyrrole (Corrin/Porphyrin) methyltransferase  28.71 
 
 
824 aa  43.5  0.001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.749856  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3102  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiG protein  39.13 
 
 
137 aa  42.7  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2636  precorrin-3B C17-methyltransferase  33.33 
 
 
612 aa  42.4  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.168127  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1273  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiG protein  27.55 
 
 
340 aa  42.7  0.002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2702  precorrin-3B C17-methyltransferase  30.66 
 
 
574 aa  42.4  0.003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000152397 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3383  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiG protein  34.04 
 
 
464 aa  40.4  0.01  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.538003  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2520  precorrin-3B C17-methyltransferase  31.37 
 
 
577 aa  40.4  0.01  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>