47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen_1173 on replicon NC_008060
Organism: Burkholderia cenocepacia AU 1054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008060  Bcen_1173  cobalamin biosynthesis protein CbiG  100 
 
 		 125 aa  234  4e-61  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.16786  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1653  cobalamin biosynthesis protein CbiG  100 
 
 		 125 aa  234  4e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.990326  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1627  cobalamin biosynthesis protein CbiG  96.77 
 
 		 124 aa  222  1e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.502118  normal  0.0158089 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4801  cobalamin biosynthesis protein CbiG  95.2 
 
 		 125 aa  221  3e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.585361  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1553  cobalamin biosynthesis protein CbiG  86.4 
 
 		 125 aa  192  2e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.272579  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1572  cobalamin biosynthesis protein CbiG  85.6 
 
 		 125 aa  189  9e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.138843 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1586  cobalamin biosynthesis protein CbiG  82.26 
 
 		 124 aa  151  2.9999999999999998e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0533401 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1934  cobalamin biosynthesis protein CbiG  49.34 
 
 		 146 aa  77  0.00000000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0439527  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1950  cobalamin biosynthesis protein CbiG  49.34 
 
 		 146 aa  75.5  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.418515  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0280  cobalamin biosynthesis protein CbiG  52 
 
 		 150 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00198469  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1618  cobalamin biosynthesis protein CbiG  52 
 
 		 150 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1174  cobalamin biosynthesis protein CbiG  49.33 
 
 		 276 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0356012  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2095  cobalamin biosynthesis protein CbiG  47.74 
 
 		 149 aa  72  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.336042  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3155  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiG protein  42.28 
 
 		 144 aa  69.3  0.00000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.418613  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2410  cobalamin biosynthesis protein CbiG  50.7 
 
 		 318 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00863167  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0619  cobalamin biosynthesis protein CbiG  40.68 
 
 		 254 aa  67.4  0.00000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.25706  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2356  cobalamin biosynthesis protein CbiG  43.59 
 
 		 264 aa  63.5  0.0000000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.194675  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4998  cobalamin biosynthesis protein CbiG  35.97 
 
 		 162 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0542565  hitchhiker  0.0000351412 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1558  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiG protein  29.75 
 
 		 357 aa  53.5  0.0000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2608  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiG protein  29.75 
 
 		 399 aa  52  0.000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1227  cobalamin biosynthesis protein CbiG  34.17 
 
 		 290 aa  51.2  0.000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.382267  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1295  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiG protein  29.84 
 
 		 368 aa  50.8  0.000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0452493 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0040  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiG protein  31.97 
 
 		 353 aa  47.8  0.00004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0484  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiG protein  35.25 
 
 		 351 aa  48.1  0.00004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3212  cobalamin biosynthesis protein CbiG  32.5 
 
 		 290 aa  47.8  0.00005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3540  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiG protein  34.96 
 
 		 347 aa  46.6  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2778  cobalamin biosynthesis protein CobE  36.59 
 
 		 137 aa  45.4  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.43283  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3606  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiG protein  32.52 
 
 		 347 aa  45.4  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1264  precorrin-3B C17-methyltransferase  38.52 
 
 		 778 aa  45.8  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0511  cobalamin biosynthesis protein CbiG  39.5 
 
 		 290 aa  45.8  0.0002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19561  bifunctional cbiH protein and precorrin-3B C17-methyltransferase  28.68 
 
 		 593 aa  45.8  0.0002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0049  Uroporphyrin-III C/tetrapyrrole (Corrin/Porphyrin) methyltransferase  32.28 
 
 		 824 aa  44.7  0.0004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.749856  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3649  cobalamin biosynthesis protein CbiG  33.87 
 
 		 259 aa  44.7  0.0004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1081  precorrin-3 methyltransferase  27.91 
 
 		 593 aa  44.7  0.0005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1299  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiG protein  30.08 
 
 		 379 aa  44.7  0.0005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1093  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiG protein  37.7 
 
 		 365 aa  43.9  0.0007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1079  cobalamin biosynthesis protein CbiG  30.51 
 
 		 289 aa  43.5  0.0009  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0802  precorrin-3B C17-methyltransferase  41.67 
 
 		 547 aa  43.1  0.001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0804272  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0572  precorrin-3B C17-methyltransferase  36.29 
 
 		 800 aa  42.7  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2710  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiG protein  32.2 
 
 		 354 aa  42.7  0.002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.329819  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0145  cobalamin biosynthesis protein CbiG  33.33 
 
 		 254 aa  42  0.003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.685754  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0539  hypothetical protein  36.67 
 
 		 140 aa  42  0.003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1852  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiG protein  36.97 
 
 		 279 aa  41.6  0.004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4089  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiG protein  31.78 
 
 		 141 aa  41.2  0.005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2993  cobalamin biosynthesis protein CbiG, putative  31.97 
 
 		 351 aa  40.8  0.006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0480  cobalamin biosynthesis protein  37.84 
 
 		 135 aa  40  0.01  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0445  cobalamin biosynthesis protein  37.84 
 
 		 135 aa  40  0.01  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.281465  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>