68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS668_1934 on replicon NC_009074
Organism: Burkholderia pseudomallei 668



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009074  BURPS668_1934  cobalamin biosynthesis protein CbiG  100 
 
 		 146 aa  273  7e-73  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0439527  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1174  cobalamin biosynthesis protein CbiG  96 
 
 		 276 aa  208  2e-53  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0356012  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0280  cobalamin biosynthesis protein CbiG  96 
 
 		 150 aa  207  3e-53  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00198469  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1618  cobalamin biosynthesis protein CbiG  96 
 
 		 150 aa  207  3e-53  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1950  cobalamin biosynthesis protein CbiG  91.78 
 
 		 146 aa  192  1e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.418515  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2095  cobalamin biosynthesis protein CbiG  89.93 
 
 		 149 aa  186  1e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.336042  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2410  cobalamin biosynthesis protein CbiG  83.56 
 
 		 318 aa  156  9e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00863167  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4801  cobalamin biosynthesis protein CbiG  54.79 
 
 		 125 aa  110  6e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.585361  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1553  cobalamin biosynthesis protein CbiG  54.79 
 
 		 125 aa  108  4.0000000000000004e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.272579  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3155  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiG protein  50.69 
 
 		 144 aa  106  1e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.418613  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1627  cobalamin biosynthesis protein CbiG  54.48 
 
 		 124 aa  106  1e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.502118  normal  0.0158089 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0619  cobalamin biosynthesis protein CbiG  48.2 
 
 		 254 aa  105  2e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.25706  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1173  cobalamin biosynthesis protein CbiG  53.42 
 
 		 125 aa  103  8e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.16786  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1653  cobalamin biosynthesis protein CbiG  53.42 
 
 		 125 aa  103  8e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.990326  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1572  cobalamin biosynthesis protein CbiG  52.74 
 
 		 125 aa  98.6  3e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.138843 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4998  cobalamin biosynthesis protein CbiG  40 
 
 		 162 aa  91.7  3e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0542565  hitchhiker  0.0000351412 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1586  cobalamin biosynthesis protein CbiG  53.1 
 
 		 124 aa  80.9  0.000000000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0533401 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1295  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiG protein  33.33 
 
 		 368 aa  72.8  0.000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0452493 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1852  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiG protein  41.43 
 
 		 279 aa  67.8  0.00000000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0480  cobalamin biosynthesis protein  49.32 
 
 		 135 aa  65.9  0.0000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0445  cobalamin biosynthesis protein  49.32 
 
 		 135 aa  65.9  0.0000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.281465  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2356  cobalamin biosynthesis protein CbiG  42.75 
 
 		 264 aa  65.9  0.0000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.194675  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1093  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiG protein  38.85 
 
 		 365 aa  64.3  0.0000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3606  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiG protein  35.92 
 
 		 347 aa  63.9  0.0000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3540  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiG protein  38.41 
 
 		 347 aa  62.4  0.000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1377  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiG protein  27.86 
 
 		 351 aa  59.7  0.00000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2993  cobalamin biosynthesis protein CbiG, putative  33.33 
 
 		 351 aa  59.3  0.00000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2710  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiG protein  31.39 
 
 		 354 aa  58.2  0.00000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.329819  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0484  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiG protein  35.46 
 
 		 351 aa  57.4  0.00000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1558  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiG protein  28.33 
 
 		 357 aa  57  0.00000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2608  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiG protein  30 
 
 		 399 aa  56.2  0.0000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3230  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiG protein  34.04 
 
 		 357 aa  56.2  0.0000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.106675  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1017  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiG protein  43.06 
 
 		 134 aa  53.5  0.0000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.959197  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0040  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiG protein  28.87 
 
 		 353 aa  53.5  0.0000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0572  precorrin-3B C17-methyltransferase  37.86 
 
 		 800 aa  53.5  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1299  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiG protein  28.26 
 
 		 379 aa  50.1  0.000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1429  cobalamin biosynthesis protein CbiG  26.43 
 
 		 332 aa  49.7  0.00001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00979138  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1014  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiG protein  30.88 
 
 		 332 aa  48.9  0.00002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3649  cobalamin biosynthesis protein CbiG  33.57 
 
 		 259 aa  49.3  0.00002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1264  precorrin-3B C17-methyltransferase  33.57 
 
 		 778 aa  49.3  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21210  precorrin-4 C11-methyltransferase  36.43 
 
 		 867 aa  48.5  0.00003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0934  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiG protein  27.14 
 
 		 425 aa  47  0.0001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00611922 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0637  precorrin-3B C17-methyltransferase  35.07 
 
 		 837 aa  46.6  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.647433 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3373  cobalamin biosynthesis protein CbiG  28.28 
 
 		 258 aa  45.8  0.0002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.143651 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3129  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiG protein  38.36 
 
 		 132 aa  45.8  0.0002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3743  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiG protein  46.15 
 
 		 401 aa  45.4  0.0003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1227  cobalamin biosynthesis protein CbiG  29.79 
 
 		 290 aa  44.3  0.0005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.382267  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2769  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiG protein  42.25 
 
 		 152 aa  44.3  0.0005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.189555  normal  0.117586 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2778  cobalamin biosynthesis protein CobE  30.5 
 
 		 137 aa  44.3  0.0005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.43283  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0036  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiG protein  25.66 
 
 		 329 aa  44.3  0.0005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.384647  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1686  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiG protein  40.91 
 
 		 131 aa  43.9  0.0007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.474342  normal  0.413121 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1345  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiG protein  44.59 
 
 		 132 aa  43.5  0.0008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.49198  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3212  cobalamin biosynthesis protein CbiG  28.06 
 
 		 290 aa  43.5  0.0009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2353  hypothetical protein  43.55 
 
 		 128 aa  43.5  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6033  precorrin-3B C17-methyltransferase  30.3 
 
 		 810 aa  43.1  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.038685  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0075  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiG protein  41.67 
 
 		 152 aa  43.5  0.001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2296  putative bifunctional protein (CbiGH)  42.86 
 
 		 158 aa  42.4  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.192633  normal  0.0156989 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1235  cobalamin biosynthesis protein CbiG  25.71 
 
 		 284 aa  42.4  0.002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0217  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiG protein  35.77 
 
 		 398 aa  42  0.002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2156  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiG protein  38.36 
 
 		 144 aa  42.7  0.002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.563547  normal  0.0478382 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0472  cobalamin biosynthesis protein CbiG  32.61 
 
 		 276 aa  41.6  0.003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19561  bifunctional cbiH protein and precorrin-3B C17-methyltransferase  32.86 
 
 		 593 aa  42  0.003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4089  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiG protein  33.82 
 
 		 141 aa  42  0.003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2531  cobalamin biosynthesis protein CobE  36.23 
 
 		 128 aa  41.6  0.004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.573883  hitchhiker  0.00728118 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0935  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiG protein  33.33 
 
 		 350 aa  41.2  0.005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1079  cobalamin biosynthesis protein CbiG  29.79 
 
 		 289 aa  41.2  0.005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1273  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiG protein  28.37 
 
 		 340 aa  40.8  0.006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1081  precorrin-3 methyltransferase  31.43 
 
 		 593 aa  40.8  0.007  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>