63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BMA10229_A0280 on replicon NC_008836
Organism: Burkholderia mallei NCTC 10229



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006348  BMA1174  cobalamin biosynthesis protein CbiG  100 
 
 
276 aa  282  8e-76  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0356012  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1618  cobalamin biosynthesis protein CbiG  100 
 
 
150 aa  280  5.000000000000001e-75  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0280  cobalamin biosynthesis protein CbiG  100 
 
 
150 aa  280  5.000000000000001e-75  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00198469  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2095  cobalamin biosynthesis protein CbiG  99.33 
 
 
149 aa  275  2e-73  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.336042  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1934  cobalamin biosynthesis protein CbiG  94 
 
 
146 aa  184  3e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0439527  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1950  cobalamin biosynthesis protein CbiG  89.33 
 
 
146 aa  183  7e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.418515  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2410  cobalamin biosynthesis protein CbiG  85.33 
 
 
318 aa  155  2e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00863167  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4801  cobalamin biosynthesis protein CbiG  52.67 
 
 
125 aa  105  1e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.585361  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3155  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiG protein  47.97 
 
 
144 aa  105  2e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.418613  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1553  cobalamin biosynthesis protein CbiG  54 
 
 
125 aa  103  8e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.272579  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0619  cobalamin biosynthesis protein CbiG  48.25 
 
 
254 aa  101  3e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.25706  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1627  cobalamin biosynthesis protein CbiG  52.35 
 
 
124 aa  101  4e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.502118  normal  0.0158089 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1173  cobalamin biosynthesis protein CbiG  51.33 
 
 
125 aa  98.6  2e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.16786  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1653  cobalamin biosynthesis protein CbiG  51.33 
 
 
125 aa  98.6  2e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.990326  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1572  cobalamin biosynthesis protein CbiG  50.67 
 
 
125 aa  94.7  4e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.138843 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4998  cobalamin biosynthesis protein CbiG  39.63 
 
 
162 aa  90.9  5e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0542565  hitchhiker  0.0000351412 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1586  cobalamin biosynthesis protein CbiG  51.01 
 
 
124 aa  77.8  0.00000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0533401 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1295  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiG protein  31.03 
 
 
368 aa  71.6  0.000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0452493 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1852  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiG protein  40.97 
 
 
279 aa  67.4  0.00000000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0445  cobalamin biosynthesis protein  49.32 
 
 
135 aa  65.9  0.0000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.281465  normal 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0480  cobalamin biosynthesis protein  49.32 
 
 
135 aa  65.9  0.0000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2356  cobalamin biosynthesis protein CbiG  39.16 
 
 
264 aa  66.2  0.0000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.194675  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1093  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiG protein  37.76 
 
 
365 aa  63.5  0.0000000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3540  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiG protein  38.73 
 
 
347 aa  62.8  0.000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3606  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiG protein  36.3 
 
 
347 aa  62.8  0.000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1377  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiG protein  27.08 
 
 
351 aa  61.2  0.000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2993  cobalamin biosynthesis protein CbiG, putative  35.86 
 
 
351 aa  60.1  0.000000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2710  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiG protein  30.5 
 
 
354 aa  57.4  0.00000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.329819  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0484  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiG protein  33.79 
 
 
351 aa  57.4  0.00000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1558  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiG protein  37.68 
 
 
357 aa  56.6  0.0000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2608  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiG protein  40.58 
 
 
399 aa  55.5  0.0000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3230  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiG protein  33.79 
 
 
357 aa  55.5  0.0000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.106675  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0040  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiG protein  28.97 
 
 
353 aa  54.7  0.0000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1017  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiG protein  43.06 
 
 
134 aa  53.5  0.000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.959197  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0572  precorrin-3B C17-methyltransferase  36.55 
 
 
800 aa  52.8  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3649  cobalamin biosynthesis protein CbiG  32.65 
 
 
259 aa  48.9  0.00002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1429  cobalamin biosynthesis protein CbiG  25.69 
 
 
332 aa  49.3  0.00002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00979138  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1264  precorrin-3B C17-methyltransferase  32.65 
 
 
778 aa  48.9  0.00003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1299  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiG protein  27.46 
 
 
379 aa  48.5  0.00003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1014  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiG protein  30 
 
 
332 aa  47.4  0.00006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21210  precorrin-4 C11-methyltransferase  35.86 
 
 
867 aa  47.4  0.00008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3129  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiG protein  38.36 
 
 
132 aa  46.2  0.0002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3743  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiG protein  46.15 
 
 
401 aa  45.4  0.0002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0637  precorrin-3B C17-methyltransferase  33.33 
 
 
837 aa  45.1  0.0003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.647433 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3373  cobalamin biosynthesis protein CbiG  27.52 
 
 
258 aa  45.1  0.0003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.143651 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0036  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiG protein  25 
 
 
329 aa  44.3  0.0005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.384647  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1227  cobalamin biosynthesis protein CbiG  30.34 
 
 
290 aa  44.3  0.0006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.382267  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2778  cobalamin biosynthesis protein CobE  33.78 
 
 
137 aa  44.3  0.0006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.43283  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2769  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiG protein  42.25 
 
 
152 aa  44.3  0.0006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.189555  normal  0.117586 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1686  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiG protein  40.91 
 
 
131 aa  43.9  0.0007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.474342  normal  0.413121 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0075  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiG protein  41.67 
 
 
152 aa  43.9  0.0008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2353  hypothetical protein  43.55 
 
 
128 aa  43.5  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1345  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiG protein  44.59 
 
 
132 aa  43.5  0.001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.49198  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3212  cobalamin biosynthesis protein CbiG  26.57 
 
 
290 aa  42.7  0.002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0934  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiG protein  27.78 
 
 
425 aa  42  0.002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00611922 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2296  putative bifunctional protein (CbiGH)  42.86 
 
 
158 aa  42.7  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.192633  normal  0.0156989 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2156  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiG protein  38.36 
 
 
144 aa  42.7  0.002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.563547  normal  0.0478382 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19561  bifunctional cbiH protein and precorrin-3B C17-methyltransferase  32.86 
 
 
593 aa  42  0.003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4089  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiG protein  33.82 
 
 
141 aa  42  0.003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2531  cobalamin biosynthesis protein CobE  36.23 
 
 
128 aa  41.6  0.004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.573883  hitchhiker  0.00728118 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0472  cobalamin biosynthesis protein CbiG  32.39 
 
 
276 aa  40.4  0.007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1081  precorrin-3 methyltransferase  31.43 
 
 
593 aa  40.8  0.007  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0935  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiG protein  31.91 
 
 
350 aa  40.8  0.007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>