23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_5686 on replicon NC_011758
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011758  Mchl_5686  putative CobE protein  100 
 
 		 122 aa  224  4e-58  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.215685  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1035  putative CobE protein  62.99 
 
 		 135 aa  97.8  4e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.166379 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1162  putative CobE protein  64.46 
 
 		 141 aa  85.9  2e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.205405  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2156  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiG protein  56.2 
 
 		 184 aa  79.3  0.00000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0631744  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0967  putative CobE protein  52.07 
 
 		 140 aa  70.5  0.000000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.333911  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3122  putative CobE protein  53.28 
 
 		 134 aa  68.2  0.00000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.73162  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2445  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiG protein  52.03 
 
 		 171 aa  61.6  0.000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0185961  normal  0.116973 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3151  putative CobE protein  56.86 
 
 		 134 aa  52.8  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.409186  normal  0.274603 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3514  putative CobE protein  37.1 
 
 		 125 aa  52.4  0.000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.374002 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2375  putative CobE protein  40.62 
 
 		 130 aa  49.3  0.00002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3261  putative CobE protein  40.8 
 
 		 127 aa  48.9  0.00002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.175493 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1093  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiG protein  37.3 
 
 		 365 aa  48.1  0.00004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2702  precorrin-3B C17-methyltransferase  38.58 
 
 		 574 aa  47  0.00008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000152397 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2217  putative precorrin methylase  42.7 
 
 		 120 aa  45.1  0.0003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.40139  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3373  cobalamin biosynthesis protein CbiG  31.45 
 
 		 258 aa  43.9  0.0007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.143651 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2636  precorrin-3B C17-methyltransferase  35.77 
 
 		 612 aa  43.5  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.168127  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1295  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiG protein  31.54 
 
 		 368 aa  43.5  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0452493 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1747  putative cobalamin biosynthesis protein  36.07 
 
 		 145 aa  41.2  0.004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.161178 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0935  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiG protein  32.8 
 
 		 350 aa  41.2  0.005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2084  cobalamin biosynthesis protein CbiG-like protein  33.05 
 
 		 508 aa  41.2  0.005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1883  cobalamin biosynthesis protein G; CbiG  40.68 
 
 		 129 aa  41.2  0.005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1718  precorrin-4 C11-methyltransferase  34.71 
 
 		 598 aa  40.8  0.006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.956767  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2924  cobalamin biosynthesis domain-containing protein  43.55 
 
 		 120 aa  40.8  0.006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.736142  normal  0.0157734 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>