53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_1162 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011757  Mchl_1162  putative CobE protein  100 
 
 		 141 aa  257  4e-68  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.205405  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1035  putative CobE protein  91.11 
 
 		 135 aa  175  2e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.166379 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0967  putative CobE protein  74.07 
 
 		 140 aa  124  3e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.333911  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2156  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiG protein  57.14 
 
 		 184 aa  102  2e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0631744  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5686  putative CobE protein  64.46 
 
 		 122 aa  99.8  1e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.215685  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3122  putative CobE protein  66.39 
 
 		 134 aa  90.9  6e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.73162  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2445  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiG protein  57.85 
 
 		 171 aa  76.6  0.0000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0185961  normal  0.116973 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3514  putative CobE protein  39.67 
 
 		 125 aa  67  0.00000000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.374002 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1747  putative cobalamin biosynthesis protein  39.34 
 
 		 145 aa  66.2  0.0000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.161178 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3151  putative CobE protein  44.63 
 
 		 134 aa  64.3  0.0000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.409186  normal  0.274603 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2636  precorrin-3B C17-methyltransferase  37.98 
 
 		 612 aa  62.8  0.000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.168127  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2375  putative CobE protein  44.44 
 
 		 130 aa  59.3  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2702  precorrin-3B C17-methyltransferase  41.13 
 
 		 574 aa  55.8  0.0000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000152397 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1295  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiG protein  31.11 
 
 		 368 aa  55.5  0.0000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0452493 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0802  precorrin-3B C17-methyltransferase  41.13 
 
 		 547 aa  54.3  0.0000005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0804272  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0935  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiG protein  31.54 
 
 		 350 aa  53.9  0.0000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3019  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiG protein  34.65 
 
 		 149 aa  53.9  0.0000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.108721  normal  0.148561 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2520  precorrin-3B C17-methyltransferase  42.2 
 
 		 577 aa  52.8  0.000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2778  cobalamin biosynthesis protein CobE  37.01 
 
 		 137 aa  51.6  0.000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.43283  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1301  precorrin-3B C17-methyltransferase, putative  37.1 
 
 		 131 aa  51.2  0.000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1264  putative precorrin-3B C17-methyltransferase  37.1 
 
 		 131 aa  51.2  0.000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0643  precorrin-3 methyltransferase  37.4 
 
 		 561 aa  50.4  0.000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0184568  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1852  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiG protein  35.16 
 
 		 279 aa  50.1  0.00001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3261  putative CobE protein  42.37 
 
 		 127 aa  48.5  0.00003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.175493 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1718  precorrin-4 C11-methyltransferase  31.78 
 
 		 598 aa  48.1  0.00004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.956767  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2368  putative precorrin-3B C17-methyltransferase protein  39.34 
 
 		 143 aa  48.1  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.450162  normal  0.0563077 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2126  precorrin-3B C17-methyltransferase protein  40.16 
 
 		 139 aa  47  0.00009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.66936  normal  0.0232718 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1093  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiG protein  35.71 
 
 		 365 aa  47  0.0001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0511  cobalamin biosynthesis protein CbiG  36.67 
 
 		 290 aa  47  0.0001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0807  putative cobalamin biosynthesis protein  48.41 
 
 		 142 aa  45.8  0.0002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2214  hypothetical protein  37.37 
 
 		 142 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.693941  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0145  cobalamin biosynthesis protein CbiG  32.5 
 
 		 254 aa  45.1  0.0003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.685754  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1273  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiG protein  26.36 
 
 		 340 aa  44.7  0.0004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2197  cobalamin biosynthesis protein CbiG  33.62 
 
 		 351 aa  44.3  0.0007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2204  cobalamin biosynthesis protein CbiG  33.62 
 
 		 351 aa  43.9  0.0008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2250  cobalamin biosynthesis protein CbiG  33.62 
 
 		 351 aa  43.9  0.0008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.662898  normal  0.279224 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2363  cobalamin biosynthesis protein CbiG  33.62 
 
 		 351 aa  43.9  0.0008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.518108  normal  0.79543 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1474  putative precorrin methylase  41.32 
 
 		 124 aa  43.1  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.571775 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6033  precorrin-3B C17-methyltransferase  32.2 
 
 		 810 aa  43.1  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.038685  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1264  precorrin-3B C17-methyltransferase  37.59 
 
 		 778 aa  42.7  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2822  putative precorrin methylase  41.32 
 
 		 124 aa  43.1  0.001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2150  cobalamin biosynthesis protein CbiG  33.93 
 
 		 351 aa  42.7  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.118541  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3649  cobalamin biosynthesis protein CbiG  31.97 
 
 		 259 aa  42  0.003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3373  cobalamin biosynthesis protein CbiG  26.32 
 
 		 258 aa  42  0.003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.143651 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1882  precorrin-3B C17-methyltransferase, putative  36.89 
 
 		 137 aa  41.6  0.004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.809661  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0217  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiG protein  33.59 
 
 		 398 aa  41.6  0.004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0572  precorrin-3B C17-methyltransferase  29.32 
 
 		 800 aa  41.6  0.004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16381  bifunctional cbiH protein and precorrin-3B C18-methyltransferace  30.09 
 
 		 620 aa  41.2  0.004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1883  cobalamin biosynthesis protein G; CbiG  44.35 
 
 		 129 aa  41.2  0.005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2531  cobalamin biosynthesis protein CobE  37.3 
 
 		 128 aa  41.2  0.005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.573883  hitchhiker  0.00728118 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3183  cobalamin biosynthesis protein G; CbiG  37.23 
 
 		 130 aa  40.8  0.006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.794045  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1997  precorrin-3B C17-methyltransferase region  31.19 
 
 		 537 aa  40.8  0.006  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0124664  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0637  precorrin-3B C17-methyltransferase  30 
 
 		 837 aa  40.8  0.007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.647433 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>