28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_1474 on replicon NC_009049
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007493  RSP_2822  putative precorrin methylase  100 
 
 		 124 aa  224  2e-58  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1474  putative precorrin methylase  100 
 
 		 124 aa  224  2e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.571775 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1524  hypothetical protein  80.95 
 
 		 126 aa  129  1.0000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.412752 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2217  putative precorrin methylase  45.38 
 
 		 120 aa  74.3  0.0000000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.40139  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0539  hypothetical protein  44.07 
 
 		 140 aa  65.1  0.0000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0802  precorrin-3B C17-methyltransferase  44.17 
 
 		 547 aa  65.1  0.0000000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0804272  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1997  precorrin-3B C17-methyltransferase region  39.78 
 
 		 537 aa  55.8  0.0000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0124664  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16381  bifunctional cbiH protein and precorrin-3B C18-methyltransferace  36.73 
 
 		 620 aa  54.3  0.0000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1718  precorrin-4 C11-methyltransferase  32.79 
 
 		 598 aa  53.9  0.0000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.956767  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17291  bifunctional cbiH protein and precorrin-3B C17-methyltransferase  32.58 
 
 		 600 aa  53.5  0.0000009  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.792145  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17041  bifunctional cbiH protein and precorrin-3B C17-methyltransferase  35.11 
 
 		 604 aa  52.8  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17171  bifunctional cbiH protein and precorrin-3B C17-methyltransferase  32.58 
 
 		 600 aa  49.3  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1617  precorrin-3 methyltransferase  29.47 
 
 		 606 aa  48.5  0.00003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.481163  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3514  putative CobE protein  35.77 
 
 		 125 aa  45.4  0.0002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.374002 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2156  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiG protein  41.73 
 
 		 184 aa  44.7  0.0004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0631744  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2296  putative bifunctional protein (CbiGH)  33.79 
 
 		 158 aa  42.7  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.192633  normal  0.0156989 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0484  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiG protein  30.77 
 
 		 351 aa  42.4  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0082  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiG protein  25.83 
 
 		 350 aa  42  0.003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.243954 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4089  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiG protein  32.26 
 
 		 141 aa  41.6  0.004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1288  precorrin-4 C11-methyltransferase  31.58 
 
 		 626 aa  41.6  0.004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2710  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiG protein  27.5 
 
 		 354 aa  41.2  0.005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.329819  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3129  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiG protein  37.63 
 
 		 132 aa  41.2  0.005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0329  precorrin-3 methyltransferase  37.17 
 
 		 579 aa  41.2  0.005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.189951 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1081  precorrin-3 methyltransferase  31.11 
 
 		 593 aa  40.8  0.006  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19561  bifunctional cbiH protein and precorrin-3B C17-methyltransferase  26.19 
 
 		 593 aa  40.8  0.006  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3181  precorrin-3 methyltransferase  46.3 
 
 		 655 aa  40.4  0.007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1093  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiG protein  32 
 
 		 365 aa  40.4  0.009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3628  precorrin-3B C17-methyltransferase  31.25 
 
 		 623 aa  40  0.01  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>