51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_1035 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_1035  putative CobE protein  100 
 
 		 135 aa  245  1e-64  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.166379 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1162  putative CobE protein  91.11 
 
 		 141 aa  160  6e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.205405  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0967  putative CobE protein  73.64 
 
 		 140 aa  113  6.9999999999999995e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.333911  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5686  putative CobE protein  62.99 
 
 		 122 aa  104  5e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.215685  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2156  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiG protein  56.69 
 
 		 184 aa  95.5  2e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0631744  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3122  putative CobE protein  67.21 
 
 		 134 aa  90.1  8e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.73162  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2445  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiG protein  55.12 
 
 		 171 aa  72.4  0.000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0185961  normal  0.116973 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3151  putative CobE protein  45.53 
 
 		 134 aa  67.4  0.00000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.409186  normal  0.274603 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1747  putative cobalamin biosynthesis protein  41.46 
 
 		 145 aa  67  0.00000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.161178 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3514  putative CobE protein  38.02 
 
 		 125 aa  63.5  0.0000000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.374002 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2636  precorrin-3B C17-methyltransferase  39.02 
 
 		 612 aa  62.4  0.000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.168127  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2375  putative CobE protein  44.09 
 
 		 130 aa  58.5  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2702  precorrin-3B C17-methyltransferase  38.81 
 
 		 574 aa  55.1  0.0000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000152397 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3261  putative CobE protein  44.26 
 
 		 127 aa  54.3  0.0000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.175493 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2924  cobalamin biosynthesis domain-containing protein  41.67 
 
 		 120 aa  54.3  0.0000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.736142  normal  0.0157734 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3019  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiG protein  34.85 
 
 		 149 aa  53.5  0.0000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.108721  normal  0.148561 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1852  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiG protein  33.88 
 
 		 279 aa  52  0.000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1295  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiG protein  29.32 
 
 		 368 aa  50.8  0.000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0452493 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0511  cobalamin biosynthesis protein CbiG  37.5 
 
 		 290 aa  50.4  0.000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1718  precorrin-4 C11-methyltransferase  31.3 
 
 		 598 aa  49.7  0.00001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.956767  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0935  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiG protein  30.23 
 
 		 350 aa  50.1  0.00001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1273  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiG protein  27.13 
 
 		 340 aa  48.9  0.00002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0643  precorrin-3 methyltransferase  37.3 
 
 		 561 aa  48.5  0.00003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0184568  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0807  putative cobalamin biosynthesis protein  47.76 
 
 		 142 aa  48.1  0.00004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0802  precorrin-3B C17-methyltransferase  38.71 
 
 		 547 aa  47.8  0.00005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0804272  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2520  precorrin-3B C17-methyltransferase  40.2 
 
 		 577 aa  47.8  0.00005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1093  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiG protein  35.71 
 
 		 365 aa  46.6  0.0001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2778  cobalamin biosynthesis protein CobE  36.22 
 
 		 137 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.43283  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0145  cobalamin biosynthesis protein CbiG  33.33 
 
 		 254 aa  45.1  0.0003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.685754  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2126  precorrin-3B C17-methyltransferase protein  39.34 
 
 		 139 aa  44.7  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.66936  normal  0.0232718 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1997  precorrin-3B C17-methyltransferase region  31.53 
 
 		 537 aa  44.3  0.0006  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0124664  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3649  cobalamin biosynthesis protein CbiG  31.97 
 
 		 259 aa  43.9  0.0007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3409  cobalamin biosynthesis protein cobE, putative  33.33 
 
 		 129 aa  43.9  0.0008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.34231 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0217  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiG protein  34.38 
 
 		 398 aa  43.9  0.0008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1264  putative precorrin-3B C17-methyltransferase  36.43 
 
 		 131 aa  43.1  0.001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0040  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiG protein  30.16 
 
 		 353 aa  43.1  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1301  precorrin-3B C17-methyltransferase, putative  36.43 
 
 		 131 aa  43.1  0.001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2368  putative precorrin-3B C17-methyltransferase protein  38.52 
 
 		 143 aa  43.5  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.450162  normal  0.0563077 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0637  precorrin-3B C17-methyltransferase  36.59 
 
 		 837 aa  42.4  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.647433 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16381  bifunctional cbiH protein and precorrin-3B C18-methyltransferace  29.57 
 
 		 620 aa  42.4  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3373  cobalamin biosynthesis protein CbiG  26.77 
 
 		 258 aa  42  0.003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.143651 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1264  precorrin-3B C17-methyltransferase  40 
 
 		 778 aa  41.2  0.004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0572  precorrin-3B C17-methyltransferase  29.32 
 
 		 800 aa  41.6  0.004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2353  hypothetical protein  32.54 
 
 		 128 aa  41.6  0.004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4588  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiG protein  34.33 
 
 		 142 aa  41.6  0.004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.0000406351  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3230  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiG protein  31.75 
 
 		 357 aa  41.2  0.005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.106675  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0472  cobalamin biosynthesis protein CbiG  29.41 
 
 		 276 aa  41.2  0.005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1883  cobalamin biosynthesis protein G; CbiG  43.48 
 
 		 129 aa  40.8  0.006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2214  hypothetical protein  38.61 
 
 		 142 aa  40.8  0.006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.693941  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1227  cobalamin biosynthesis protein CbiG  29.66 
 
 		 290 aa  40.8  0.006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.382267  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2531  cobalamin biosynthesis protein CobE  38.1 
 
 		 128 aa  40  0.01  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.573883  hitchhiker  0.00728118 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>