21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_2375 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_2375  putative CobE protein  100 
 
 		 130 aa  244  3e-64  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2315  cobalamin biosynthesis protein G; CbiG  73.85 
 
 		 130 aa  142  2e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.109099  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3183  cobalamin biosynthesis protein G; CbiG  61.72 
 
 		 130 aa  95.5  2e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.794045  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1883  cobalamin biosynthesis protein G; CbiG  55.04 
 
 		 129 aa  85.5  2e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2156  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiG protein  45.22 
 
 		 184 aa  58.5  0.00000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0631744  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3151  putative CobE protein  41.44 
 
 		 134 aa  55.8  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.409186  normal  0.274603 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1035  putative CobE protein  44.09 
 
 		 135 aa  49.7  0.00001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.166379 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1718  precorrin-4 C11-methyltransferase  35 
 
 		 598 aa  48.1  0.00004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.956767  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3514  putative CobE protein  34.43 
 
 		 125 aa  47.8  0.00005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.374002 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5686  putative CobE protein  41.41 
 
 		 122 aa  47.4  0.00007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.215685  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2710  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiG protein  32.35 
 
 		 354 aa  47  0.00009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.329819  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1295  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiG protein  30.09 
 
 		 368 aa  47  0.0001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0452493 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0472  cobalamin biosynthesis protein CbiG  33.07 
 
 		 276 aa  44.7  0.0004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0935  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiG protein  33.63 
 
 		 350 aa  45.1  0.0004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2445  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiG protein  46.9 
 
 		 171 aa  43.5  0.0009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0185961  normal  0.116973 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1299  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiG protein  32.29 
 
 		 379 aa  43.1  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3155  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiG protein  36.52 
 
 		 144 aa  42.4  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.418613  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2924  cobalamin biosynthesis domain-containing protein  38.89 
 
 		 120 aa  42.4  0.002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.736142  normal  0.0157734 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0802  precorrin-3B C17-methyltransferase  35.43 
 
 		 547 aa  41.6  0.004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0804272  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2778  cobalamin biosynthesis protein CobE  37.5 
 
 		 137 aa  40.8  0.007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.43283  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2126  precorrin-3B C17-methyltransferase protein  34.07 
 
 		 139 aa  40.4  0.008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.66936  normal  0.0232718 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>