13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_3752 on replicon NC_008043
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008043  TM1040_3752  hypothetical protein  100 
 
 		 270 aa  546  1e-155  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2455  putative molybdopterin-guanine dinucleotide biosynthesis protein MobB/unknown domain fusion protein  47.56 
 
 		 452 aa  180  2.9999999999999997e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0879303  normal  0.577866 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0463  hypothetical protein  43.8 
 
 		 277 aa  171  1e-41  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.842135  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2391  putative molybdopterin-guanine dinucleotide biosynthesis protein MobB/unknown domain fusion protein  45.12 
 
 		 452 aa  169  4e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0737  putative molybdopterin-guanine dinucleotide biosynthesis protein MobB/unknown domain fusion protein  45.12 
 
 		 452 aa  169  5e-41  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0172  precorrin-8X methylmutase  43.15 
 
 		 512 aa  155  8e-37  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00890226  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3235  hypothetical protein  32.12 
 
 		 305 aa  110  2.0000000000000002e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.658837 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3383  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiG protein  37.5 
 
 		 464 aa  110  3e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.538003  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0232  hypothetical protein  29.27 
 
 		 336 aa  99.4  5e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2639  precorrin isomerase  33.71 
 
 		 499 aa  92.4  7e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0523957  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0884  hypothetical protein  27.43 
 
 		 289 aa  53.9  0.000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.810308 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1251  hypothetical protein  30.71 
 
 		 286 aa  48.5  0.0001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.294808  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0844  hypothetical protein  33.59 
 
 		 262 aa  48.9  0.0001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.322943 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>