115 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A1427 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007643  Rru_A1427  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  100 
 
 
639 aa  1303    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4498  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  77.32 
 
 
663 aa  1028    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.325797 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0072  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  63.81 
 
 
635 aa  840    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0882  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  53.25 
 
 
635 aa  665    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3792  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  62.7 
 
 
635 aa  838    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.117932  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2798  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  47.47 
 
 
672 aa  614  9.999999999999999e-175  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1203  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  46.91 
 
 
674 aa  587  1e-166  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2327  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  48.03 
 
 
621 aa  577  1.0000000000000001e-163  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00453727  normal  0.0261188 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3525  carbon monoxide dehydrogenase  47.39 
 
 
624 aa  574  1.0000000000000001e-162  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0618  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  46.68 
 
 
641 aa  575  1.0000000000000001e-162  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0057  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  47.83 
 
 
645 aa  569  1e-161  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.612526  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1270  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  44.37 
 
 
673 aa  568  1e-161  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00748773  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2098  carbon monoxide dehydrogenase subunit  46.2 
 
 
640 aa  563  1.0000000000000001e-159  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04490  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  47.19 
 
 
632 aa  554  1e-156  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1341  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  47.71 
 
 
623 aa  544  1e-153  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3028  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  47.54 
 
 
625 aa  529  1e-149  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2875  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  45.85 
 
 
626 aa  530  1e-149  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.843098  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2233  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  47.22 
 
 
629 aa  529  1e-149  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0842  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  45.24 
 
 
629 aa  531  1e-149  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.183197  normal  0.106762 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1234  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  45.79 
 
 
629 aa  530  1e-149  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0405701  normal  0.377093 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3780  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  42.54 
 
 
674 aa  528  1e-148  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.288316  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1272  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  43.44 
 
 
628 aa  504  1e-141  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.142133  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1133  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  46.2 
 
 
629 aa  503  1e-141  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.394682  normal  0.139391 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0382  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  44.3 
 
 
631 aa  499  1e-140  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.72739  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0934  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  42.86 
 
 
627 aa  487  1e-136  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.502316  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0884  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  42.79 
 
 
653 aa  476  1e-133  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.17634  normal  0.977834 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3185  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  40.55 
 
 
679 aa  450  1e-125  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.579976  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0335  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  40.95 
 
 
642 aa  446  1.0000000000000001e-124  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2566  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  38.22 
 
 
663 aa  415  1e-114  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1461  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  37.78 
 
 
656 aa  413  1e-114  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000668721  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0870  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  40.33 
 
 
628 aa  411  1e-113  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.404437  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1902  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  36.46 
 
 
669 aa  362  2e-98  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000268472  hitchhiker  0.000000000000110792 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1736  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  36.02 
 
 
666 aa  358  9.999999999999999e-98  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.306274  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0438  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  35.06 
 
 
663 aa  356  6.999999999999999e-97  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.000000530778  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2801  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  35 
 
 
670 aa  347  5e-94  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000137875  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1972  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  33.33 
 
 
655 aa  343  4e-93  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000154748  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0236  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  33.39 
 
 
679 aa  323  6e-87  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1131  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  33.39 
 
 
676 aa  321  3e-86  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000338326  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0860  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  33.18 
 
 
695 aa  316  8e-85  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.199727  normal  0.922779 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2933  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  31.72 
 
 
623 aa  299  1e-79  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000257353  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0652  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  32.72 
 
 
707 aa  297  5e-79  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00052858  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0888  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  31.58 
 
 
629 aa  282  1e-74  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.186953  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2918  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  31.52 
 
 
710 aa  278  3e-73  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0596914  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1166  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  31.14 
 
 
637 aa  276  9e-73  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0149  carbon-monoxide dehydrogenase (acceptor)  30.58 
 
 
680 aa  271  2e-71  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3717  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  30.09 
 
 
634 aa  263  8.999999999999999e-69  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1216  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  28.24 
 
 
648 aa  236  8e-61  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.655192  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1173  hydroxylamine reductase  22.96 
 
 
549 aa  57.4  0.0000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000032867  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1577  hydroxylamine reductase  22.94 
 
 
431 aa  57.4  0.0000009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0690  acetyl-CoA decarbonylase/synthase complex subunit alpha  24.69 
 
 
787 aa  54.3  0.000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.676741  normal  0.475894 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2914  hydroxylamine reductase  26.15 
 
 
554 aa  54.3  0.000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0468  hybrid cluster protein  20.46 
 
 
444 aa  54.3  0.000007  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.0000131773  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2832  hydroxylamine reductase  26.15 
 
 
554 aa  54.3  0.000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.310206  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3011  hydroxylamine reductase  26.15 
 
 
554 aa  54.3  0.000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2542  hydroxylamine reductase  21.32 
 
 
435 aa  53.9  0.000008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0330494  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1363  hydroxylamine reductase  25.64 
 
 
554 aa  53.5  0.00001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3609  hydroxylamine reductase  24 
 
 
552 aa  52.4  0.00002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.918432  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0805  acetyl-CoA decarbonylase/synthase complex subunit alpha  23.84 
 
 
778 aa  52.8  0.00002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.471946  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1174  hydroxylamine reductase  26.25 
 
 
554 aa  52.8  0.00002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0529148  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0219  hydroxylamine reductase  23.61 
 
 
538 aa  53.1  0.00002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1643  hydroxylamine reductase  22.73 
 
 
431 aa  52.8  0.00002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0858  acetyl-CoA decarbonylase/synthase complex subunit alpha  24.53 
 
 
802 aa  52  0.00003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  unclonable  0.00000000764937  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1540  hydroxylamine reductase  21.94 
 
 
442 aa  52.4  0.00003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0105  acetyl-CoA decarbonylase/synthase complex subunit alpha  30.67 
 
 
766 aa  52.4  0.00003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2371  hydroxylamine reductase  23.69 
 
 
550 aa  52  0.00003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0479  hydroxylamine reductase  22.57 
 
 
540 aa  51.6  0.00004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1377  hydroxylamine reductase  21.28 
 
 
441 aa  51.2  0.00006  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0845  hydroxylamine reductase  22.94 
 
 
545 aa  50.8  0.00008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.633582  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0895  hydroxylamine reductase  25.13 
 
 
554 aa  50.8  0.00008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.62617 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3188  hydroxylamine reductase  22.83 
 
 
544 aa  50.4  0.00009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0212462 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1260  hydroxylamine reductase  26.15 
 
 
554 aa  50.4  0.00009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3097  hydroxylamine reductase  26.15 
 
 
554 aa  50.1  0.0001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0213297  normal  0.133055 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1634  hydroxylamine reductase  26.99 
 
 
538 aa  50.1  0.0001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.228305  normal  0.622946 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0981  hydroxylamine reductase  27.81 
 
 
557 aa  49.3  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00091795 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0036  hydroxylamine reductase  23.66 
 
 
542 aa  49.7  0.0002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0754  hydroxylamine reductase  25.26 
 
 
552 aa  49.3  0.0002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2242  hydroxylamine reductase  30.4 
 
 
541 aa  49.7  0.0002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.675401  normal  0.897477 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1302  hydroxylamine reductase  22.22 
 
 
433 aa  49.3  0.0002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1673  acetyl-CoA decarbonylase/synthase complex subunit alpha  23.53 
 
 
778 aa  49.7  0.0002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1293  hydroxylamine reductase  25.64 
 
 
554 aa  49.7  0.0002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.86267  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0466  hydroxylamine reductase  22.59 
 
 
542 aa  49.3  0.0002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003799  hydroxylamine reductase  24.25 
 
 
553 aa  49.3  0.0002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1168  hydroxylamine reductase  22.8 
 
 
552 aa  49.7  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0406  hybrid cluster protein  27.65 
 
 
554 aa  49.7  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3125  hydroxylamine reductase  22.89 
 
 
551 aa  49.3  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0227  acetyl-CoA decarbonylase/synthase complex subunit alpha  23.22 
 
 
778 aa  48.9  0.0003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1165  hydroxylamine reductase  23.59 
 
 
552 aa  48.9  0.0003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0977  hydroxylamine reductase  21.73 
 
 
555 aa  48.5  0.0003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.349617 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2271  hydroxylamine reductase  24.08 
 
 
550 aa  48.9  0.0003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.663099  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2759  hydroxylamine reductase  23.72 
 
 
549 aa  48.5  0.0004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1216  hydroxylamine reductase  25.64 
 
 
554 aa  48.5  0.0004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.453579  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1260  hydroxylamine reductase  23.59 
 
 
552 aa  48.1  0.0004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.181543  hitchhiker  0.000316349 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1424  hydroxylamine reductase  23.36 
 
 
522 aa  48.5  0.0004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.013462  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1069  hydroxylamine reductase  27.03 
 
 
554 aa  48.1  0.0005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0311  acetyl-CoA decarbonylase/synthase complex subunit alpha  23.91 
 
 
779 aa  47.8  0.0007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.435383  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0447  hydroxylamine reductase  21.79 
 
 
454 aa  47.4  0.0008  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2189  hydroxylamine reductase  28 
 
 
538 aa  46.6  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.00125687  normal  0.781035 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0816  hydroxylamine reductase  22.44 
 
 
545 aa  46.6  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0204  acetyl-CoA decarbonylase/synthase complex subunit alpha  22.7 
 
 
806 aa  46.6  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00731411  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0141  hybrid cluster protein  24.7 
 
 
553 aa  46.2  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.409118 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>