195 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A3525 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU2098  carbon monoxide dehydrogenase subunit  50.16 
 
 		 640 aa  643    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0335  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  53.33 
 
 		 642 aa  645    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0934  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  55.09 
 
 		 627 aa  702    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.502316  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3525  carbon monoxide dehydrogenase  100 
 
 		 624 aa  1274    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0057  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  51.96 
 
 		 645 aa  660    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.612526  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3028  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  54.75 
 
 		 625 aa  681    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1272  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  56.34 
 
 		 628 aa  738    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.142133  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1341  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  72.76 
 
 		 623 aa  917    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2875  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  58.6 
 
 		 626 aa  757    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.843098  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1133  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  52.89 
 
 		 629 aa  660    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.394682  normal  0.139391 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2327  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  65.75 
 
 		 621 aa  853    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00453727  normal  0.0261188 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0618  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  49.92 
 
 		 641 aa  638    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0842  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  59 
 
 		 629 aa  761    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.183197  normal  0.106762 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0884  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  56.56 
 
 		 653 aa  715    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.17634  normal  0.977834 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0382  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  55.34 
 
 		 631 aa  702    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.72739  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1234  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  55.29 
 
 		 629 aa  729    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0405701  normal  0.377093 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2233  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  53.21 
 
 		 629 aa  674    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3185  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  50.23 
 
 		 679 aa  636    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.579976  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0882  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  52.76 
 
 		 635 aa  629  1e-179  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2566  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  47.89 
 
 		 663 aa  574  1.0000000000000001e-162  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0870  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  49.92 
 
 		 628 aa  570  1e-161  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.404437  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3792  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  46.07 
 
 		 635 aa  566  1e-160  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.117932  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1427  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  46.99 
 
 		 639 aa  564  1.0000000000000001e-159  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1461  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  46.62 
 
 		 656 aa  560  1e-158  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000668721  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4498  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  46.14 
 
 		 663 aa  556  1e-157  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.325797 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0072  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  47.71 
 
 		 635 aa  557  1e-157  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04490  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  44.62 
 
 		 632 aa  504  1e-141  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1270  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  42.23 
 
 		 673 aa  494  9.999999999999999e-139  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00748773  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1203  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  42.77 
 
 		 674 aa  484  1e-135  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2798  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  41.1 
 
 		 672 aa  469  1.0000000000000001e-131  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3780  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  42.18 
 
 		 674 aa  456  1e-127  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.288316  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1972  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  37.27 
 
 		 655 aa  419  1e-116  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000154748  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1736  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  36.51 
 
 		 666 aa  409  1e-113  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.306274  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0438  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  37.18 
 
 		 663 aa  403  1e-111  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.000000530778  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2801  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  39.3 
 
 		 670 aa  404  1e-111  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000137875  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1902  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  36.03 
 
 		 669 aa  397  1e-109  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000268472  hitchhiker  0.000000000000110792 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1131  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  35.6 
 
 		 676 aa  385  1e-105  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000338326  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0236  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  34.44 
 
 		 679 aa  374  1e-102  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0860  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  34.24 
 
 		 695 aa  362  1e-98  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.199727  normal  0.922779 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1216  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  33.65 
 
 		 648 aa  358  1.9999999999999998e-97  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.655192  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3717  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  35.34 
 
 		 634 aa  357  5e-97  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1166  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  33.92 
 
 		 637 aa  353  4e-96  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0652  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  33.23 
 
 		 707 aa  344  2.9999999999999997e-93  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00052858  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2933  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  33.82 
 
 		 623 aa  339  8e-92  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000257353  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0149  carbon-monoxide dehydrogenase (acceptor)  32.86 
 
 		 680 aa  332  2e-89  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2918  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  31.9 
 
 		 710 aa  328  2.0000000000000001e-88  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0596914  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0888  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  33.6 
 
 		 629 aa  325  2e-87  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.186953  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3576  hydroxylamine reductase  25.81 
 
 		 531 aa  68.9  0.0000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0468  hybrid cluster protein  22.92 
 
 		 444 aa  67.4  0.0000000007  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.0000131773  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3188  hydroxylamine reductase  25.34 
 
 		 544 aa  67.4  0.0000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0212462 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2190  hydroxylamine reductase  23.98 
 
 		 526 aa  66.6  0.000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.317395  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1424  hydroxylamine reductase  25.47 
 
 		 522 aa  66.6  0.000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.013462  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28240  hydroxylamine reductase  23.42 
 
 		 525 aa  64.7  0.000000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.230727 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0406  hybrid cluster protein  24.77 
 
 		 554 aa  63.2  0.00000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1201  hydroxylamine reductase  24.18 
 
 		 531 aa  63.2  0.00000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0742  hydroxylamine reductase  24.42 
 
 		 531 aa  62.4  0.00000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.483638  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3609  hydroxylamine reductase  23.85 
 
 		 552 aa  62  0.00000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.918432  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1168  hydroxylamine reductase  24.66 
 
 		 552 aa  62  0.00000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4621  hydroxylamine reductase  24.26 
 
 		 559 aa  62  0.00000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0716541 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2872  hydroxylamine reductase  23.43 
 
 		 553 aa  61.6  0.00000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.000000295577  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2909  hydroxylamine reductase  21.6 
 
 		 547 aa  61.2  0.00000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1798  hydroxylamine reductase  24.73 
 
 		 557 aa  61.2  0.00000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0674  hydroxylamine reductase  23.65 
 
 		 548 aa  60.8  0.00000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.09718  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1173  hydroxylamine reductase  22.63 
 
 		 549 aa  60.8  0.00000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000032867  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2647  hydroxylamine reductase  24.18 
 
 		 533 aa  60.5  0.0000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.654819  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3446  hydroxylamine reductase  24.94 
 
 		 542 aa  60.1  0.0000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000118604 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0585  hydroxylamine reductase  24.18 
 
 		 533 aa  60.5  0.0000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000760383  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0596  hydroxylamine reductase  26.7 
 
 		 535 aa  60.1  0.0000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3125  hydroxylamine reductase  23.94 
 
 		 551 aa  60.1  0.0000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0837  hydroxylamine reductase  23.9 
 
 		 550 aa  59.7  0.0000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00540032  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2587  hydroxylamine reductase  23.67 
 
 		 547 aa  59.3  0.0000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000431874  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4090  hydroxylamine reductase  23.28 
 
 		 555 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4555  hydroxylamine reductase  23.28 
 
 		 555 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00753041 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0663  hydroxylamine reductase  23.84 
 
 		 541 aa  59.3  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.430546  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3228  hydroxylamine reductase  24.79 
 
 		 568 aa  58.9  0.0000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.892851 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1600  hydroxylamine reductase  23.9 
 
 		 542 aa  58.9  0.0000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1239  hydroxylamine reductase  23.4 
 
 		 549 aa  57.4  0.0000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000262121  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0981  hydroxylamine reductase  23.12 
 
 		 557 aa  57  0.0000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00091795 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2271  hydroxylamine reductase  22.28 
 
 		 550 aa  57.4  0.0000009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.663099  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1120  hydroxylamine reductase  23.4 
 
 		 568 aa  57  0.0000009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.170872  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2941  hydroxylamine reductase  21.58 
 
 		 565 aa  57  0.0000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6194  hydroxylamine reductase  22.96 
 
 		 553 aa  56.6  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.994183  normal  0.0395415 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0213  hydroxylamine reductase  23.59 
 
 		 533 aa  57  0.000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.8548  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0893  hydroxylamine reductase  23.97 
 
 		 546 aa  55.8  0.000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1490  hydroxylamine reductase  23.12 
 
 		 540 aa  55.8  0.000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000660036  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0749  hydroxylamine reductase  23.56 
 
 		 543 aa  56.2  0.000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.000000113817  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1609  hydroxylamine reductase  24.6 
 
 		 542 aa  56.2  0.000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.726092  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1364  hydroxylamine reductase  23.96 
 
 		 549 aa  56.2  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.453221  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2834  hydroxylamine reductase  23.19 
 
 		 547 aa  55.5  0.000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000787255  hitchhiker  0.00000000000275149 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3702  hydroxylamine reductase  24.08 
 
 		 533 aa  55.5  0.000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.456407  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0957  hydroxylamine reductase  24.87 
 
 		 547 aa  55.5  0.000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0479  hydroxylamine reductase  24.1 
 
 		 540 aa  55.1  0.000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3243  hydroxylamine reductase  22.84 
 
 		 428 aa  55.1  0.000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.19186  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3497  hydroxylamine reductase  22.84 
 
 		 428 aa  55.1  0.000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0036  hydroxylamine reductase  23.89 
 
 		 542 aa  55.1  0.000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1054  hydroxylamine reductase  23.63 
 
 		 550 aa  54.7  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0164  hydroxylamine reductase  22.15 
 
 		 546 aa  54.7  0.000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.930451  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1905  hydroxylamine reductase  22.16 
 
 		 427 aa  54.3  0.000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00412747  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1004  hydroxylamine reductase  23.63 
 
 		 550 aa  54.3  0.000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.97662  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3038  hydroxylamine reductase  23.12 
 
 		 549 aa  54.3  0.000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>