177 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apar_0742 on replicon NC_013203
Organism: Atopobium parvulum DSM 20469



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013165  Shel_28240  hydroxylamine reductase  68.44 
 
 		 525 aa  753    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.230727 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2190  hydroxylamine reductase  64.52 
 
 		 526 aa  709    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.317395  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1424  hydroxylamine reductase  64.95 
 
 		 522 aa  702    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.013462  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01080  hydroxylamine reductase  66.54 
 
 		 520 aa  706    Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.626709  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0742  hydroxylamine reductase  100 
 
 		 531 aa  1087    Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.483638  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0214  hydroxylamine reductase  62.83 
 
 		 531 aa  607  9.999999999999999e-173  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.997496 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1173  hydroxylamine reductase  52.97 
 
 		 549 aa  581  1e-164  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000032867  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2641  hydroxylamine reductase  55.84 
 
 		 537 aa  577  1.0000000000000001e-163  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.897837  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0988  hydroxylamine reductase  55.11 
 
 		 539 aa  570  1e-161  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.160693 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3702  hydroxylamine reductase  54.13 
 
 		 533 aa  565  1e-160  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.456407  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3576  hydroxylamine reductase  54.48 
 
 		 531 aa  566  1e-160  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0704  hydroxylamine reductase  54.93 
 
 		 537 aa  567  1e-160  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.308475 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1201  hydroxylamine reductase  55.03 
 
 		 531 aa  563  1.0000000000000001e-159  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3228  hydroxylamine reductase  53.43 
 
 		 568 aa  557  1e-157  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.892851 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0663  hydroxylamine reductase  53.07 
 
 		 541 aa  556  1e-157  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.430546  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0596  hydroxylamine reductase  52.83 
 
 		 535 aa  554  1e-156  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1033  hydroxylamine reductase  53.43 
 
 		 568 aa  553  1e-156  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0213  hydroxylamine reductase  53.56 
 
 		 533 aa  550  1e-155  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.8548  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3446  hydroxylamine reductase  52.26 
 
 		 542 aa  545  1e-154  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000118604 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0585  hydroxylamine reductase  52.65 
 
 		 533 aa  542  1e-153  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000760383  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2647  hydroxylamine reductase  52.65 
 
 		 533 aa  542  1e-153  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.654819  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1609  hydroxylamine reductase  52.17 
 
 		 542 aa  541  1e-153  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.726092  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2386  hydroxylamine reductase  52.45 
 
 		 566 aa  541  1e-153  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00790044  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0974  hydroxylamine reductase  51.18 
 
 		 546 aa  539  9.999999999999999e-153  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00100558  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2872  hydroxylamine reductase  51.15 
 
 		 553 aa  536  1e-151  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.000000295577  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1600  hydroxylamine reductase  51.44 
 
 		 542 aa  535  1e-151  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0837  hydroxylamine reductase  50.36 
 
 		 550 aa  533  1e-150  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00540032  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2941  hydroxylamine reductase  50.09 
 
 		 565 aa  533  1e-150  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1364  hydroxylamine reductase  50.36 
 
 		 549 aa  523  1e-147  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.453221  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1750  hybrid cluster protein  50.46 
 
 		 532 aa  520  1e-146  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.531638  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1798  hydroxylamine reductase  49.46 
 
 		 557 aa  518  1.0000000000000001e-145  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0674  hydroxylamine reductase  49.38 
 
 		 548 aa  512  1e-144  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.09718  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2834  hydroxylamine reductase  49.1 
 
 		 547 aa  513  1e-144  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000787255  hitchhiker  0.00000000000275149 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3188  hydroxylamine reductase  49.64 
 
 		 544 aa  509  1e-143  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0212462 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0977  hydroxylamine reductase  47.41 
 
 		 555 aa  506  9.999999999999999e-143  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.349617 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2909  hydroxylamine reductase  47.2 
 
 		 547 aa  501  1e-140  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2587  hydroxylamine reductase  47.2 
 
 		 547 aa  500  1e-140  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000431874  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1239  hydroxylamine reductase  48.92 
 
 		 549 aa  499  1e-140  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000262121  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0957  hydroxylamine reductase  47.55 
 
 		 547 aa  499  1e-140  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0816  hydroxylamine reductase  48.19 
 
 		 545 aa  498  1e-139  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1121  hydroxylamine reductase  49.82 
 
 		 555 aa  496  1e-139  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.800783  normal  0.249924 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1120  hydroxylamine reductase  45.12 
 
 		 568 aa  498  1e-139  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.170872  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3038  hydroxylamine reductase  48.84 
 
 		 549 aa  495  1e-139  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0036  hydroxylamine reductase  47.54 
 
 		 542 aa  496  1e-139  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1829  hydroxylamine reductase  48.65 
 
 		 545 aa  496  1e-139  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0845  hydroxylamine reductase  48.01 
 
 		 545 aa  495  9.999999999999999e-139  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.633582  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4539  hydroxylamine reductase  47.64 
 
 		 549 aa  493  9.999999999999999e-139  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4165  hydroxylamine reductase  45.97 
 
 		 549 aa  494  9.999999999999999e-139  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1355  hydroxylamine reductase  47.61 
 
 		 557 aa  491  1e-137  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1657  hydroxylamine reductase  47.61 
 
 		 556 aa  491  1e-137  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.922648  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1599  hybrid cluster protein  46.85 
 
 		 549 aa  486  1e-136  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000102791  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0893  hydroxylamine reductase  45.85 
 
 		 546 aa  483  1e-135  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0137  hydroxylamine reductase  55.48 
 
 		 427 aa  482  1e-135  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000271526  normal  0.86078 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0970  hydroxylamine reductase  47.18 
 
 		 591 aa  483  1e-135  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.164641  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0149  hydroxylamine reductase  46.74 
 
 		 542 aa  482  1e-135  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00268758  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3948  hybrid cluster protein  46.95 
 
 		 551 aa  482  1e-135  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1660  hydroxylamine reductase  46.14 
 
 		 562 aa  478  1e-134  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4090  hydroxylamine reductase  48.28 
 
 		 555 aa  478  1e-134  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1634  hydroxylamine reductase  47.97 
 
 		 538 aa  479  1e-134  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.228305  normal  0.622946 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4555  hydroxylamine reductase  48.28 
 
 		 555 aa  478  1e-134  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00753041 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0754  hydroxylamine reductase  48.04 
 
 		 552 aa  479  1e-134  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0164  hydroxylamine reductase  45.21 
 
 		 546 aa  478  1e-134  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.930451  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2846  hydroxylamine reductase  45.31 
 
 		 621 aa  479  1e-134  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2271  hydroxylamine reductase  45.45 
 
 		 550 aa  477  1e-133  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.663099  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1669  hydroxylamine reductase  45.52 
 
 		 540 aa  476  1e-133  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.100106  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6194  hydroxylamine reductase  48.04 
 
 		 553 aa  476  1e-133  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.994183  normal  0.0395415 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2759  hydroxylamine reductase  47.13 
 
 		 549 aa  477  1e-133  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1053  hydroxylamine reductase  45.34 
 
 		 539 aa  476  1e-133  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00878  hydroxylamine reductase  44.64 
 
 		 550 aa  473  1e-132  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2769  hybrid cluster protein  44.64 
 
 		 550 aa  473  1e-132  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0479  hydroxylamine reductase  45.9 
 
 		 540 aa  473  1e-132  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2458  hydroxylamine reductase  44.82 
 
 		 550 aa  473  1e-132  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2371  hydroxylamine reductase  44.31 
 
 		 550 aa  473  1e-132  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0749  hydroxylamine reductase  45.52 
 
 		 543 aa  475  1e-132  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.000000113817  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0977  hydroxylamine reductase  44.64 
 
 		 550 aa  473  1e-132  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00884  hypothetical protein  44.64 
 
 		 550 aa  473  1e-132  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2723  hydroxylamine reductase  44.64 
 
 		 550 aa  473  1e-132  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.18873  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1034  hydroxylamine reductase  44.46 
 
 		 550 aa  471  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2189  hydroxylamine reductase  45.42 
 
 		 538 aa  469  1.0000000000000001e-131  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.00125687  normal  0.781035 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0946  hydroxylamine reductase  44.29 
 
 		 550 aa  469  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.869117  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1055  hydroxylamine reductase  44.66 
 
 		 554 aa  471  1.0000000000000001e-131  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0902  hydroxylamine reductase  44.46 
 
 		 550 aa  470  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.800969 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0981  hydroxylamine reductase  44.5 
 
 		 557 aa  468  9.999999999999999e-131  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00091795 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0972  hydroxylamine reductase  44.29 
 
 		 550 aa  465  9.999999999999999e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1035  hydroxylamine reductase  44.29 
 
 		 550 aa  465  9.999999999999999e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0895  hydroxylamine reductase  43.52 
 
 		 554 aa  466  9.999999999999999e-131  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.62617 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0937  hydroxylamine reductase  44.29 
 
 		 550 aa  465  9.999999999999999e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.697919  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1390  hydroxylamine reductase  44.11 
 
 		 550 aa  468  9.999999999999999e-131  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1707  hydroxylamine reductase  45.2 
 
 		 550 aa  468  9.999999999999999e-131  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1004  hydroxylamine reductase  44.29 
 
 		 550 aa  466  9.999999999999999e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.97662  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1168  hydroxylamine reductase  45.29 
 
 		 552 aa  465  9.999999999999999e-131  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1054  hydroxylamine reductase  44.29 
 
 		 550 aa  466  9.999999999999999e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1666  hydroxylamine reductase  44.56 
 
 		 565 aa  466  9.999999999999999e-131  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.372025  normal  0.875893 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1978  hydroxylamine reductase  45.54 
 
 		 542 aa  464  1e-129  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.881596  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3125  hydroxylamine reductase  45.45 
 
 		 551 aa  462  1e-129  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1069  hydroxylamine reductase  43.77 
 
 		 554 aa  462  1e-129  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1165  hydroxylamine reductase  44.29 
 
 		 552 aa  465  1e-129  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4621  hydroxylamine reductase  46.64 
 
 		 559 aa  464  1e-129  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0716541 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1293  hydroxylamine reductase  44.94 
 
 		 554 aa  464  1e-129  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.86267  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0406  hybrid cluster protein  43.77 
 
 		 554 aa  462  1e-129  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>