178 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_1364 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002939  GSU0674  hydroxylamine reductase  87.02 
 
 
548 aa  983    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.09718  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3125  hydroxylamine reductase  67.15 
 
 
551 aa  787    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0596  hydroxylamine reductase  59.2 
 
 
535 aa  650    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0213  hydroxylamine reductase  72.45 
 
 
533 aa  828    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.8548  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0837  hydroxylamine reductase  72.02 
 
 
550 aa  820    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00540032  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2872  hydroxylamine reductase  72.48 
 
 
553 aa  823    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.000000295577  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2941  hydroxylamine reductase  56.01 
 
 
565 aa  640    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2834  hydroxylamine reductase  86.45 
 
 
547 aa  994    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000787255  hitchhiker  0.00000000000275149 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2641  hydroxylamine reductase  60.04 
 
 
537 aa  659    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.897837  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0585  hydroxylamine reductase  72.99 
 
 
533 aa  827    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000760383  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1609  hydroxylamine reductase  57.74 
 
 
542 aa  654    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.726092  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2647  hydroxylamine reductase  72.99 
 
 
533 aa  827    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.654819  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3446  hydroxylamine reductase  56.75 
 
 
542 aa  642    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  unclonable  0.0000118604 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3702  hydroxylamine reductase  73.54 
 
 
533 aa  839    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.456407  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1201  hydroxylamine reductase  73.81 
 
 
531 aa  823    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3576  hydroxylamine reductase  73.99 
 
 
531 aa  838    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1600  hydroxylamine reductase  57.77 
 
 
542 aa  651    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0704  hydroxylamine reductase  59.67 
 
 
537 aa  662    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.308475 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1239  hydroxylamine reductase  82.12 
 
 
549 aa  929    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000262121  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0663  hydroxylamine reductase  68.32 
 
 
541 aa  775    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.430546  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1364  hydroxylamine reductase  100 
 
 
549 aa  1132    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.453221  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3038  hydroxylamine reductase  81.93 
 
 
549 aa  925    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3228  hydroxylamine reductase  67.28 
 
 
568 aa  769    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.892851 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1168  hydroxylamine reductase  66.42 
 
 
552 aa  776    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1033  hydroxylamine reductase  67.46 
 
 
568 aa  766    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0988  hydroxylamine reductase  62.55 
 
 
539 aa  700    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.160693 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2386  hydroxylamine reductase  53.37 
 
 
566 aa  593  1e-168  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00790044  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1750  hybrid cluster protein  55.17 
 
 
532 aa  588  1e-166  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.531638  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1173  hydroxylamine reductase  53.97 
 
 
549 aa  582  1.0000000000000001e-165  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000032867  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0977  hydroxylamine reductase  48.47 
 
 
555 aa  559  1e-158  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.349617 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3188  hydroxylamine reductase  50.82 
 
 
544 aa  555  1e-157  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0212462 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0974  hydroxylamine reductase  52.62 
 
 
546 aa  556  1e-157  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00100558  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4165  hydroxylamine reductase  50.72 
 
 
549 aa  556  1e-157  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1355  hydroxylamine reductase  50.63 
 
 
557 aa  553  1e-156  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1657  hydroxylamine reductase  50.63 
 
 
556 aa  553  1e-156  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.922648  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4539  hydroxylamine reductase  50.72 
 
 
549 aa  554  1e-156  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2759  hydroxylamine reductase  50.55 
 
 
549 aa  545  1e-154  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0406  hybrid cluster protein  49.91 
 
 
554 aa  543  1e-153  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18290  hydroxylamine reductase  49.01 
 
 
555 aa  544  1e-153  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000343984  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0816  hydroxylamine reductase  49.02 
 
 
545 aa  538  1e-151  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1174  hydroxylamine reductase  50 
 
 
554 aa  536  1e-151  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0529148  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3097  hydroxylamine reductase  49.01 
 
 
554 aa  534  1e-150  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0213297  normal  0.133055 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2832  hydroxylamine reductase  48.47 
 
 
554 aa  532  1e-150  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.310206  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1216  hydroxylamine reductase  49.01 
 
 
554 aa  533  1e-150  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.453579  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1165  hydroxylamine reductase  48.57 
 
 
552 aa  533  1e-150  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0845  hydroxylamine reductase  48.84 
 
 
545 aa  535  1e-150  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.633582  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1293  hydroxylamine reductase  49.46 
 
 
554 aa  533  1e-150  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.86267  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0957  hydroxylamine reductase  48.56 
 
 
547 aa  531  1e-150  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1363  hydroxylamine reductase  48.64 
 
 
554 aa  529  1e-149  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2914  hydroxylamine reductase  48.46 
 
 
554 aa  530  1e-149  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3609  hydroxylamine reductase  48.64 
 
 
552 aa  530  1e-149  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.918432  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1260  hydroxylamine reductase  49.1 
 
 
552 aa  530  1e-149  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.181543  hitchhiker  0.000316349 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3011  hydroxylamine reductase  48.46 
 
 
554 aa  530  1e-149  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1260  hydroxylamine reductase  49.28 
 
 
554 aa  530  1e-149  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0981  hydroxylamine reductase  48.29 
 
 
557 aa  525  1e-148  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00091795 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1069  hydroxylamine reductase  48.38 
 
 
554 aa  527  1e-148  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0754  hydroxylamine reductase  48.82 
 
 
552 aa  523  1e-147  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1798  hydroxylamine reductase  47.18 
 
 
557 aa  519  1e-146  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28240  hydroxylamine reductase  50.45 
 
 
525 aa  518  1e-146  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.230727 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1163  hydroxylamine reductase  46.9 
 
 
543 aa  520  1e-146  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1829  hydroxylamine reductase  49.28 
 
 
545 aa  518  1.0000000000000001e-145  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1055  hydroxylamine reductase  48.28 
 
 
554 aa  516  1.0000000000000001e-145  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2909  hydroxylamine reductase  47.28 
 
 
547 aa  512  1e-144  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2190  hydroxylamine reductase  49.01 
 
 
526 aa  514  1e-144  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.317395  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0742  hydroxylamine reductase  50.18 
 
 
531 aa  513  1e-144  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.483638  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1121  hydroxylamine reductase  48.91 
 
 
555 aa  510  1e-143  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.800783  normal  0.249924 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0895  hydroxylamine reductase  47.39 
 
 
554 aa  510  1e-143  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.62617 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1390  hydroxylamine reductase  46.68 
 
 
550 aa  509  1e-143  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2458  hydroxylamine reductase  47.22 
 
 
550 aa  506  9.999999999999999e-143  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0141  hybrid cluster protein  48.39 
 
 
553 aa  505  9.999999999999999e-143  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.409118 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1120  hydroxylamine reductase  46.64 
 
 
568 aa  508  9.999999999999999e-143  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.170872  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2587  hydroxylamine reductase  46.93 
 
 
547 aa  508  9.999999999999999e-143  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000431874  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4621  hydroxylamine reductase  48.2 
 
 
559 aa  508  9.999999999999999e-143  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0716541 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0164  hydroxylamine reductase  46.46 
 
 
546 aa  505  9.999999999999999e-143  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.930451  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1424  hydroxylamine reductase  49.19 
 
 
522 aa  506  9.999999999999999e-143  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.013462  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00878  hydroxylamine reductase  46.86 
 
 
550 aa  503  1e-141  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2769  hybrid cluster protein  46.86 
 
 
550 aa  503  1e-141  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4555  hydroxylamine reductase  48.61 
 
 
555 aa  503  1e-141  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00753041 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1034  hydroxylamine reductase  46.86 
 
 
550 aa  503  1e-141  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1660  hydroxylamine reductase  47.44 
 
 
562 aa  503  1e-141  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4090  hydroxylamine reductase  48.61 
 
 
555 aa  503  1e-141  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0149  hydroxylamine reductase  45.59 
 
 
542 aa  503  1e-141  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00268758  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0036  hydroxylamine reductase  46.28 
 
 
542 aa  503  1e-141  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00884  hypothetical protein  46.86 
 
 
550 aa  503  1e-141  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0977  hydroxylamine reductase  46.86 
 
 
550 aa  503  1e-141  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0946  hydroxylamine reductase  46.86 
 
 
550 aa  503  1e-141  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.869117  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2701  hydroxylamine reductase  46.04 
 
 
550 aa  501  1e-141  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2723  hydroxylamine reductase  46.86 
 
 
550 aa  503  1e-141  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.18873  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0902  hydroxylamine reductase  46.86 
 
 
550 aa  504  1e-141  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.800969 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003799  hydroxylamine reductase  47.31 
 
 
553 aa  500  1e-140  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1004  hydroxylamine reductase  46.5 
 
 
550 aa  500  1e-140  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.97662  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0972  hydroxylamine reductase  46.5 
 
 
550 aa  500  1e-140  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0937  hydroxylamine reductase  46.5 
 
 
550 aa  500  1e-140  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.697919  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2617  hydroxylamine reductase  46.04 
 
 
550 aa  501  1e-140  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1054  hydroxylamine reductase  46.5 
 
 
550 aa  500  1e-140  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1035  hydroxylamine reductase  46.5 
 
 
550 aa  500  1e-140  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1591  hydroxylamine reductase  46.04 
 
 
550 aa  501  1e-140  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1053  hydroxylamine reductase  46.01 
 
 
539 aa  497  1e-139  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0970  hydroxylamine reductase  47.04 
 
 
591 aa  498  1e-139  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.164641  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1666  hydroxylamine reductase  45.41 
 
 
565 aa  495  1e-139  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.372025  normal  0.875893 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>