173 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_6194 on replicon NC_010625
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007511  Bcep18194_B1121  hydroxylamine reductase  73.69 
 
 
555 aa  800    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.800783  normal  0.249924 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0141  hybrid cluster protein  63.6 
 
 
553 aa  692    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.409118 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4090  hydroxylamine reductase  73.47 
 
 
555 aa  786    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0406  hybrid cluster protein  64.26 
 
 
554 aa  725    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1657  hydroxylamine reductase  58.89 
 
 
556 aa  672    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.922648  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1798  hydroxylamine reductase  64.12 
 
 
557 aa  708    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4621  hydroxylamine reductase  63.13 
 
 
559 aa  676    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0716541 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1355  hydroxylamine reductase  58.89 
 
 
557 aa  672    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4555  hydroxylamine reductase  73.47 
 
 
555 aa  786    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00753041 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6194  hydroxylamine reductase  100 
 
 
553 aa  1131    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.994183  normal  0.0395415 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0895  hydroxylamine reductase  52.88 
 
 
554 aa  598  1e-170  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.62617 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2371  hydroxylamine reductase  53.45 
 
 
550 aa  588  1e-166  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1363  hydroxylamine reductase  51.71 
 
 
554 aa  583  1.0000000000000001e-165  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0981  hydroxylamine reductase  54.05 
 
 
557 aa  584  1.0000000000000001e-165  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00091795 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2832  hydroxylamine reductase  52.08 
 
 
554 aa  583  1.0000000000000001e-165  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.310206  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2914  hydroxylamine reductase  51.9 
 
 
554 aa  584  1.0000000000000001e-165  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3011  hydroxylamine reductase  51.9 
 
 
554 aa  583  1.0000000000000001e-165  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1174  hydroxylamine reductase  52.44 
 
 
554 aa  580  1e-164  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0529148  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1260  hydroxylamine reductase  52.26 
 
 
554 aa  579  1e-164  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1666  hydroxylamine reductase  53.01 
 
 
565 aa  579  1e-164  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.372025  normal  0.875893 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003799  hydroxylamine reductase  51.45 
 
 
553 aa  580  1e-164  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3097  hydroxylamine reductase  52.08 
 
 
554 aa  578  1.0000000000000001e-163  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0213297  normal  0.133055 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1750  hybrid cluster protein  55.01 
 
 
532 aa  577  1.0000000000000001e-163  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.531638  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1216  hydroxylamine reductase  51.07 
 
 
554 aa  575  1.0000000000000001e-163  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.453579  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1034  hydroxylamine reductase  52 
 
 
550 aa  575  1.0000000000000001e-163  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2271  hydroxylamine reductase  52.91 
 
 
550 aa  575  1.0000000000000001e-163  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.663099  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0946  hydroxylamine reductase  52 
 
 
550 aa  576  1.0000000000000001e-163  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.869117  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1293  hydroxylamine reductase  52.08 
 
 
554 aa  578  1.0000000000000001e-163  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.86267  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1260  hydroxylamine reductase  51.72 
 
 
552 aa  575  1.0000000000000001e-163  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.181543  hitchhiker  0.000316349 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00878  hydroxylamine reductase  51.82 
 
 
550 aa  573  1.0000000000000001e-162  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2769  hybrid cluster protein  51.82 
 
 
550 aa  573  1.0000000000000001e-162  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00884  hypothetical protein  51.82 
 
 
550 aa  573  1.0000000000000001e-162  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0937  hydroxylamine reductase  51.64 
 
 
550 aa  572  1.0000000000000001e-162  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.697919  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3609  hydroxylamine reductase  51.34 
 
 
552 aa  574  1.0000000000000001e-162  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.918432  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0972  hydroxylamine reductase  51.64 
 
 
550 aa  572  1.0000000000000001e-162  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1069  hydroxylamine reductase  50.99 
 
 
554 aa  572  1.0000000000000001e-162  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1004  hydroxylamine reductase  51.64 
 
 
550 aa  573  1.0000000000000001e-162  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.97662  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2617  hydroxylamine reductase  52.09 
 
 
550 aa  573  1.0000000000000001e-162  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1035  hydroxylamine reductase  51.64 
 
 
550 aa  572  1.0000000000000001e-162  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1054  hydroxylamine reductase  51.64 
 
 
550 aa  573  1.0000000000000001e-162  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0977  hydroxylamine reductase  51.82 
 
 
550 aa  573  1.0000000000000001e-162  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1165  hydroxylamine reductase  51.26 
 
 
552 aa  573  1.0000000000000001e-162  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1591  hydroxylamine reductase  52.09 
 
 
550 aa  573  1.0000000000000001e-162  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2701  hydroxylamine reductase  52.09 
 
 
550 aa  574  1.0000000000000001e-162  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2723  hydroxylamine reductase  51.82 
 
 
550 aa  573  1.0000000000000001e-162  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.18873  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0902  hydroxylamine reductase  51.82 
 
 
550 aa  574  1.0000000000000001e-162  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.800969 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2458  hydroxylamine reductase  51.82 
 
 
550 aa  573  1.0000000000000001e-162  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1055  hydroxylamine reductase  51.44 
 
 
554 aa  571  1e-161  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1173  hydroxylamine reductase  52.07 
 
 
549 aa  568  1e-160  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000032867  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1390  hydroxylamine reductase  51.27 
 
 
550 aa  566  1e-160  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1707  hydroxylamine reductase  51.27 
 
 
550 aa  563  1.0000000000000001e-159  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3446  hydroxylamine reductase  52.74 
 
 
542 aa  564  1.0000000000000001e-159  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  unclonable  0.0000118604 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1973  hydroxylamine reductase  51.09 
 
 
550 aa  564  1.0000000000000001e-159  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1600  hydroxylamine reductase  51.46 
 
 
542 aa  559  1e-158  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1609  hydroxylamine reductase  51.28 
 
 
542 aa  555  1e-157  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.726092  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3228  hydroxylamine reductase  52.09 
 
 
568 aa  556  1e-157  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.892851 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0596  hydroxylamine reductase  52.74 
 
 
535 aa  556  1e-157  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2386  hydroxylamine reductase  51.85 
 
 
566 aa  550  1e-155  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00790044  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0663  hydroxylamine reductase  51.99 
 
 
541 aa  548  1e-155  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.430546  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1033  hydroxylamine reductase  51.73 
 
 
568 aa  551  1e-155  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0988  hydroxylamine reductase  51.37 
 
 
539 aa  547  1e-154  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.160693 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3188  hydroxylamine reductase  50.91 
 
 
544 aa  546  1e-154  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0212462 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0704  hydroxylamine reductase  51.18 
 
 
537 aa  542  1e-153  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.308475 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2641  hydroxylamine reductase  51.73 
 
 
537 aa  540  9.999999999999999e-153  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.897837  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2941  hydroxylamine reductase  50.26 
 
 
565 aa  540  9.999999999999999e-153  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0213  hydroxylamine reductase  51.64 
 
 
533 aa  536  1e-151  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.8548  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1201  hydroxylamine reductase  50.91 
 
 
531 aa  526  1e-148  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2759  hydroxylamine reductase  51.91 
 
 
549 aa  522  1e-147  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3702  hydroxylamine reductase  50 
 
 
533 aa  523  1e-147  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.456407  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3576  hydroxylamine reductase  50.18 
 
 
531 aa  522  1e-147  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2834  hydroxylamine reductase  48.29 
 
 
547 aa  518  1.0000000000000001e-145  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000787255  hitchhiker  0.00000000000275149 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0585  hydroxylamine reductase  49.36 
 
 
533 aa  513  1e-144  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000760383  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2647  hydroxylamine reductase  49.36 
 
 
533 aa  513  1e-144  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.654819  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0674  hydroxylamine reductase  48.11 
 
 
548 aa  511  1e-143  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.09718  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2872  hydroxylamine reductase  48.22 
 
 
553 aa  505  9.999999999999999e-143  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.000000295577  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1364  hydroxylamine reductase  48.38 
 
 
549 aa  506  9.999999999999999e-143  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.453221  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4165  hydroxylamine reductase  46.69 
 
 
549 aa  506  9.999999999999999e-143  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0837  hydroxylamine reductase  48.48 
 
 
550 aa  503  1e-141  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00540032  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0816  hydroxylamine reductase  46.58 
 
 
545 aa  503  1e-141  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0845  hydroxylamine reductase  46.58 
 
 
545 aa  501  1e-140  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.633582  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0974  hydroxylamine reductase  47.24 
 
 
546 aa  498  1e-139  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00100558  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3038  hydroxylamine reductase  47.57 
 
 
549 aa  493  9.999999999999999e-139  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1239  hydroxylamine reductase  47.21 
 
 
549 aa  491  1e-137  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000262121  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2190  hydroxylamine reductase  46.87 
 
 
526 aa  485  1e-136  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.317395  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4539  hydroxylamine reductase  45.74 
 
 
549 aa  486  1e-136  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0977  hydroxylamine reductase  43.21 
 
 
555 aa  479  1e-134  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.349617 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0742  hydroxylamine reductase  47.86 
 
 
531 aa  481  1e-134  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.483638  normal 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_12416  predicted protein  45.08 
 
 
551 aa  478  1e-133  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1168  hydroxylamine reductase  45.95 
 
 
552 aa  478  1e-133  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3125  hydroxylamine reductase  45.95 
 
 
551 aa  478  1e-133  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28240  hydroxylamine reductase  48.47 
 
 
525 aa  474  1e-132  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.230727 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18290  hydroxylamine reductase  44.96 
 
 
555 aa  474  1e-132  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000343984  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1163  hydroxylamine reductase  43.9 
 
 
543 aa  472  1e-132  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2909  hydroxylamine reductase  44.96 
 
 
547 aa  469  1.0000000000000001e-131  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2587  hydroxylamine reductase  45.42 
 
 
547 aa  469  1.0000000000000001e-131  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000431874  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0957  hydroxylamine reductase  44.18 
 
 
547 aa  471  1.0000000000000001e-131  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1424  hydroxylamine reductase  46.13 
 
 
522 aa  464  1e-129  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.013462  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0164  hydroxylamine reductase  43.88 
 
 
546 aa  462  1e-129  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.930451  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1120  hydroxylamine reductase  42.96 
 
 
568 aa  460  9.999999999999999e-129  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.170872  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0036  hydroxylamine reductase  43.56 
 
 
542 aa  460  9.999999999999999e-129  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>