84 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A3717 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008553  Mthe_1216  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  68.45 
 
 		 648 aa  930    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.655192  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1166  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  49.45 
 
 		 637 aa  643    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3717  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  100 
 
 		 634 aa  1315    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0652  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  41.4 
 
 		 707 aa  462  1e-129  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00052858  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0860  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  40.42 
 
 		 695 aa  457  1e-127  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.199727  normal  0.922779 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2918  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  39.65 
 
 		 710 aa  440  9.999999999999999e-123  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0596914  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2327  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  37.11 
 
 		 621 aa  380  1e-104  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00453727  normal  0.0261188 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0888  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  34.91 
 
 		 629 aa  369  1e-101  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.186953  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2875  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  35.09 
 
 		 626 aa  359  9e-98  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.843098  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2933  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  33.97 
 
 		 623 aa  359  9.999999999999999e-98  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000257353  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3525  carbon monoxide dehydrogenase  35.34 
 
 		 624 aa  357  5e-97  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1272  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  34.27 
 
 		 628 aa  354  2e-96  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.142133  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0842  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  35.25 
 
 		 629 aa  350  4e-95  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.183197  normal  0.106762 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1234  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  32.55 
 
 		 629 aa  344  2.9999999999999997e-93  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0405701  normal  0.377093 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0057  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  34.91 
 
 		 645 aa  338  1.9999999999999998e-91  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.612526  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0382  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  34.06 
 
 		 631 aa  335  1e-90  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.72739  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2233  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  34.79 
 
 		 629 aa  333  7.000000000000001e-90  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0618  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  32.51 
 
 		 641 aa  332  1e-89  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2098  carbon monoxide dehydrogenase subunit  32.67 
 
 		 640 aa  331  2e-89  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1341  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  34.28 
 
 		 623 aa  331  3e-89  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0884  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  32.97 
 
 		 653 aa  323  5e-87  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.17634  normal  0.977834 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0934  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  32.61 
 
 		 627 aa  315  1.9999999999999998e-84  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.502316  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1133  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  33.44 
 
 		 629 aa  313  3.9999999999999997e-84  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.394682  normal  0.139391 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3028  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  31.92 
 
 		 625 aa  313  5.999999999999999e-84  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0882  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  31.97 
 
 		 635 aa  307  3e-82  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2566  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  32.82 
 
 		 663 aa  296  9e-79  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1461  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  33.03 
 
 		 656 aa  290  5.0000000000000004e-77  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000668721  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4498  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  30.58 
 
 		 663 aa  280  6e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.325797 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0072  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  30.93 
 
 		 635 aa  278  3e-73  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3185  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  30.91 
 
 		 679 aa  277  5e-73  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.579976  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3792  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  30.53 
 
 		 635 aa  276  9e-73  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.117932  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0335  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  31.73 
 
 		 642 aa  275  2.0000000000000002e-72  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04490  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  30.21 
 
 		 632 aa  272  1e-71  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0870  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  33 
 
 		 628 aa  267  4e-70  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.404437  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1203  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  31.06 
 
 		 674 aa  267  5e-70  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2798  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  29.46 
 
 		 672 aa  262  1e-68  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1270  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  30.37 
 
 		 673 aa  262  1e-68  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00748773  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1736  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  29.11 
 
 		 666 aa  262  2e-68  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.306274  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1131  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  29.07 
 
 		 676 aa  260  6e-68  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000338326  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0236  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  28.82 
 
 		 679 aa  258  2e-67  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2801  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  29.75 
 
 		 670 aa  256  1.0000000000000001e-66  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000137875  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1427  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  29.83 
 
 		 639 aa  252  1e-65  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1972  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  29.98 
 
 		 655 aa  252  2e-65  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000154748  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1902  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  28.93 
 
 		 669 aa  248  3e-64  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000268472  hitchhiker  0.000000000000110792 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0438  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  28.08 
 
 		 663 aa  239  2e-61  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.000000530778  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3780  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  29.37 
 
 		 674 aa  238  2e-61  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.288316  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0149  carbon-monoxide dehydrogenase (acceptor)  28.9 
 
 		 680 aa  234  5e-60  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2909  hydroxylamine reductase  25 
 
 		 547 aa  61.6  0.00000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2587  hydroxylamine reductase  25.57 
 
 		 547 aa  60.8  0.00000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000431874  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0164  hydroxylamine reductase  24.87 
 
 		 546 aa  55.1  0.000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.930451  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1978  hydroxylamine reductase  23.81 
 
 		 542 aa  54.7  0.000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.881596  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0957  hydroxylamine reductase  25.16 
 
 		 547 aa  53.5  0.00001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1829  hydroxylamine reductase  27.94 
 
 		 545 aa  53.5  0.00001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0512  hydroxylamine reductase  24.91 
 
 		 540 aa  53.1  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.96139  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1120  hydroxylamine reductase  24.34 
 
 		 568 aa  53.9  0.00001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.170872  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2940  hydroxylamine reductase  23.92 
 
 		 447 aa  52.8  0.00002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00378374  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1201  hydroxylamine reductase  27.01 
 
 		 531 aa  52  0.00003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4539  hydroxylamine reductase  24.68 
 
 		 549 aa  52  0.00004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1599  hybrid cluster protein  25 
 
 		 549 aa  51.2  0.00005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000102791  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1490  hydroxylamine reductase  26.69 
 
 		 540 aa  50.4  0.00009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000660036  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1053  hydroxylamine reductase  21.62 
 
 		 539 aa  50.4  0.0001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3948  hybrid cluster protein  26.13 
 
 		 551 aa  49.7  0.0002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1669  hydroxylamine reductase  22.37 
 
 		 540 aa  49.3  0.0002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.100106  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1364  hydroxylamine reductase  23.97 
 
 		 549 aa  49.3  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.453221  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3576  hydroxylamine reductase  26.54 
 
 		 531 aa  49.3  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0219  hydroxylamine reductase  25.74 
 
 		 538 aa  48.9  0.0003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0468  hybrid cluster protein  22.61 
 
 		 444 aa  47.8  0.0006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.0000131773  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0893  hydroxylamine reductase  25.38 
 
 		 546 aa  47.8  0.0007  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0036  hydroxylamine reductase  27.47 
 
 		 542 aa  47.4  0.0007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1168  hydroxylamine reductase  25.99 
 
 		 552 aa  47.4  0.0009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1165  hydroxylamine reductase  25.81 
 
 		 552 aa  46.6  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1595  hydroxylamine reductase  24.51 
 
 		 543 aa  47  0.001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.333402  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0754  hydroxylamine reductase  26.74 
 
 		 552 aa  47  0.001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3038  hydroxylamine reductase  25.26 
 
 		 549 aa  46.2  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0674  hydroxylamine reductase  25.84 
 
 		 548 aa  46.2  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.09718  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1643  hydroxylamine reductase  23.49 
 
 		 431 aa  45.8  0.002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1239  hydroxylamine reductase  25 
 
 		 549 aa  46.2  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000262121  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1919  hydroxylamine reductase  25.35 
 
 		 553 aa  45.4  0.003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.877615  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0837  hydroxylamine reductase  25.26 
 
 		 550 aa  45.4  0.003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00540032  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0988  hydroxylamine reductase  25.79 
 
 		 539 aa  45.1  0.004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.160693 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0105  acetyl-CoA decarbonylase/synthase complex subunit alpha  32.08 
 
 		 766 aa  45.1  0.004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1577  hydroxylamine reductase  23.13 
 
 		 431 aa  45.1  0.005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0466  hydroxylamine reductase  23.69 
 
 		 542 aa  44.7  0.005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0977  hydroxylamine reductase  23.89 
 
 		 555 aa  43.5  0.01  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.349617 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>