185 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_2940 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009253  Dred_0423  hydroxylamine reductase  91.72 
 
 
435 aa  836    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000304226  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2938  hydroxylamine reductase  74.05 
 
 
461 aa  677    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000065218  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2940  hydroxylamine reductase  100 
 
 
447 aa  918    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00378374  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3216  hydroxylamine reductase  66.82 
 
 
428 aa  619  1e-176  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3153  hydroxylamine reductase  65.92 
 
 
428 aa  614  1e-175  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3446  hydroxylamine reductase  66.14 
 
 
436 aa  615  1e-175  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3471  hydroxylamine reductase  66.14 
 
 
436 aa  615  1e-175  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00683577  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3151  hydroxylamine reductase  66.37 
 
 
428 aa  617  1e-175  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000614247  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3243  hydroxylamine reductase  66.14 
 
 
428 aa  613  9.999999999999999e-175  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.19186  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3497  hydroxylamine reductase  66.14 
 
 
428 aa  613  9.999999999999999e-175  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3458  hydroxylamine reductase  65.92 
 
 
436 aa  613  9.999999999999999e-175  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1803  hydroxylamine reductase  65.92 
 
 
436 aa  612  9.999999999999999e-175  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1676  hydroxylamine reductase  64.35 
 
 
428 aa  607  9.999999999999999e-173  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.150263  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2542  hydroxylamine reductase  60.18 
 
 
435 aa  562  1.0000000000000001e-159  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0330494  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1377  hydroxylamine reductase  57.08 
 
 
441 aa  536  1e-151  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0447  hydroxylamine reductase  57.43 
 
 
454 aa  536  1e-151  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1540  hydroxylamine reductase  57.43 
 
 
442 aa  534  1e-150  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0137  hydroxylamine reductase  59.38 
 
 
427 aa  521  1e-147  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000271526  normal  0.86078 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0918  hydroxylamine reductase  57.87 
 
 
444 aa  520  1e-146  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0273412  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1816  hydroxylamine reductase  54.67 
 
 
453 aa  517  1.0000000000000001e-145  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0688399  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0468  hybrid cluster protein  54.22 
 
 
444 aa  516  1.0000000000000001e-145  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.0000131773  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1905  hydroxylamine reductase  55.58 
 
 
427 aa  488  1e-137  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00412747  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1643  hydroxylamine reductase  50.67 
 
 
431 aa  445  1e-123  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1577  hydroxylamine reductase  50.45 
 
 
431 aa  444  1e-123  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1302  hydroxylamine reductase  50 
 
 
433 aa  439  9.999999999999999e-123  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1173  hydroxylamine reductase  51.52 
 
 
549 aa  424  1e-117  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000032867  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3228  hydroxylamine reductase  51.06 
 
 
568 aa  420  1e-116  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.892851 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1033  hydroxylamine reductase  51.06 
 
 
568 aa  419  1e-116  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2872  hydroxylamine reductase  49.65 
 
 
553 aa  405  1.0000000000000001e-112  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.000000295577  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0213  hydroxylamine reductase  50.12 
 
 
533 aa  405  1.0000000000000001e-112  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.8548  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2190  hydroxylamine reductase  48.24 
 
 
526 aa  405  1.0000000000000001e-112  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.317395  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0663  hydroxylamine reductase  49.18 
 
 
541 aa  408  1.0000000000000001e-112  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.430546  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3702  hydroxylamine reductase  49.65 
 
 
533 aa  403  1e-111  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.456407  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1750  hybrid cluster protein  48.11 
 
 
532 aa  404  1e-111  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.531638  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1609  hydroxylamine reductase  48.35 
 
 
542 aa  400  9.999999999999999e-111  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.726092  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1364  hydroxylamine reductase  49.41 
 
 
549 aa  399  9.999999999999999e-111  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.453221  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28240  hydroxylamine reductase  48 
 
 
525 aa  397  1e-109  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.230727 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1201  hydroxylamine reductase  49.41 
 
 
531 aa  396  1e-109  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3576  hydroxylamine reductase  48.94 
 
 
531 aa  397  1e-109  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2222  hydroxylamine reductase  47.84 
 
 
430 aa  395  1e-109  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.040247  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1600  hydroxylamine reductase  48.35 
 
 
542 aa  398  1e-109  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0674  hydroxylamine reductase  49.77 
 
 
548 aa  394  1e-108  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.09718  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1239  hydroxylamine reductase  48.94 
 
 
549 aa  394  1e-108  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000262121  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0837  hydroxylamine reductase  48.24 
 
 
550 aa  392  1e-108  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00540032  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2834  hydroxylamine reductase  49.18 
 
 
547 aa  394  1e-108  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000787255  hitchhiker  0.00000000000275149 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0585  hydroxylamine reductase  49.18 
 
 
533 aa  393  1e-108  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000760383  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3038  hydroxylamine reductase  49.18 
 
 
549 aa  394  1e-108  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2647  hydroxylamine reductase  49.18 
 
 
533 aa  393  1e-108  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.654819  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0704  hydroxylamine reductase  49.06 
 
 
537 aa  395  1e-108  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.308475 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0988  hydroxylamine reductase  47.29 
 
 
539 aa  390  1e-107  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.160693 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3446  hydroxylamine reductase  48.23 
 
 
542 aa  391  1e-107  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  unclonable  0.0000118604 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3188  hydroxylamine reductase  48.6 
 
 
544 aa  384  1e-105  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0212462 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0406  hybrid cluster protein  47.45 
 
 
554 aa  384  1e-105  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2941  hydroxylamine reductase  48.12 
 
 
565 aa  383  1e-105  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1424  hydroxylamine reductase  47.41 
 
 
522 aa  385  1e-105  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.013462  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0596  hydroxylamine reductase  47.29 
 
 
535 aa  379  1e-104  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1657  hydroxylamine reductase  47.36 
 
 
556 aa  380  1e-104  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.922648  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2641  hydroxylamine reductase  46.82 
 
 
537 aa  379  1e-104  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.897837  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0816  hydroxylamine reductase  45.79 
 
 
545 aa  382  1e-104  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1355  hydroxylamine reductase  47.36 
 
 
557 aa  380  1e-104  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0742  hydroxylamine reductase  47.34 
 
 
531 aa  379  1e-104  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.483638  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0845  hydroxylamine reductase  45.56 
 
 
545 aa  378  1e-103  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.633582  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0981  hydroxylamine reductase  46.34 
 
 
557 aa  374  1e-102  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00091795 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2386  hydroxylamine reductase  46.82 
 
 
566 aa  374  1e-102  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00790044  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2759  hydroxylamine reductase  47.74 
 
 
549 aa  371  1e-101  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003799  hydroxylamine reductase  45.71 
 
 
553 aa  371  1e-101  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1168  hydroxylamine reductase  44.84 
 
 
552 aa  369  1e-101  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01080  hydroxylamine reductase  45.01 
 
 
520 aa  365  1e-100  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.626709  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0974  hydroxylamine reductase  47.24 
 
 
546 aa  366  1e-100  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00100558  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3125  hydroxylamine reductase  44.37 
 
 
551 aa  368  1e-100  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_12416  predicted protein  44.84 
 
 
551 aa  363  3e-99  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0141  hybrid cluster protein  47.04 
 
 
553 aa  363  4e-99  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.409118 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4165  hydroxylamine reductase  43.33 
 
 
549 aa  362  6e-99  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1707  hydroxylamine reductase  43.53 
 
 
550 aa  360  3e-98  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1798  hydroxylamine reductase  45.2 
 
 
557 aa  358  9e-98  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1165  hydroxylamine reductase  44.63 
 
 
552 aa  355  6.999999999999999e-97  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1055  hydroxylamine reductase  44.55 
 
 
554 aa  355  7.999999999999999e-97  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1599  hybrid cluster protein  46.53 
 
 
549 aa  355  8.999999999999999e-97  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000102791  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1069  hydroxylamine reductase  44.6 
 
 
554 aa  355  8.999999999999999e-97  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1120  hydroxylamine reductase  46.1 
 
 
568 aa  353  2e-96  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.170872  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1973  hydroxylamine reductase  43.09 
 
 
550 aa  354  2e-96  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2371  hydroxylamine reductase  43.63 
 
 
550 aa  353  2.9999999999999997e-96  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1216  hydroxylamine reductase  43.5 
 
 
554 aa  351  2e-95  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.453579  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1390  hydroxylamine reductase  42.69 
 
 
550 aa  350  2e-95  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1260  hydroxylamine reductase  43.63 
 
 
552 aa  350  2e-95  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.181543  hitchhiker  0.000316349 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1293  hydroxylamine reductase  43.26 
 
 
554 aa  350  2e-95  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.86267  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1260  hydroxylamine reductase  43.26 
 
 
554 aa  350  3e-95  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2617  hydroxylamine reductase  42.35 
 
 
550 aa  350  3e-95  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1591  hydroxylamine reductase  42.35 
 
 
550 aa  350  3e-95  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3097  hydroxylamine reductase  43.26 
 
 
554 aa  350  4e-95  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0213297  normal  0.133055 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4539  hydroxylamine reductase  44.76 
 
 
549 aa  349  5e-95  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2701  hydroxylamine reductase  42.49 
 
 
550 aa  348  9e-95  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0893  hydroxylamine reductase  43.49 
 
 
546 aa  348  1e-94  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2271  hydroxylamine reductase  43.63 
 
 
550 aa  348  1e-94  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.663099  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1829  hydroxylamine reductase  44.42 
 
 
545 aa  348  1e-94  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1174  hydroxylamine reductase  43.03 
 
 
554 aa  348  1e-94  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0529148  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3948  hybrid cluster protein  41.67 
 
 
551 aa  347  2e-94  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4621  hydroxylamine reductase  46.38 
 
 
559 aa  347  3e-94  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0716541 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3609  hydroxylamine reductase  42.33 
 
 
552 aa  346  6e-94  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.918432  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1054  hydroxylamine reductase  42.22 
 
 
550 aa  345  8e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>