68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_04490 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012560  Avin_04490  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  100 
 
 		 632 aa  1288    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0882  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  50.65 
 
 		 635 aa  622  1e-177  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0072  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  47.6 
 
 		 635 aa  550  1e-155  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3792  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  45.26 
 
 		 635 aa  545  1e-154  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.117932  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1427  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  46.55 
 
 		 639 aa  538  1e-151  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0618  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  45.51 
 
 		 641 aa  532  1e-150  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2098  carbon monoxide dehydrogenase subunit  45.2 
 
 		 640 aa  523  1e-147  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4498  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  45.26 
 
 		 663 aa  522  1e-147  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.325797 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0057  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  46.38 
 
 		 645 aa  514  1e-144  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.612526  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3525  carbon monoxide dehydrogenase  44.62 
 
 		 624 aa  504  1e-141  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2327  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  43.27 
 
 		 621 aa  484  1e-135  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00453727  normal  0.0261188 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1341  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  44.14 
 
 		 623 aa  483  1e-135  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2798  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  40.33 
 
 		 672 aa  473  1e-132  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0842  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  43.2 
 
 		 629 aa  465  1e-129  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.183197  normal  0.106762 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2875  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  42.38 
 
 		 626 aa  460  9.999999999999999e-129  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.843098  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1270  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  39.44 
 
 		 673 aa  448  1.0000000000000001e-124  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00748773  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2233  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  42.33 
 
 		 629 aa  446  1.0000000000000001e-124  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1272  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  41.03 
 
 		 628 aa  447  1.0000000000000001e-124  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.142133  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1133  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  42.26 
 
 		 629 aa  442  1e-123  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.394682  normal  0.139391 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1203  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  38.49 
 
 		 674 aa  441  9.999999999999999e-123  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3185  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  40.97 
 
 		 679 aa  434  1e-120  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.579976  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3028  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  40 
 
 		 625 aa  435  1e-120  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3780  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  39.04 
 
 		 674 aa  427  1e-118  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.288316  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0382  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  40.42 
 
 		 631 aa  423  1e-117  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.72739  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0934  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  37.62 
 
 		 627 aa  403  1e-111  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.502316  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1234  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  37.7 
 
 		 629 aa  400  9.999999999999999e-111  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0405701  normal  0.377093 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0335  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  39.55 
 
 		 642 aa  398  1e-109  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0884  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  38.44 
 
 		 653 aa  395  1e-108  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.17634  normal  0.977834 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1461  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  39.4 
 
 		 656 aa  393  1e-108  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000668721  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2566  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  36.9 
 
 		 663 aa  377  1e-103  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0438  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  34.22 
 
 		 663 aa  363  5.0000000000000005e-99  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.000000530778  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1972  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  36.76 
 
 		 655 aa  361  3e-98  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000154748  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1131  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  32.54 
 
 		 676 aa  355  2e-96  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000338326  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0236  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  33.18 
 
 		 679 aa  353  7e-96  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1736  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  34.59 
 
 		 666 aa  352  8e-96  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.306274  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0870  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  37.3 
 
 		 628 aa  352  8.999999999999999e-96  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.404437  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1902  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  34.9 
 
 		 669 aa  345  1e-93  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000268472  hitchhiker  0.000000000000110792 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2801  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  33.07 
 
 		 670 aa  333  8e-90  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000137875  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0860  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  32.81 
 
 		 695 aa  326  9e-88  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.199727  normal  0.922779 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0652  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  31.7 
 
 		 707 aa  305  1.0000000000000001e-81  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00052858  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0888  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  32.85 
 
 		 629 aa  303  8.000000000000001e-81  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.186953  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2933  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  32.21 
 
 		 623 aa  302  2e-80  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000257353  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1166  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  30.55 
 
 		 637 aa  293  5e-78  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2918  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  30.89 
 
 		 710 aa  286  9e-76  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0596914  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3717  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  30.21 
 
 		 634 aa  272  1e-71  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1216  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  29.71 
 
 		 648 aa  261  2e-68  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.655192  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0149  carbon-monoxide dehydrogenase (acceptor)  29.82 
 
 		 680 aa  257  5e-67  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0690  acetyl-CoA decarbonylase/synthase complex subunit alpha  22.47 
 
 		 787 aa  61.6  0.00000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.676741  normal  0.475894 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0311  acetyl-CoA decarbonylase/synthase complex subunit alpha  25.91 
 
 		 779 aa  59.3  0.0000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.435383  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0292  acetyl-CoA decarbonylase/synthase complex subunit alpha  21.61 
 
 		 805 aa  59.3  0.0000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0227  acetyl-CoA decarbonylase/synthase complex subunit alpha  23.29 
 
 		 778 aa  57  0.0000009  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0805  acetyl-CoA decarbonylase/synthase complex subunit alpha  24.84 
 
 		 778 aa  55.8  0.000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.471946  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1673  acetyl-CoA decarbonylase/synthase complex subunit alpha  22.78 
 
 		 778 aa  55.1  0.000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1373  acetyl-CoA decarbonylase/synthase complex subunit alpha  23.05 
 
 		 786 aa  52.4  0.00002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.619711  normal  0.51907 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0219  hydroxylamine reductase  24.19 
 
 		 538 aa  49.7  0.0001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1174  acetyl-CoA decarbonylase/synthase complex subunit alpha  21.36 
 
 		 786 aa  49.7  0.0002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0434  acetyl-CoA decarbonylase/synthase complex subunit alpha  20.34 
 
 		 806 aa  49.3  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0475  acetyl-CoA decarbonylase/synthase complex subunit alpha  21.38 
 
 		 768 aa  48.9  0.0003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.908557  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0858  acetyl-CoA decarbonylase/synthase complex subunit alpha  20.3 
 
 		 802 aa  48.9  0.0003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  unclonable  0.00000000764937  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0204  acetyl-CoA decarbonylase/synthase complex subunit alpha  21.26 
 
 		 806 aa  48.1  0.0004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00731411  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1326  hydroxylamine reductase  27.72 
 
 		 545 aa  47.8  0.0005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.611962  normal  0.884501 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0754  hydroxylamine reductase  23.84 
 
 		 552 aa  47  0.001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3188  hydroxylamine reductase  26.29 
 
 		 544 aa  46.6  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0212462 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1163  hydroxylamine reductase  25.68 
 
 		 543 aa  46.2  0.002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2242  hydroxylamine reductase  29.03 
 
 		 541 aa  45.1  0.004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.675401  normal  0.897477 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0977  hydroxylamine reductase  26.42 
 
 		 555 aa  44.7  0.006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.349617 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1905  hydroxylamine reductase  23.83 
 
 		 427 aa  43.9  0.009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00412747  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0845  hydroxylamine reductase  26.11 
 
 		 545 aa  43.5  0.01  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.633582  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>