61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mthe_0292 on replicon NC_008553
Organism: Methanosaeta thermophila PT



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009637  MmarC7_0227  acetyl-CoA decarbonylase/synthase complex subunit alpha  46.67 
 
 		 778 aa  746    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0292  acetyl-CoA decarbonylase/synthase complex subunit alpha  100 
 
 		 805 aa  1668    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0805  acetyl-CoA decarbonylase/synthase complex subunit alpha  47.18 
 
 		 778 aa  748    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.471946  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0858  acetyl-CoA decarbonylase/synthase complex subunit alpha  47.68 
 
 		 802 aa  798    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  unclonable  0.00000000764937  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0311  acetyl-CoA decarbonylase/synthase complex subunit alpha  47.02 
 
 		 779 aa  741    Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.435383  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0690  acetyl-CoA decarbonylase/synthase complex subunit alpha  46.48 
 
 		 787 aa  724    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.676741  normal  0.475894 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0475  acetyl-CoA decarbonylase/synthase complex subunit alpha  46.56 
 
 		 768 aa  686    Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.908557  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1174  acetyl-CoA decarbonylase/synthase complex subunit alpha  45.9 
 
 		 786 aa  703    Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1373  acetyl-CoA decarbonylase/synthase complex subunit alpha  48.29 
 
 		 786 aa  743    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.619711  normal  0.51907 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0434  acetyl-CoA decarbonylase/synthase complex subunit alpha  46.97 
 
 		 806 aa  752    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0204  acetyl-CoA decarbonylase/synthase complex subunit alpha  46.35 
 
 		 806 aa  753    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00731411  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1673  acetyl-CoA decarbonylase/synthase complex subunit alpha  47.44 
 
 		 778 aa  749    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0105  acetyl-CoA decarbonylase/synthase complex subunit alpha  44.78 
 
 		 766 aa  664    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1270  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  21.56 
 
 		 673 aa  63.5  0.00000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00748773  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04490  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  21.61 
 
 		 632 aa  59.3  0.0000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3780  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  20.24 
 
 		 674 aa  57.4  0.000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.288316  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2798  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  20.25 
 
 		 672 aa  54.3  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1461  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  21.92 
 
 		 656 aa  53.1  0.00002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000668721  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1203  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  20.18 
 
 		 674 aa  53.5  0.00002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2875  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  19.77 
 
 		 626 aa  53.5  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.843098  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4064  NADH dehydrogenase subunit I  29.51 
 
 		 171 aa  50.8  0.00009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0149353  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1792  electron transport complex, RnfABCDGE type, C subunit  32.1 
 
 		 541 aa  50.4  0.0001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00273011 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1308  glycolate oxidase, iron-sulfur subunit  24.28 
 
 		 442 aa  49.7  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1209  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  24.28 
 
 		 442 aa  49.7  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1187  (S)-2-hydroxy-acid oxidase  24.01 
 
 		 442 aa  49.7  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1385  putative glycolate oxidase, iron-sulfur subunit  24.01 
 
 		 442 aa  49.7  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1449  putative glycolate oxidase, iron-sulfur subunit  22.41 
 
 		 442 aa  49.3  0.0003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3997  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  22.03 
 
 		 442 aa  49.3  0.0003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.437745 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0263  NADH:ubiquinone oxidoreductase, subunit RnfC  22.83 
 
 		 437 aa  49.3  0.0003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1189  (S)-2-hydroxy-acid oxidase  22.41 
 
 		 442 aa  49.3  0.0003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1211  hypothetical protein  24.28 
 
 		 442 aa  48.5  0.0005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1234  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  27.75 
 
 		 629 aa  48.5  0.0005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0405701  normal  0.377093 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1638  electron transport complex protein RnfC  32.89 
 
 		 776 aa  48.1  0.0006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2197  electron transport complex protein RnfC  27.71 
 
 		 788 aa  47.8  0.0007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1409  glycolate oxidase, iron-sulfur subunit, putative  22.7 
 
 		 442 aa  47.8  0.0008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2558  electron transport complex protein RnfC  29.67 
 
 		 784 aa  47.8  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0669031 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2867  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  27.97 
 
 		 171 aa  47.4  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.708253  normal  0.0292468 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2895  electron transport complex protein RnfC  30.59 
 
 		 523 aa  47  0.001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.473495  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28510  NADH dehydrogenase subunit I  29.51 
 
 		 182 aa  47  0.001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.559317  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1453  pyruvate flavodoxin/ferredoxin oxidoreductase domain-containing protein  32.69 
 
 		 1177 aa  47  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0393546  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1113  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  29.27 
 
 		 170 aa  47.4  0.001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.182151  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2822  electron transport complex, C subunit  27.27 
 
 		 495 aa  47.4  0.001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2017  electron transport complex protein RnfC  29.67 
 
 		 558 aa  46.6  0.002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1017  hypothetical protein  22.46 
 
 		 442 aa  46.2  0.002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1354  NADH dehydrogenase subunit I  28.69 
 
 		 171 aa  46.2  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.253044  normal  0.161644 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1384  electron transport complex, RnfABCDGE type, C subunit  32.63 
 
 		 453 aa  47  0.002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000311988  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0475  pyruvate:ferredoxin oxidoreductase, fusion of alpha, beta and gamma subunit  28.57 
 
 		 1223 aa  46.6  0.002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2830  aldo/keto reductase  28.15 
 
 		 379 aa  45.8  0.003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0663366  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1347  putative glycolate oxidase, iron-sulfur subunit  22.13 
 
 		 442 aa  45.8  0.003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2032  pyruvate-flavodoxin oxidoreductase  27.11 
 
 		 1171 aa  45.8  0.003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2042  electron transport complex protein RnfC  29.67 
 
 		 842 aa  45.4  0.004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.875859  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1272  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  20.29 
 
 		 628 aa  45.4  0.004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.142133  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0335  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  19.87 
 
 		 642 aa  45.4  0.004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2318  pyruvate-flavodoxin oxidoreductase  27.11 
 
 		 1171 aa  45.4  0.004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2174  electron transport complex protein RnfC  28.57 
 
 		 846 aa  45.1  0.005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.234957  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0936  electron transport complex, RnfABCDGE type, C subunit  27.5 
 
 		 609 aa  44.7  0.007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.787123  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1333  NADH dehydrogenase subunit I  27.05 
 
 		 171 aa  44.7  0.007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0096  pyruvate ferredoxin/flavodoxin oxidoreductase  31.25 
 
 		 1174 aa  44.7  0.008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000539296  hitchhiker  0.00000356908 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0591  NADH dehydrogenase subunit I  28.3 
 
 		 182 aa  44.3  0.008  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0623179  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2830  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  26.39 
 
 		 427 aa  44.3  0.009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000395761  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0306  electron transport complex, RnfABCDGE type, C subunit  28.74 
 
 		 454 aa  44.3  0.009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.521272  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>