172 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_1133 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A3525  carbon monoxide dehydrogenase  52.89 
 
 		 624 aa  684    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2327  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  52.98 
 
 		 621 aa  693    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00453727  normal  0.0261188 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3028  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  69.66 
 
 		 625 aa  900    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1272  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  53.85 
 
 		 628 aa  688    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.142133  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1234  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  64.44 
 
 		 629 aa  860    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0405701  normal  0.377093 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1341  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  55.67 
 
 		 623 aa  654    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2875  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  58.49 
 
 		 626 aa  734    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.843098  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1133  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  100 
 
 		 629 aa  1280    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.394682  normal  0.139391 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2233  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  84.1 
 
 		 629 aa  1071    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0842  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  55.93 
 
 		 629 aa  702    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.183197  normal  0.106762 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0382  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  70.51 
 
 		 631 aa  917    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.72739  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0884  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  52.1 
 
 		 653 aa  662    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.17634  normal  0.977834 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0934  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  64.22 
 
 		 627 aa  849    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.502316  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0057  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  50.24 
 
 		 645 aa  597  1e-169  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.612526  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2098  carbon monoxide dehydrogenase subunit  48.97 
 
 		 640 aa  588  1e-167  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0618  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  47.9 
 
 		 641 aa  585  1.0000000000000001e-165  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0335  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  48.46 
 
 		 642 aa  573  1.0000000000000001e-162  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0882  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  48.36 
 
 		 635 aa  553  1e-156  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3185  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  43.88 
 
 		 679 aa  527  1e-148  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.579976  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0870  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  47.85 
 
 		 628 aa  525  1e-148  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.404437  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2566  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  43.44 
 
 		 663 aa  522  1e-147  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1461  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  42.97 
 
 		 656 aa  516  1.0000000000000001e-145  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000668721  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1427  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  46.51 
 
 		 639 aa  508  9.999999999999999e-143  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4498  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  44.83 
 
 		 663 aa  500  1e-140  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.325797 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0072  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  44.92 
 
 		 635 aa  496  1e-139  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3792  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  43.4 
 
 		 635 aa  492  9.999999999999999e-139  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.117932  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2798  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  40.89 
 
 		 672 aa  470  1.0000000000000001e-131  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04490  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  42.26 
 
 		 632 aa  455  1.0000000000000001e-126  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1203  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  39.59 
 
 		 674 aa  443  1e-123  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1270  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  37.32 
 
 		 673 aa  433  1e-120  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00748773  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3780  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  38.37 
 
 		 674 aa  419  1e-116  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.288316  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1972  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  37.76 
 
 		 655 aa  384  1e-105  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000154748  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1736  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  36.22 
 
 		 666 aa  361  2e-98  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.306274  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1902  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  36.77 
 
 		 669 aa  352  1e-95  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000268472  hitchhiker  0.000000000000110792 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0860  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  33.76 
 
 		 695 aa  351  2e-95  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.199727  normal  0.922779 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1216  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  34.65 
 
 		 648 aa  350  4e-95  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.655192  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0236  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  34.47 
 
 		 679 aa  344  2e-93  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2801  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  36.07 
 
 		 670 aa  340  5.9999999999999996e-92  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000137875  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1166  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  34.33 
 
 		 637 aa  339  8e-92  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0652  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  32.8 
 
 		 707 aa  334  3e-90  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00052858  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3717  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  33.44 
 
 		 634 aa  333  6e-90  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0438  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  34.46 
 
 		 663 aa  332  2e-89  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.000000530778  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2933  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  32.11 
 
 		 623 aa  328  2.0000000000000001e-88  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000257353  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2918  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  31.89 
 
 		 710 aa  324  3e-87  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0596914  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1131  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  33.01 
 
 		 676 aa  320  3.9999999999999996e-86  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000338326  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0888  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  32.31 
 
 		 629 aa  317  4e-85  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.186953  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0149  carbon-monoxide dehydrogenase (acceptor)  32.58 
 
 		 680 aa  300  5e-80  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2587  hydroxylamine reductase  24.23 
 
 		 547 aa  64.7  0.000000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000431874  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2909  hydroxylamine reductase  24.23 
 
 		 547 aa  64.3  0.000000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1173  hydroxylamine reductase  24.58 
 
 		 549 aa  64.3  0.000000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000032867  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0036  hydroxylamine reductase  23.96 
 
 		 542 aa  63.9  0.000000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3188  hydroxylamine reductase  25.44 
 
 		 544 aa  63.9  0.000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0212462 
 
 
-
 
NC_002950  PG0893  hydroxylamine reductase  24.65 
 
 		 546 aa  63.2  0.00000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0981  hydroxylamine reductase  26.16 
 
 		 557 aa  62  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00091795 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1053  hydroxylamine reductase  23.5 
 
 		 539 aa  62  0.00000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1798  hydroxylamine reductase  25.76 
 
 		 557 aa  61.6  0.00000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1829  hydroxylamine reductase  26.69 
 
 		 545 aa  61.6  0.00000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1634  hydroxylamine reductase  24.15 
 
 		 538 aa  60.8  0.00000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.228305  normal  0.622946 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0219  hydroxylamine reductase  23.11 
 
 		 538 aa  60.1  0.0000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1803  hydroxylamine reductase  22.66 
 
 		 436 aa  60.1  0.0000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1919  hydroxylamine reductase  26.71 
 
 		 553 aa  59.7  0.0000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.877615  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2941  hydroxylamine reductase  23.58 
 
 		 565 aa  59.3  0.0000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0749  hydroxylamine reductase  24.02 
 
 		 543 aa  58.5  0.0000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.000000113817  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2641  hydroxylamine reductase  26.47 
 
 		 537 aa  57.8  0.0000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.897837  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1201  hydroxylamine reductase  28.88 
 
 		 531 aa  57.4  0.0000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0596  hydroxylamine reductase  27.95 
 
 		 535 aa  57.4  0.0000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3446  hydroxylamine reductase  22.77 
 
 		 436 aa  57  0.0000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3576  hydroxylamine reductase  27.81 
 
 		 531 aa  57  0.000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18290  hydroxylamine reductase  23.78 
 
 		 555 aa  55.8  0.000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000343984  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0858  acetyl-CoA decarbonylase/synthase complex subunit alpha  22.34 
 
 		 802 aa  55.8  0.000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  unclonable  0.00000000764937  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2647  hydroxylamine reductase  24.74 
 
 		 533 aa  56.6  0.000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.654819  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1168  hydroxylamine reductase  27.22 
 
 		 552 aa  55.8  0.000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0585  hydroxylamine reductase  24.74 
 
 		 533 aa  56.6  0.000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000760383  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0447  hydroxylamine reductase  23.22 
 
 		 454 aa  55.8  0.000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1239  hydroxylamine reductase  24.79 
 
 		 549 aa  55.8  0.000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000262121  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3216  hydroxylamine reductase  22.22 
 
 		 428 aa  55.5  0.000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1669  hydroxylamine reductase  24.05 
 
 		 540 aa  55.8  0.000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.100106  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1490  hydroxylamine reductase  24.31 
 
 		 540 aa  55.5  0.000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000660036  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0468  hybrid cluster protein  21.83 
 
 		 444 aa  55.5  0.000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.0000131773  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1660  hydroxylamine reductase  24.09 
 
 		 562 aa  55.8  0.000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2542  hydroxylamine reductase  22.9 
 
 		 435 aa  55.5  0.000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0330494  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0663  hydroxylamine reductase  29.57 
 
 		 541 aa  55.8  0.000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.430546  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3458  hydroxylamine reductase  22.42 
 
 		 436 aa  55.5  0.000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1125  hydroxylamine reductase  24.07 
 
 		 542 aa  55.5  0.000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.0000000097703  normal  0.234741 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3948  hybrid cluster protein  21.61 
 
 		 551 aa  55.1  0.000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3153  hydroxylamine reductase  22.42 
 
 		 428 aa  55.1  0.000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0977  hydroxylamine reductase  23.31 
 
 		 555 aa  55.1  0.000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.349617 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1326  hydroxylamine reductase  24.13 
 
 		 545 aa  55.1  0.000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.611962  normal  0.884501 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2940  hydroxylamine reductase  23.56 
 
 		 447 aa  55.1  0.000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00378374  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3228  hydroxylamine reductase  28.42 
 
 		 568 aa  55.1  0.000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.892851 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3125  hydroxylamine reductase  26.63 
 
 		 551 aa  55.1  0.000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3038  hydroxylamine reductase  24.79 
 
 		 549 aa  54.7  0.000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3243  hydroxylamine reductase  22.38 
 
 		 428 aa  54.3  0.000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.19186  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3497  hydroxylamine reductase  22.38 
 
 		 428 aa  54.3  0.000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1676  hydroxylamine reductase  23.26 
 
 		 428 aa  54.3  0.000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.150263  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2759  hydroxylamine reductase  29.59 
 
 		 549 aa  54.3  0.000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2189  hydroxylamine reductase  25.69 
 
 		 538 aa  54.3  0.000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.00125687  normal  0.781035 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1599  hybrid cluster protein  23.53 
 
 		 549 aa  54.3  0.000007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000102791  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0213  hydroxylamine reductase  25.51 
 
 		 533 aa  53.9  0.000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.8548  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1364  hydroxylamine reductase  27.27 
 
 		 549 aa  53.9  0.000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.453221  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>