211 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_2327 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002939  GSU2098  carbon monoxide dehydrogenase subunit  51.9 
 
 
640 aa  641    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2233  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  53.87 
 
 
629 aa  679    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3525  carbon monoxide dehydrogenase  65.75 
 
 
624 aa  853    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0057  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  51.9 
 
 
645 aa  650    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.612526  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3028  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  54.47 
 
 
625 aa  696    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0934  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  55.85 
 
 
627 aa  703    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.502316  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1272  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  57.54 
 
 
628 aa  738    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.142133  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1234  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  54.52 
 
 
629 aa  712    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0405701  normal  0.377093 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3185  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  50.7 
 
 
679 aa  638    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.579976  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2327  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  100 
 
 
621 aa  1264    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00453727  normal  0.0261188 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1341  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  63.53 
 
 
623 aa  798    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2875  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  57.31 
 
 
626 aa  736    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.843098  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0382  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  54.74 
 
 
631 aa  702    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.72739  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0842  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  59 
 
 
629 aa  765    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.183197  normal  0.106762 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1133  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  52.98 
 
 
629 aa  672    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.394682  normal  0.139391 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0618  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  51.82 
 
 
641 aa  645    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0335  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  54.28 
 
 
642 aa  655    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0884  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  55.41 
 
 
653 aa  705    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.17634  normal  0.977834 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0882  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  50.79 
 
 
635 aa  611  1e-173  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0870  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  51.83 
 
 
628 aa  585  1e-166  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.404437  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2566  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  47.67 
 
 
663 aa  578  1.0000000000000001e-163  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4498  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  48.19 
 
 
663 aa  573  1.0000000000000001e-162  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.325797 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1461  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  47.53 
 
 
656 aa  569  1e-161  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000668721  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1427  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  47.87 
 
 
639 aa  568  1e-160  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3792  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  48.19 
 
 
635 aa  567  1e-160  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.117932  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0072  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  47.24 
 
 
635 aa  547  1e-154  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1203  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  46.31 
 
 
674 aa  531  1e-149  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1270  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  44.18 
 
 
673 aa  523  1e-147  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00748773  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2798  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  44.88 
 
 
672 aa  512  1e-143  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04490  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  43.27 
 
 
632 aa  484  1e-135  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3780  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  42.86 
 
 
674 aa  475  1e-132  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.288316  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1736  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  39.9 
 
 
666 aa  437  1e-121  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.306274  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2801  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  40.38 
 
 
670 aa  427  1e-118  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000137875  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1902  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  38.12 
 
 
669 aa  417  9.999999999999999e-116  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000268472  hitchhiker  0.000000000000110792 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1972  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  37.52 
 
 
655 aa  411  1e-113  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000154748  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0236  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  37.74 
 
 
679 aa  402  9.999999999999999e-111  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0438  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  36.52 
 
 
663 aa  396  1e-109  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.000000530778  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1131  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  36.51 
 
 
676 aa  392  1e-107  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000338326  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3717  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  37.11 
 
 
634 aa  380  1e-104  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1166  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  35.22 
 
 
637 aa  377  1e-103  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0860  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  36.55 
 
 
695 aa  374  1e-102  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.199727  normal  0.922779 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1216  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  34.12 
 
 
648 aa  366  1e-100  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.655192  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0888  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  36.48 
 
 
629 aa  357  2.9999999999999997e-97  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.186953  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2933  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  34.03 
 
 
623 aa  342  2e-92  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000257353  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0652  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  33.91 
 
 
707 aa  339  9e-92  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00052858  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2918  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  33.7 
 
 
710 aa  335  1e-90  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0596914  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0149  carbon-monoxide dehydrogenase (acceptor)  33.55 
 
 
680 aa  322  9.000000000000001e-87  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0468  hybrid cluster protein  25.24 
 
 
444 aa  82.4  0.00000000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.0000131773  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2190  hydroxylamine reductase  28.28 
 
 
526 aa  76.6  0.000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.317395  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1577  hydroxylamine reductase  26.2 
 
 
431 aa  76.6  0.000000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1424  hydroxylamine reductase  29.35 
 
 
522 aa  76.6  0.000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.013462  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1643  hydroxylamine reductase  26.35 
 
 
431 aa  75.5  0.000000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1600  hydroxylamine reductase  27.13 
 
 
542 aa  75.5  0.000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3576  hydroxylamine reductase  26.93 
 
 
531 aa  75.5  0.000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1609  hydroxylamine reductase  26.87 
 
 
542 aa  75.1  0.000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.726092  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3188  hydroxylamine reductase  26.36 
 
 
544 aa  74.3  0.000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0212462 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1905  hydroxylamine reductase  26.58 
 
 
427 aa  73.6  0.00000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00412747  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1201  hydroxylamine reductase  26.67 
 
 
531 aa  73.6  0.00000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0406  hybrid cluster protein  26.32 
 
 
554 aa  73.2  0.00000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1798  hydroxylamine reductase  25.35 
 
 
557 aa  72.8  0.00000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1173  hydroxylamine reductase  24.65 
 
 
549 aa  72  0.00000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000032867  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0674  hydroxylamine reductase  26.76 
 
 
548 aa  71.2  0.00000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.09718  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1326  hydroxylamine reductase  22.73 
 
 
545 aa  70.5  0.00000000009  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.611962  normal  0.884501 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0742  hydroxylamine reductase  26.89 
 
 
531 aa  70.5  0.00000000009  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.483638  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0893  hydroxylamine reductase  23.75 
 
 
546 aa  70.1  0.0000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3097  hydroxylamine reductase  27.7 
 
 
554 aa  69.7  0.0000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0213297  normal  0.133055 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2909  hydroxylamine reductase  24.74 
 
 
547 aa  69.7  0.0000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1260  hydroxylamine reductase  27.7 
 
 
554 aa  70.1  0.0000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2587  hydroxylamine reductase  24.74 
 
 
547 aa  69.3  0.0000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000431874  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28240  hydroxylamine reductase  27.07 
 
 
525 aa  69.3  0.0000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.230727 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0754  hydroxylamine reductase  25.46 
 
 
552 aa  68.9  0.0000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1302  hydroxylamine reductase  26.89 
 
 
433 aa  69.7  0.0000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2872  hydroxylamine reductase  26.67 
 
 
553 aa  68.9  0.0000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.000000295577  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0585  hydroxylamine reductase  26.45 
 
 
533 aa  68.6  0.0000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000760383  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0036  hydroxylamine reductase  26.63 
 
 
542 aa  68.6  0.0000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2647  hydroxylamine reductase  26.45 
 
 
533 aa  68.6  0.0000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.654819  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0219  hydroxylamine reductase  23.73 
 
 
538 aa  68.2  0.0000000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2386  hydroxylamine reductase  23.91 
 
 
566 aa  68.2  0.0000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00790044  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1293  hydroxylamine reductase  27.44 
 
 
554 aa  68.6  0.0000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.86267  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1829  hydroxylamine reductase  27.05 
 
 
545 aa  68.2  0.0000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2641  hydroxylamine reductase  26.36 
 
 
537 aa  67.8  0.0000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.897837  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3702  hydroxylamine reductase  26.09 
 
 
533 aa  68.2  0.0000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.456407  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2834  hydroxylamine reductase  26.73 
 
 
547 aa  67.4  0.0000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000787255  hitchhiker  0.00000000000275149 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1490  hydroxylamine reductase  25 
 
 
540 aa  67.4  0.0000000008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000660036  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0845  hydroxylamine reductase  22.05 
 
 
545 aa  67.4  0.0000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.633582  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0837  hydroxylamine reductase  25.69 
 
 
550 aa  66.6  0.000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00540032  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3446  hydroxylamine reductase  26.43 
 
 
542 aa  66.6  0.000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  unclonable  0.0000118604 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2941  hydroxylamine reductase  25.08 
 
 
565 aa  67  0.000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1174  hydroxylamine reductase  26.65 
 
 
554 aa  67  0.000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0529148  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1216  hydroxylamine reductase  26.91 
 
 
554 aa  65.9  0.000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.453579  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0213  hydroxylamine reductase  26.07 
 
 
533 aa  65.5  0.000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.8548  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1239  hydroxylamine reductase  25.07 
 
 
549 aa  65.1  0.000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000262121  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0977  hydroxylamine reductase  25.41 
 
 
555 aa  64.7  0.000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.349617 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3038  hydroxylamine reductase  25.33 
 
 
549 aa  64.7  0.000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0596  hydroxylamine reductase  24.17 
 
 
535 aa  64.3  0.000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2271  hydroxylamine reductase  23.24 
 
 
550 aa  63.9  0.000000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.663099  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1599  hybrid cluster protein  25.93 
 
 
549 aa  63.9  0.000000008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000102791  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0988  hydroxylamine reductase  25.68 
 
 
539 aa  63.9  0.000000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.160693 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0816  hydroxylamine reductase  21.45 
 
 
545 aa  63.2  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0141  hybrid cluster protein  25.69 
 
 
553 aa  62.8  0.00000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.409118 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>