112 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mthe_1216 on replicon NC_008553
Organism: Methanosaeta thermophila PT



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A3717  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  68.45 
 
 		 634 aa  930    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1216  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  100 
 
 		 648 aa  1326    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.655192  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1166  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  47.63 
 
 		 637 aa  627  1e-178  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0652  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  39.03 
 
 		 707 aa  462  1e-129  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00052858  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0860  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  37.21 
 
 		 695 aa  462  1e-129  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.199727  normal  0.922779 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2918  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  36.05 
 
 		 710 aa  436  1e-121  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0596914  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2875  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  36.12 
 
 		 626 aa  377  1e-103  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.843098  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1234  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  34.33 
 
 		 629 aa  372  1e-101  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0405701  normal  0.377093 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2327  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  34.12 
 
 		 621 aa  366  1e-100  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00453727  normal  0.0261188 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0382  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  34.73 
 
 		 631 aa  361  2e-98  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.72739  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1272  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  33.59 
 
 		 628 aa  359  9e-98  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.142133  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3525  carbon monoxide dehydrogenase  33.65 
 
 		 624 aa  358  1.9999999999999998e-97  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0888  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  32.44 
 
 		 629 aa  355  1e-96  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.186953  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1341  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  34.39 
 
 		 623 aa  353  4e-96  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0842  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  33.75 
 
 		 629 aa  350  4e-95  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.183197  normal  0.106762 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0934  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  33.91 
 
 		 627 aa  343  4e-93  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.502316  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0884  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  33.44 
 
 		 653 aa  337  5e-91  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.17634  normal  0.977834 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3028  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  33.49 
 
 		 625 aa  336  9e-91  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2233  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  34.92 
 
 		 629 aa  336  9e-91  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1133  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  34.65 
 
 		 629 aa  331  2e-89  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.394682  normal  0.139391 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0057  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  32.3 
 
 		 645 aa  327  4.0000000000000003e-88  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.612526  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2933  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  30.96 
 
 		 623 aa  324  3e-87  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000257353  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0618  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  30.83 
 
 		 641 aa  319  1e-85  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2098  carbon monoxide dehydrogenase subunit  30.64 
 
 		 640 aa  310  5e-83  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2566  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  31.96 
 
 		 663 aa  308  3e-82  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0882  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  30.23 
 
 		 635 aa  308  3e-82  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0335  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  32.62 
 
 		 642 aa  303  9e-81  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3185  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  29.74 
 
 		 679 aa  286  7e-76  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.579976  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1461  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  31.11 
 
 		 656 aa  283  7.000000000000001e-75  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000668721  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0870  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  34.6 
 
 		 628 aa  278  3e-73  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.404437  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0149  carbon-monoxide dehydrogenase (acceptor)  30.97 
 
 		 680 aa  276  8e-73  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1736  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  30.11 
 
 		 666 aa  273  1e-71  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.306274  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0072  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  30.28 
 
 		 635 aa  270  5e-71  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1131  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  29.05 
 
 		 676 aa  270  8e-71  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000338326  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0236  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  28.14 
 
 		 679 aa  266  8.999999999999999e-70  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2801  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  28.98 
 
 		 670 aa  264  4e-69  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000137875  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04490  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  29.71 
 
 		 632 aa  261  2e-68  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1972  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  29.34 
 
 		 655 aa  259  2e-67  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000154748  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1902  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  29.11 
 
 		 669 aa  257  6e-67  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000268472  hitchhiker  0.000000000000110792 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3792  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  28.07 
 
 		 635 aa  254  5.000000000000001e-66  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.117932  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4498  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  28.44 
 
 		 663 aa  251  4e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.325797 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0438  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  27.82 
 
 		 663 aa  245  1.9999999999999999e-63  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.000000530778  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1203  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  27.81 
 
 		 674 aa  234  3e-60  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2798  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  27.57 
 
 		 672 aa  229  9e-59  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1427  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  27.98 
 
 		 639 aa  225  2e-57  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1270  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  26.6 
 
 		 673 aa  221  3.9999999999999997e-56  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00748773  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3780  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  27.33 
 
 		 674 aa  209  1e-52  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.288316  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1669  hydroxylamine reductase  24.23 
 
 		 540 aa  55.1  0.000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.100106  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1905  hydroxylamine reductase  23.08 
 
 		 427 aa  54.3  0.000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00412747  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0957  hydroxylamine reductase  25.33 
 
 		 547 aa  53.9  0.000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0754  hydroxylamine reductase  27.65 
 
 		 552 aa  52  0.00003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1829  hydroxylamine reductase  24.42 
 
 		 545 aa  52  0.00004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0506  hydroxylamine reductase  24.03 
 
 		 542 aa  51.2  0.00006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.775368 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0970  hydroxylamine reductase  21.38 
 
 		 591 aa  50.8  0.00007  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.164641  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1595  hydroxylamine reductase  24.09 
 
 		 543 aa  50.4  0.0001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.333402  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0977  hydroxylamine reductase  25.61 
 
 		 555 aa  50.1  0.0001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.349617 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1168  hydroxylamine reductase  25.12 
 
 		 552 aa  50.1  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1919  hydroxylamine reductase  25.59 
 
 		 553 aa  50.1  0.0001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.877615  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0466  hydroxylamine reductase  24.42 
 
 		 542 aa  49.3  0.0002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3125  hydroxylamine reductase  25.62 
 
 		 551 aa  49.7  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2189  hydroxylamine reductase  23.81 
 
 		 538 aa  48.9  0.0003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.00125687  normal  0.781035 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1660  hydroxylamine reductase  23.02 
 
 		 562 aa  48.9  0.0003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2909  hydroxylamine reductase  23.43 
 
 		 547 aa  48.9  0.0003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2587  hydroxylamine reductase  23.43 
 
 		 547 aa  48.5  0.0003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000431874  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1599  hybrid cluster protein  26.44 
 
 		 549 aa  48.5  0.0003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000102791  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1978  hydroxylamine reductase  24.23 
 
 		 542 aa  48.9  0.0003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.881596  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1390  hydroxylamine reductase  27.86 
 
 		 550 aa  48.5  0.0004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0468  hybrid cluster protein  21.48 
 
 		 444 aa  48.5  0.0004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.0000131773  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3702  hydroxylamine reductase  24.14 
 
 		 533 aa  47.8  0.0006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.456407  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0512  hydroxylamine reductase  23.66 
 
 		 540 aa  47.8  0.0006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.96139  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0406  hybrid cluster protein  25.35 
 
 		 554 aa  47.8  0.0006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0164  hydroxylamine reductase  24.33 
 
 		 546 aa  47.8  0.0007  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.930451  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2458  hydroxylamine reductase  27.36 
 
 		 550 aa  47.8  0.0007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1490  hydroxylamine reductase  25 
 
 		 540 aa  47  0.001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000660036  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1377  hydroxylamine reductase  28.67 
 
 		 441 aa  46.6  0.001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2875  hydroxylamine reductase  25.59 
 
 		 548 aa  47  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0115588  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18290  hydroxylamine reductase  22.22 
 
 		 555 aa  46.6  0.001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000343984  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1173  hydroxylamine reductase  20.63 
 
 		 549 aa  46.6  0.001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000032867  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00878  hydroxylamine reductase  27.86 
 
 		 550 aa  46.2  0.002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2769  hybrid cluster protein  27.86 
 
 		 550 aa  46.2  0.002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0893  hydroxylamine reductase  25.73 
 
 		 546 aa  46.6  0.002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1201  hydroxylamine reductase  24.51 
 
 		 531 aa  46.2  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1326  hydroxylamine reductase  23.78 
 
 		 545 aa  45.8  0.002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.611962  normal  0.884501 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0423  hydroxylamine reductase  21.98 
 
 		 435 aa  46.2  0.002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000304226  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2940  hydroxylamine reductase  22.01 
 
 		 447 aa  46.2  0.002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00378374  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1302  hydroxylamine reductase  25.27 
 
 		 433 aa  45.8  0.002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0977  hydroxylamine reductase  27.86 
 
 		 550 aa  46.2  0.002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0946  hydroxylamine reductase  27.36 
 
 		 550 aa  46.2  0.002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.869117  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2723  hydroxylamine reductase  27.86 
 
 		 550 aa  46.2  0.002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.18873  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0902  hydroxylamine reductase  27.36 
 
 		 550 aa  46.2  0.002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.800969 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0972  hydroxylamine reductase  27.86 
 
 		 550 aa  45.8  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1035  hydroxylamine reductase  27.86 
 
 		 550 aa  45.8  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1054  hydroxylamine reductase  27.86 
 
 		 550 aa  46.2  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0937  hydroxylamine reductase  27.86 
 
 		 550 aa  45.8  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.697919  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1004  hydroxylamine reductase  27.86 
 
 		 550 aa  46.2  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.97662  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1034  hydroxylamine reductase  27.36 
 
 		 550 aa  46.6  0.002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4539  hydroxylamine reductase  23.95 
 
 		 549 aa  46.2  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00884  hypothetical protein  27.86 
 
 		 550 aa  46.2  0.002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1053  hydroxylamine reductase  22.06 
 
 		 539 aa  45.4  0.003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2701  hydroxylamine reductase  24.05 
 
 		 550 aa  45.4  0.003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>