181 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_0423 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009253  Dred_0423  hydroxylamine reductase  100 
 
 
435 aa  892    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000304226  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2938  hydroxylamine reductase  74.71 
 
 
461 aa  674    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000065218  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2940  hydroxylamine reductase  91.72 
 
 
447 aa  836    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00378374  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3216  hydroxylamine reductase  67.74 
 
 
428 aa  622  1e-177  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3446  hydroxylamine reductase  67.28 
 
 
436 aa  621  1e-177  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3458  hydroxylamine reductase  67.05 
 
 
436 aa  618  1e-176  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3243  hydroxylamine reductase  67.28 
 
 
428 aa  619  1e-176  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.19186  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3153  hydroxylamine reductase  67.05 
 
 
428 aa  619  1e-176  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3471  hydroxylamine reductase  67.51 
 
 
436 aa  620  1e-176  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00683577  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3497  hydroxylamine reductase  67.28 
 
 
428 aa  619  1e-176  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1803  hydroxylamine reductase  67.05 
 
 
436 aa  618  1e-176  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3151  hydroxylamine reductase  67.51 
 
 
428 aa  620  1e-176  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000614247  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1676  hydroxylamine reductase  66.35 
 
 
428 aa  615  1e-175  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.150263  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2542  hydroxylamine reductase  61.84 
 
 
435 aa  573  1.0000000000000001e-162  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0330494  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1377  hydroxylamine reductase  58.68 
 
 
441 aa  548  1e-155  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1540  hydroxylamine reductase  58.54 
 
 
442 aa  540  9.999999999999999e-153  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0447  hydroxylamine reductase  57.95 
 
 
454 aa  537  1e-151  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0137  hydroxylamine reductase  60.78 
 
 
427 aa  529  1e-149  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000271526  normal  0.86078 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0468  hybrid cluster protein  56.39 
 
 
444 aa  527  1e-148  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.0000131773  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0918  hydroxylamine reductase  59.23 
 
 
444 aa  526  1e-148  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0273412  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1816  hydroxylamine reductase  56.39 
 
 
453 aa  524  1e-147  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0688399  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1905  hydroxylamine reductase  57.57 
 
 
427 aa  503  1e-141  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00412747  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1577  hydroxylamine reductase  52.35 
 
 
431 aa  450  1e-125  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1643  hydroxylamine reductase  52.58 
 
 
431 aa  451  1e-125  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1302  hydroxylamine reductase  52.59 
 
 
433 aa  450  1e-125  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3228  hydroxylamine reductase  52.4 
 
 
568 aa  429  1e-119  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.892851 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1033  hydroxylamine reductase  52.78 
 
 
568 aa  428  1e-118  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1173  hydroxylamine reductase  51.06 
 
 
549 aa  421  1e-116  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000032867  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0663  hydroxylamine reductase  50.61 
 
 
541 aa  417  9.999999999999999e-116  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.430546  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1364  hydroxylamine reductase  51.57 
 
 
549 aa  415  9.999999999999999e-116  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.453221  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2872  hydroxylamine reductase  50.97 
 
 
553 aa  414  1e-114  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.000000295577  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3702  hydroxylamine reductase  50.85 
 
 
533 aa  412  1e-114  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.456407  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0213  hydroxylamine reductase  50.85 
 
 
533 aa  412  1e-114  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.8548  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3038  hydroxylamine reductase  50.85 
 
 
549 aa  408  1e-113  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2834  hydroxylamine reductase  51.09 
 
 
547 aa  407  1.0000000000000001e-112  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000787255  hitchhiker  0.00000000000275149 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1239  hydroxylamine reductase  50.61 
 
 
549 aa  407  1.0000000000000001e-112  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000262121  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3576  hydroxylamine reductase  49.07 
 
 
531 aa  406  1.0000000000000001e-112  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0674  hydroxylamine reductase  50.97 
 
 
548 aa  404  1e-111  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.09718  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0837  hydroxylamine reductase  49.88 
 
 
550 aa  404  1e-111  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00540032  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2647  hydroxylamine reductase  49.88 
 
 
533 aa  402  1e-111  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.654819  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0585  hydroxylamine reductase  49.88 
 
 
533 aa  402  1e-111  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000760383  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1201  hydroxylamine reductase  50.36 
 
 
531 aa  403  1e-111  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0704  hydroxylamine reductase  50.24 
 
 
537 aa  404  1e-111  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.308475 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1750  hybrid cluster protein  48.06 
 
 
532 aa  400  9.999999999999999e-111  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.531638  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2190  hydroxylamine reductase  47.48 
 
 
526 aa  399  9.999999999999999e-111  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.317395  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3446  hydroxylamine reductase  49.15 
 
 
542 aa  399  9.999999999999999e-111  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  unclonable  0.0000118604 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1609  hydroxylamine reductase  49.13 
 
 
542 aa  400  9.999999999999999e-111  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.726092  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2222  hydroxylamine reductase  48.71 
 
 
430 aa  395  1e-109  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.040247  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1600  hydroxylamine reductase  49.13 
 
 
542 aa  397  1e-109  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1355  hydroxylamine reductase  49.88 
 
 
557 aa  394  1e-108  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0988  hydroxylamine reductase  48.18 
 
 
539 aa  392  1e-108  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.160693 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28240  hydroxylamine reductase  49.4 
 
 
525 aa  392  1e-108  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.230727 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1657  hydroxylamine reductase  49.88 
 
 
556 aa  394  1e-108  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.922648  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3188  hydroxylamine reductase  49.05 
 
 
544 aa  389  1e-107  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0212462 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0742  hydroxylamine reductase  48.24 
 
 
531 aa  385  1e-106  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.483638  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2641  hydroxylamine reductase  48.18 
 
 
537 aa  385  1e-106  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.897837  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0406  hybrid cluster protein  47.62 
 
 
554 aa  385  1e-106  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0981  hydroxylamine reductase  47.2 
 
 
557 aa  382  1e-105  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00091795 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1168  hydroxylamine reductase  46.38 
 
 
552 aa  382  1e-105  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0816  hydroxylamine reductase  45.62 
 
 
545 aa  383  1e-105  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2941  hydroxylamine reductase  49.28 
 
 
565 aa  382  1e-105  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3125  hydroxylamine reductase  46.38 
 
 
551 aa  382  1e-105  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0845  hydroxylamine reductase  45.62 
 
 
545 aa  380  1e-104  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.633582  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0596  hydroxylamine reductase  48.18 
 
 
535 aa  380  1e-104  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2759  hydroxylamine reductase  49.39 
 
 
549 aa  377  1e-103  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003799  hydroxylamine reductase  45.93 
 
 
553 aa  378  1e-103  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0974  hydroxylamine reductase  49.26 
 
 
546 aa  372  1e-102  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00100558  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1707  hydroxylamine reductase  45.77 
 
 
550 aa  373  1e-102  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4165  hydroxylamine reductase  44.55 
 
 
549 aa  371  1e-101  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1424  hydroxylamine reductase  46.63 
 
 
522 aa  370  1e-101  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.013462  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1069  hydroxylamine reductase  46.36 
 
 
554 aa  370  1e-101  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0141  hybrid cluster protein  47.69 
 
 
553 aa  366  1e-100  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.409118 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_12416  predicted protein  45.78 
 
 
551 aa  366  1e-100  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1798  hydroxylamine reductase  46.39 
 
 
557 aa  367  1e-100  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1973  hydroxylamine reductase  44.36 
 
 
550 aa  366  1e-100  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1216  hydroxylamine reductase  45.26 
 
 
554 aa  364  2e-99  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.453579  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1390  hydroxylamine reductase  43.88 
 
 
550 aa  364  2e-99  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1165  hydroxylamine reductase  45.34 
 
 
552 aa  364  2e-99  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1293  hydroxylamine reductase  45.01 
 
 
554 aa  364  2e-99  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.86267  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1260  hydroxylamine reductase  45.01 
 
 
554 aa  363  3e-99  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3097  hydroxylamine reductase  45.01 
 
 
554 aa  363  4e-99  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0213297  normal  0.133055 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2701  hydroxylamine reductase  43.45 
 
 
550 aa  363  4e-99  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1599  hybrid cluster protein  47.27 
 
 
549 aa  362  5.0000000000000005e-99  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000102791  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2617  hydroxylamine reductase  43.45 
 
 
550 aa  362  5.0000000000000005e-99  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1591  hydroxylamine reductase  43.45 
 
 
550 aa  362  5.0000000000000005e-99  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2371  hydroxylamine reductase  44.25 
 
 
550 aa  361  1e-98  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2271  hydroxylamine reductase  45.02 
 
 
550 aa  361  2e-98  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.663099  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1055  hydroxylamine reductase  44.98 
 
 
554 aa  360  2e-98  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1260  hydroxylamine reductase  45.09 
 
 
552 aa  359  5e-98  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.181543  hitchhiker  0.000316349 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1174  hydroxylamine reductase  44.77 
 
 
554 aa  359  6e-98  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0529148  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1121  hydroxylamine reductase  47.88 
 
 
555 aa  359  7e-98  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.800783  normal  0.249924 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1054  hydroxylamine reductase  43.41 
 
 
550 aa  358  7e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1004  hydroxylamine reductase  43.41 
 
 
550 aa  358  9e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.97662  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0895  hydroxylamine reductase  44.23 
 
 
554 aa  358  9e-98  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.62617 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1035  hydroxylamine reductase  43.41 
 
 
550 aa  358  9e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0937  hydroxylamine reductase  43.41 
 
 
550 aa  358  9e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.697919  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0972  hydroxylamine reductase  43.41 
 
 
550 aa  358  9e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2386  hydroxylamine reductase  46.14 
 
 
566 aa  357  1.9999999999999998e-97  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00790044  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01080  hydroxylamine reductase  47 
 
 
520 aa  357  1.9999999999999998e-97  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.626709  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2914  hydroxylamine reductase  44.04 
 
 
554 aa  357  1.9999999999999998e-97  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>