94 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_2918 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010718  Nther_0860  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  75.48 
 
 		 695 aa  1115    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.199727  normal  0.922779 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0652  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  72.21 
 
 		 707 aa  1033    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00052858  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2918  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  100 
 
 		 710 aa  1484    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0596914  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3717  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  39.65 
 
 		 634 aa  449  1e-125  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1216  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  36.05 
 
 		 648 aa  442  9.999999999999999e-123  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.655192  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1166  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  37.02 
 
 		 637 aa  434  1e-120  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2933  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  35.42 
 
 		 623 aa  380  1e-104  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000257353  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0888  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  35.34 
 
 		 629 aa  380  1e-104  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.186953  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0382  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  33.92 
 
 		 631 aa  355  1e-96  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.72739  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1341  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  33.7 
 
 		 623 aa  343  5e-93  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2098  carbon monoxide dehydrogenase subunit  33.94 
 
 		 640 aa  341  2e-92  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2327  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  33.7 
 
 		 621 aa  341  2.9999999999999998e-92  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00453727  normal  0.0261188 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1234  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  33.02 
 
 		 629 aa  341  4e-92  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0405701  normal  0.377093 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0882  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  33.13 
 
 		 635 aa  338  1.9999999999999998e-91  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2875  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  33.88 
 
 		 626 aa  336  7e-91  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.843098  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0618  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  33.75 
 
 		 641 aa  336  7.999999999999999e-91  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0884  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  33.97 
 
 		 653 aa  335  1e-90  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.17634  normal  0.977834 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3028  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  32.6 
 
 		 625 aa  335  2e-90  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3525  carbon monoxide dehydrogenase  31.9 
 
 		 624 aa  332  2e-89  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0057  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  34.99 
 
 		 645 aa  326  8.000000000000001e-88  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.612526  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2233  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  32.96 
 
 		 629 aa  319  1e-85  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0934  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  32.19 
 
 		 627 aa  318  2e-85  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.502316  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1272  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  32.11 
 
 		 628 aa  317  5e-85  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.142133  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3792  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  33.02 
 
 		 635 aa  316  9.999999999999999e-85  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.117932  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1133  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  31.89 
 
 		 629 aa  303  5.000000000000001e-81  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.394682  normal  0.139391 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4498  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  33.44 
 
 		 663 aa  301  2e-80  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.325797 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0072  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  32.25 
 
 		 635 aa  301  3e-80  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0842  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  31.43 
 
 		 629 aa  300  7e-80  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.183197  normal  0.106762 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1270  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  30.59 
 
 		 673 aa  298  2e-79  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00748773  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3185  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  30.85 
 
 		 679 aa  298  3e-79  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.579976  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04490  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  30.89 
 
 		 632 aa  295  3e-78  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1203  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  30.61 
 
 		 674 aa  293  1e-77  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3780  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  30.45 
 
 		 674 aa  286  7e-76  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.288316  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1972  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  32.35 
 
 		 655 aa  286  9e-76  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000154748  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0236  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  30.1 
 
 		 679 aa  283  1e-74  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0335  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  32.06 
 
 		 642 aa  281  4e-74  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2566  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  30.6 
 
 		 663 aa  280  9e-74  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2801  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  32.25 
 
 		 670 aa  279  1e-73  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000137875  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1427  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  31.1 
 
 		 639 aa  277  4e-73  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1461  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  31.16 
 
 		 656 aa  276  9e-73  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000668721  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1902  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  30.14 
 
 		 669 aa  275  1.0000000000000001e-72  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000268472  hitchhiker  0.000000000000110792 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1736  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  29.77 
 
 		 666 aa  275  3e-72  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.306274  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2798  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  27.84 
 
 		 672 aa  273  8.000000000000001e-72  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0438  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  30.48 
 
 		 663 aa  271  2.9999999999999997e-71  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.000000530778  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0870  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  31.27 
 
 		 628 aa  270  8e-71  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.404437  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1131  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  28.93 
 
 		 676 aa  268  2e-70  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000338326  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0149  carbon-monoxide dehydrogenase (acceptor)  27.29 
 
 		 680 aa  226  2e-57  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3188  hydroxylamine reductase  30.98 
 
 		 544 aa  59.3  0.0000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0212462 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3609  hydroxylamine reductase  25 
 
 		 552 aa  55.1  0.000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.918432  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0893  hydroxylamine reductase  27.68 
 
 		 546 aa  51.6  0.00004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1424  hydroxylamine reductase  24.61 
 
 		 522 aa  49.7  0.0002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.013462  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2189  hydroxylamine reductase  24.4 
 
 		 538 aa  49.3  0.0003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.00125687  normal  0.781035 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0895  hydroxylamine reductase  25.14 
 
 		 554 aa  49.3  0.0003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.62617 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0406  hybrid cluster protein  29.34 
 
 		 554 aa  48.1  0.0005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3125  hydroxylamine reductase  27.85 
 
 		 551 aa  47.8  0.0007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1168  hydroxylamine reductase  28.48 
 
 		 552 aa  47.8  0.0007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0219  hydroxylamine reductase  26.47 
 
 		 538 aa  47.4  0.0009  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1165  hydroxylamine reductase  25.96 
 
 		 552 aa  47  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0137  hydroxylamine reductase  27.03 
 
 		 427 aa  47.4  0.001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000271526  normal  0.86078 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1260  hydroxylamine reductase  24.32 
 
 		 552 aa  47.4  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.181543  hitchhiker  0.000316349 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0937  hydroxylamine reductase  27.27 
 
 		 550 aa  46.6  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.697919  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1004  hydroxylamine reductase  27.27 
 
 		 550 aa  46.2  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.97662  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1390  hydroxylamine reductase  26.6 
 
 		 550 aa  46.2  0.002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1054  hydroxylamine reductase  27.27 
 
 		 550 aa  46.6  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1035  hydroxylamine reductase  27.27 
 
 		 550 aa  46.6  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0972  hydroxylamine reductase  27.27 
 
 		 550 aa  46.6  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0977  hydroxylamine reductase  25.29 
 
 		 555 aa  46.2  0.002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.349617 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1174  hydroxylamine reductase  26.67 
 
 		 554 aa  46.6  0.002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0529148  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003799  hydroxylamine reductase  24.68 
 
 		 553 aa  46.2  0.002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0596  hydroxylamine reductase  30 
 
 		 535 aa  45.8  0.003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1173  hydroxylamine reductase  26.55 
 
 		 549 aa  45.4  0.003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000032867  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3228  hydroxylamine reductase  25.68 
 
 		 568 aa  45.8  0.003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.892851 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1055  hydroxylamine reductase  25.84 
 
 		 554 aa  45.4  0.003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_12416  predicted protein  28.57 
 
 		 551 aa  45.8  0.003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2458  hydroxylamine reductase  26.67 
 
 		 550 aa  45.8  0.003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1069  hydroxylamine reductase  25.75 
 
 		 554 aa  45.8  0.003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1326  hydroxylamine reductase  26.75 
 
 		 545 aa  45.4  0.003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.611962  normal  0.884501 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3446  hydroxylamine reductase  26.01 
 
 		 542 aa  45.4  0.003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000118604 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1750  hybrid cluster protein  28.48 
 
 		 532 aa  44.7  0.005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.531638  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2386  hydroxylamine reductase  25.81 
 
 		 566 aa  44.7  0.006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00790044  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0845  hydroxylamine reductase  28.43 
 
 		 545 aa  44.3  0.007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.633582  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4165  hydroxylamine reductase  27.06 
 
 		 549 aa  44.3  0.008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1260  hydroxylamine reductase  24.87 
 
 		 554 aa  44.3  0.008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3097  hydroxylamine reductase  24.87 
 
 		 554 aa  43.9  0.009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0213297  normal  0.133055 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0981  hydroxylamine reductase  25 
 
 		 557 aa  44.3  0.009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00091795 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2723  hydroxylamine reductase  26.67 
 
 		 550 aa  43.9  0.01  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.18873  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00884  hypothetical protein  26.67 
 
 		 550 aa  43.9  0.01  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1034  hydroxylamine reductase  26.67 
 
 		 550 aa  43.9  0.01  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0902  hydroxylamine reductase  26.67 
 
 		 550 aa  43.9  0.01  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.800969 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00878  hydroxylamine reductase  26.67 
 
 		 550 aa  43.9  0.01  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0977  hydroxylamine reductase  26.67 
 
 		 550 aa  43.9  0.01  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1302  hydroxylamine reductase  26.63 
 
 		 433 aa  43.9  0.01  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1121  hydroxylamine reductase  25.1 
 
 		 555 aa  43.9  0.01  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.800783  normal  0.249924 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2769  hybrid cluster protein  26.67 
 
 		 550 aa  43.9  0.01  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>