203 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_1272 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013173  Dbac_0934  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  52.26 
 
 
627 aa  662    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.502316  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3525  carbon monoxide dehydrogenase  56.34 
 
 
624 aa  738    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1234  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  51.15 
 
 
629 aa  668    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0405701  normal  0.377093 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3028  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  51.23 
 
 
625 aa  643    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0382  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  51.47 
 
 
631 aa  660    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.72739  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1272  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  100 
 
 
628 aa  1288    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.142133  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2233  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  53.03 
 
 
629 aa  664    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0842  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  74.96 
 
 
629 aa  996    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.183197  normal  0.106762 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1341  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  55.63 
 
 
623 aa  682    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2875  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  55.03 
 
 
626 aa  710    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.843098  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1133  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  53.85 
 
 
629 aa  668    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.394682  normal  0.139391 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0884  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  55.89 
 
 
653 aa  734    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.17634  normal  0.977834 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2327  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  57.54 
 
 
621 aa  738    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00453727  normal  0.0261188 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2098  carbon monoxide dehydrogenase subunit  49.84 
 
 
640 aa  605  9.999999999999999e-173  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0057  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  48.73 
 
 
645 aa  598  1e-170  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.612526  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0618  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  48.82 
 
 
641 aa  598  1e-169  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0335  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  49.28 
 
 
642 aa  595  1e-169  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3185  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  46.77 
 
 
679 aa  573  1.0000000000000001e-162  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.579976  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1461  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  47.18 
 
 
656 aa  552  1e-156  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000668721  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2566  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  45.77 
 
 
663 aa  553  1e-156  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0882  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  46.68 
 
 
635 aa  545  1e-153  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0870  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  47.22 
 
 
628 aa  541  9.999999999999999e-153  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.404437  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4498  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  43.53 
 
 
663 aa  507  9.999999999999999e-143  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.325797 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3792  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  42.2 
 
 
635 aa  501  1e-140  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.117932  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1427  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  43.13 
 
 
639 aa  493  9.999999999999999e-139  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0072  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  43.37 
 
 
635 aa  476  1e-133  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2798  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  41.67 
 
 
672 aa  463  1e-129  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1203  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  42.93 
 
 
674 aa  458  1e-127  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1270  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  41.6 
 
 
673 aa  452  1e-125  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00748773  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04490  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  41.03 
 
 
632 aa  447  1.0000000000000001e-124  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3780  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  40.39 
 
 
674 aa  429  1e-119  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.288316  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1972  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  35.4 
 
 
655 aa  400  9.999999999999999e-111  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000154748  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1736  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  34.03 
 
 
666 aa  360  4e-98  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.306274  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1216  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  33.59 
 
 
648 aa  359  8e-98  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.655192  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3717  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  34.27 
 
 
634 aa  354  2e-96  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1902  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  34.03 
 
 
669 aa  353  5e-96  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000268472  hitchhiker  0.000000000000110792 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0236  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  34.03 
 
 
679 aa  351  3e-95  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1131  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  32.85 
 
 
676 aa  347  3e-94  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000338326  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2801  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  34.98 
 
 
670 aa  347  5e-94  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000137875  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0438  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  33.54 
 
 
663 aa  346  8.999999999999999e-94  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.000000530778  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1166  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  34.43 
 
 
637 aa  345  1e-93  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2933  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  34.43 
 
 
623 aa  335  2e-90  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000257353  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0860  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  33.5 
 
 
695 aa  328  1.0000000000000001e-88  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.199727  normal  0.922779 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0888  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  32.79 
 
 
629 aa  320  7e-86  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.186953  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0652  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  32.22 
 
 
707 aa  319  7.999999999999999e-86  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00052858  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2918  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  32.11 
 
 
710 aa  313  3.9999999999999997e-84  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0596914  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0149  carbon-monoxide dehydrogenase (acceptor)  32.54 
 
 
680 aa  312  1e-83  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1173  hydroxylamine reductase  23.49 
 
 
549 aa  75.9  0.000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000032867  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2242  hydroxylamine reductase  25.47 
 
 
541 aa  66.2  0.000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.675401  normal  0.897477 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0858  acetyl-CoA decarbonylase/synthase complex subunit alpha  25.26 
 
 
802 aa  65.5  0.000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  unclonable  0.00000000764937  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0674  hydroxylamine reductase  23.32 
 
 
548 aa  64.7  0.000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.09718  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1201  hydroxylamine reductase  27.75 
 
 
531 aa  64.3  0.000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0754  hydroxylamine reductase  30.8 
 
 
552 aa  64.3  0.000000006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2190  hydroxylamine reductase  22.72 
 
 
526 aa  63.2  0.00000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.317395  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0105  acetyl-CoA decarbonylase/synthase complex subunit alpha  23.3 
 
 
766 aa  62.8  0.00000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0475  acetyl-CoA decarbonylase/synthase complex subunit alpha  22.72 
 
 
768 aa  62.4  0.00000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.908557  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0977  hydroxylamine reductase  24.31 
 
 
555 aa  61.6  0.00000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.349617 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3576  hydroxylamine reductase  26.63 
 
 
531 aa  61.6  0.00000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0988  hydroxylamine reductase  24.21 
 
 
539 aa  61.2  0.00000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.160693 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2641  hydroxylamine reductase  25 
 
 
537 aa  60.8  0.00000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.897837  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2189  hydroxylamine reductase  29.3 
 
 
538 aa  60.5  0.0000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.00125687  normal  0.781035 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3609  hydroxylamine reductase  25 
 
 
552 aa  60.1  0.0000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.918432  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0596  hydroxylamine reductase  27.32 
 
 
535 aa  60.5  0.0000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0957  hydroxylamine reductase  25.07 
 
 
547 aa  60.5  0.0000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1905  hydroxylamine reductase  22.77 
 
 
427 aa  60.1  0.0000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00412747  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2941  hydroxylamine reductase  25.85 
 
 
565 aa  59.7  0.0000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28240  hydroxylamine reductase  23.88 
 
 
525 aa  58.9  0.0000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.230727 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1004  hydroxylamine reductase  26.9 
 
 
550 aa  58.5  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.97662  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2834  hydroxylamine reductase  22.89 
 
 
547 aa  58.9  0.0000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000787255  hitchhiker  0.00000000000275149 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1424  hydroxylamine reductase  28.22 
 
 
522 aa  58.9  0.0000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.013462  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3446  hydroxylamine reductase  24.42 
 
 
542 aa  58.5  0.0000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  unclonable  0.0000118604 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0663  hydroxylamine reductase  21.91 
 
 
541 aa  58.9  0.0000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.430546  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0213  hydroxylamine reductase  26.29 
 
 
533 aa  58.9  0.0000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.8548  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3702  hydroxylamine reductase  25.65 
 
 
533 aa  58.5  0.0000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.456407  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2458  hydroxylamine reductase  24.33 
 
 
550 aa  58.2  0.0000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0742  hydroxylamine reductase  28.26 
 
 
531 aa  58.2  0.0000005  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.483638  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1053  hydroxylamine reductase  26.63 
 
 
539 aa  57.8  0.0000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1660  hydroxylamine reductase  23.61 
 
 
562 aa  58.2  0.0000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3228  hydroxylamine reductase  23.99 
 
 
568 aa  58.2  0.0000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.892851 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1174  hydroxylamine reductase  26.8 
 
 
554 aa  58.2  0.0000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0529148  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2872  hydroxylamine reductase  22.56 
 
 
553 aa  57.8  0.0000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.000000295577  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2759  hydroxylamine reductase  28.57 
 
 
549 aa  57.4  0.0000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0837  hydroxylamine reductase  26.29 
 
 
550 aa  57.4  0.0000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00540032  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0468  hybrid cluster protein  23.08 
 
 
444 aa  57.4  0.0000008  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.0000131773  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0981  hydroxylamine reductase  27.41 
 
 
557 aa  57.4  0.0000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00091795 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1973  hydroxylamine reductase  24.4 
 
 
550 aa  57  0.0000009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0036  hydroxylamine reductase  24.59 
 
 
542 aa  57  0.0000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1363  hydroxylamine reductase  25.57 
 
 
554 aa  56.6  0.000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2909  hydroxylamine reductase  24.12 
 
 
547 aa  56.6  0.000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2587  hydroxylamine reductase  24.12 
 
 
547 aa  56.6  0.000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000431874  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0972  hydroxylamine reductase  26.4 
 
 
550 aa  56.6  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0585  hydroxylamine reductase  26.18 
 
 
533 aa  57  0.000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000760383  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1609  hydroxylamine reductase  25.97 
 
 
542 aa  56.6  0.000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.726092  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2647  hydroxylamine reductase  26.18 
 
 
533 aa  57  0.000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.654819  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1054  hydroxylamine reductase  26.4 
 
 
550 aa  57  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0937  hydroxylamine reductase  26.4 
 
 
550 aa  56.6  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.697919  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1035  hydroxylamine reductase  26.4 
 
 
550 aa  56.6  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1260  hydroxylamine reductase  26.36 
 
 
554 aa  56.6  0.000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1168  hydroxylamine reductase  26.46 
 
 
552 aa  56.2  0.000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3097  hydroxylamine reductase  26.36 
 
 
554 aa  56.2  0.000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0213297  normal  0.133055 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>