110 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_1166 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A3717  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  49.45 
 
 		 634 aa  643    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1166  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  100 
 
 		 637 aa  1315    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1216  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  47.63 
 
 		 648 aa  627  1e-178  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.655192  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0860  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  37.5 
 
 		 695 aa  442  1e-123  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.199727  normal  0.922779 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0652  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  38.98 
 
 		 707 aa  434  1e-120  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00052858  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2918  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  37.02 
 
 		 710 aa  422  1e-117  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0596914  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2875  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  38.31 
 
 		 626 aa  395  1e-108  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.843098  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1234  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  35.49 
 
 		 629 aa  377  1e-103  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0405701  normal  0.377093 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2327  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  35.22 
 
 		 621 aa  377  1e-103  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00453727  normal  0.0261188 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0934  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  35.69 
 
 		 627 aa  360  6e-98  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.502316  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2933  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  34.24 
 
 		 623 aa  360  6e-98  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000257353  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0888  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  33.39 
 
 		 629 aa  359  7e-98  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.186953  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0057  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  36.15 
 
 		 645 aa  357  5e-97  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.612526  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0884  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  34.27 
 
 		 653 aa  354  2.9999999999999997e-96  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.17634  normal  0.977834 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3525  carbon monoxide dehydrogenase  33.92 
 
 		 624 aa  353  4e-96  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0842  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  35.99 
 
 		 629 aa  351  3e-95  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.183197  normal  0.106762 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2098  carbon monoxide dehydrogenase subunit  35.05 
 
 		 640 aa  350  6e-95  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0618  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  35.03 
 
 		 641 aa  348  1e-94  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1341  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  33.71 
 
 		 623 aa  346  8.999999999999999e-94  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1272  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  34.43 
 
 		 628 aa  345  1e-93  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.142133  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0882  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  34.57 
 
 		 635 aa  343  4e-93  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0382  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  34.8 
 
 		 631 aa  344  4e-93  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.72739  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3028  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  34.13 
 
 		 625 aa  341  2.9999999999999998e-92  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2233  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  35.07 
 
 		 629 aa  330  3e-89  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1133  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  34.33 
 
 		 629 aa  321  3e-86  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.394682  normal  0.139391 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0335  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  33.49 
 
 		 642 aa  306  8.000000000000001e-82  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0236  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  30.72 
 
 		 679 aa  305  1.0000000000000001e-81  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1972  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  32.22 
 
 		 655 aa  301  3e-80  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000154748  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1131  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  30.78 
 
 		 676 aa  300  8e-80  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000338326  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2801  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  31.14 
 
 		 670 aa  298  3e-79  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000137875  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1461  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  31.86 
 
 		 656 aa  297  5e-79  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000668721  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04490  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  30.55 
 
 		 632 aa  293  5e-78  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2566  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  32.07 
 
 		 663 aa  290  5.0000000000000004e-77  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1736  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  30.46 
 
 		 666 aa  288  2e-76  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.306274  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3185  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  30 
 
 		 679 aa  283  6.000000000000001e-75  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.579976  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2798  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  32.19 
 
 		 672 aa  283  6.000000000000001e-75  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1270  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  30.5 
 
 		 673 aa  283  1e-74  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00748773  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1203  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  29.77 
 
 		 674 aa  280  5e-74  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4498  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  31.25 
 
 		 663 aa  278  3e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.325797 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3792  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  30.25 
 
 		 635 aa  278  3e-73  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.117932  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0149  carbon-monoxide dehydrogenase (acceptor)  30.22 
 
 		 680 aa  265  1e-69  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0072  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  30.88 
 
 		 635 aa  265  2e-69  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0438  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  28.59 
 
 		 663 aa  264  4e-69  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.000000530778  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1427  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  30.99 
 
 		 639 aa  263  8.999999999999999e-69  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1902  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  29.67 
 
 		 669 aa  262  2e-68  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000268472  hitchhiker  0.000000000000110792 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0870  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  31.86 
 
 		 628 aa  261  4e-68  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.404437  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3780  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  30.1 
 
 		 674 aa  255  2.0000000000000002e-66  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.288316  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0957  hydroxylamine reductase  23.45 
 
 		 547 aa  70.9  0.00000000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18290  hydroxylamine reductase  23.12 
 
 		 555 aa  67.8  0.0000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000343984  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1302  hydroxylamine reductase  25.27 
 
 		 433 aa  63.2  0.00000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1643  hydroxylamine reductase  24.46 
 
 		 431 aa  62.8  0.00000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1053  hydroxylamine reductase  24.24 
 
 		 539 aa  59.7  0.0000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1577  hydroxylamine reductase  24.19 
 
 		 431 aa  58.9  0.0000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2542  hydroxylamine reductase  21.77 
 
 		 435 aa  57.4  0.0000009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0330494  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3188  hydroxylamine reductase  24.53 
 
 		 544 aa  55.5  0.000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0212462 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0981  hydroxylamine reductase  22.64 
 
 		 557 aa  53.1  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00091795 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1660  hydroxylamine reductase  23.81 
 
 		 562 aa  52.4  0.00003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1905  hydroxylamine reductase  22.45 
 
 		 427 aa  51.6  0.00004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00412747  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0468  hybrid cluster protein  26.11 
 
 		 444 aa  51.6  0.00005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.0000131773  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1634  hydroxylamine reductase  27.21 
 
 		 538 aa  51.2  0.00006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.228305  normal  0.622946 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0137  hydroxylamine reductase  26.03 
 
 		 427 aa  49.3  0.0002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000271526  normal  0.86078 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0423  hydroxylamine reductase  26.62 
 
 		 435 aa  49.3  0.0002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000304226  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2940  hydroxylamine reductase  26.82 
 
 		 447 aa  49.7  0.0002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00378374  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0663  hydroxylamine reductase  25.37 
 
 		 541 aa  48.5  0.0003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.430546  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1676  hydroxylamine reductase  21.26 
 
 		 428 aa  48.5  0.0003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.150263  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0974  hydroxylamine reductase  23.44 
 
 		 546 aa  48.1  0.0005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00100558  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1174  hydroxylamine reductase  23.33 
 
 		 554 aa  47.8  0.0006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0529148  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0406  hybrid cluster protein  26.74 
 
 		 554 aa  47.4  0.0009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0845  hydroxylamine reductase  26.15 
 
 		 545 aa  47.4  0.0009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.633582  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2834  hydroxylamine reductase  23.26 
 
 		 547 aa  46.6  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000787255  hitchhiker  0.00000000000275149 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1816  hydroxylamine reductase  25.95 
 
 		 453 aa  47  0.001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0688399  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3576  hydroxylamine reductase  24.51 
 
 		 531 aa  47  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1364  hydroxylamine reductase  21.86 
 
 		 549 aa  46.6  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.453221  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1260  hydroxylamine reductase  23.02 
 
 		 554 aa  47  0.001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3097  hydroxylamine reductase  23.02 
 
 		 554 aa  46.6  0.001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0213297  normal  0.133055 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0816  hydroxylamine reductase  25.84 
 
 		 545 aa  47  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1173  hydroxylamine reductase  22.16 
 
 		 549 aa  47.4  0.001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000032867  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2371  hydroxylamine reductase  21.35 
 
 		 550 aa  46.6  0.001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2189  hydroxylamine reductase  25.17 
 
 		 538 aa  46.2  0.002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.00125687  normal  0.781035 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0918  hydroxylamine reductase  24.83 
 
 		 444 aa  46.2  0.002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0273412  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1201  hydroxylamine reductase  25.13 
 
 		 531 aa  46.2  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1326  hydroxylamine reductase  26.35 
 
 		 545 aa  46.2  0.002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.611962  normal  0.884501 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003799  hydroxylamine reductase  22.18 
 
 		 553 aa  45.8  0.002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2271  hydroxylamine reductase  20.82 
 
 		 550 aa  45.8  0.002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.663099  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2872  hydroxylamine reductase  24.19 
 
 		 553 aa  45.4  0.003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.000000295577  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1121  hydroxylamine reductase  22.57 
 
 		 555 aa  45.4  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.800783  normal  0.249924 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0213  hydroxylamine reductase  22.01 
 
 		 533 aa  45.4  0.003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.8548  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1168  hydroxylamine reductase  22.36 
 
 		 552 aa  45.4  0.003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3125  hydroxylamine reductase  22.36 
 
 		 551 aa  45.4  0.003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1750  hybrid cluster protein  19.83 
 
 		 532 aa  45.1  0.004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.531638  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1069  hydroxylamine reductase  22.59 
 
 		 554 aa  45.1  0.004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1293  hydroxylamine reductase  22.64 
 
 		 554 aa  45.1  0.004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.86267  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0837  hydroxylamine reductase  24.1 
 
 		 550 aa  44.7  0.005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00540032  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3702  hydroxylamine reductase  21.3 
 
 		 533 aa  44.7  0.005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.456407  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1055  hydroxylamine reductase  21.29 
 
 		 554 aa  44.7  0.005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0585  hydroxylamine reductase  21.74 
 
 		 533 aa  44.7  0.005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000760383  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2647  hydroxylamine reductase  21.74 
 
 		 533 aa  44.7  0.005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.654819  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1239  hydroxylamine reductase  22.98 
 
 		 549 aa  44.7  0.005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000262121  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3038  hydroxylamine reductase  22.98 
 
 		 549 aa  44.7  0.005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1666  hydroxylamine reductase  22.3 
 
 		 565 aa  44.7  0.006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.372025  normal  0.875893 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>