182 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_0141 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010625  Bphy_6194  hydroxylamine reductase  63.6 
 
 
553 aa  692    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.994183  normal  0.0395415 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1121  hydroxylamine reductase  67.93 
 
 
555 aa  736    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.800783  normal  0.249924 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0141  hybrid cluster protein  100 
 
 
553 aa  1114    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.409118 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4090  hydroxylamine reductase  68.09 
 
 
555 aa  729    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4555  hydroxylamine reductase  68.09 
 
 
555 aa  729    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00753041 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1798  hydroxylamine reductase  63.99 
 
 
557 aa  714    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0406  hybrid cluster protein  77.94 
 
 
554 aa  903    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4621  hydroxylamine reductase  65.89 
 
 
559 aa  726    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0716541 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1355  hydroxylamine reductase  61.05 
 
 
557 aa  699    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1657  hydroxylamine reductase  61.05 
 
 
556 aa  699    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.922648  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1055  hydroxylamine reductase  50.9 
 
 
554 aa  572  1.0000000000000001e-162  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0895  hydroxylamine reductase  50.54 
 
 
554 aa  571  1e-161  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.62617 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1600  hydroxylamine reductase  51 
 
 
542 aa  570  1e-161  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3097  hydroxylamine reductase  50.72 
 
 
554 aa  565  1e-160  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0213297  normal  0.133055 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0981  hydroxylamine reductase  50.64 
 
 
557 aa  565  1e-160  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00091795 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1609  hydroxylamine reductase  50.82 
 
 
542 aa  565  1e-160  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.726092  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1165  hydroxylamine reductase  50.54 
 
 
552 aa  565  1e-160  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1174  hydroxylamine reductase  50.9 
 
 
554 aa  564  1.0000000000000001e-159  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0529148  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2371  hydroxylamine reductase  51.18 
 
 
550 aa  559  1e-158  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1363  hydroxylamine reductase  49.64 
 
 
554 aa  559  1e-158  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1750  hybrid cluster protein  51.99 
 
 
532 aa  558  1e-158  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.531638  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3609  hydroxylamine reductase  49.64 
 
 
552 aa  560  1e-158  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.918432  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1216  hydroxylamine reductase  50.18 
 
 
554 aa  560  1e-158  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.453579  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1707  hydroxylamine reductase  50.09 
 
 
550 aa  560  1e-158  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1260  hydroxylamine reductase  50.54 
 
 
554 aa  560  1e-158  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1293  hydroxylamine reductase  50.54 
 
 
554 aa  560  1e-158  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.86267  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1973  hydroxylamine reductase  49.55 
 
 
550 aa  556  1e-157  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2832  hydroxylamine reductase  50 
 
 
554 aa  556  1e-157  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.310206  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2914  hydroxylamine reductase  49.64 
 
 
554 aa  556  1e-157  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3011  hydroxylamine reductase  49.82 
 
 
554 aa  557  1e-157  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003799  hydroxylamine reductase  48.09 
 
 
553 aa  555  1e-157  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1260  hydroxylamine reductase  50.36 
 
 
552 aa  556  1e-157  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.181543  hitchhiker  0.000316349 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1069  hydroxylamine reductase  49.46 
 
 
554 aa  556  1e-157  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2759  hydroxylamine reductase  53.83 
 
 
549 aa  554  1e-156  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3446  hydroxylamine reductase  50.45 
 
 
542 aa  555  1e-156  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  unclonable  0.0000118604 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2271  hydroxylamine reductase  51.36 
 
 
550 aa  553  1e-156  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.663099  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0704  hydroxylamine reductase  51.72 
 
 
537 aa  548  1e-155  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.308475 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2617  hydroxylamine reductase  49.37 
 
 
550 aa  549  1e-155  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1591  hydroxylamine reductase  49.37 
 
 
550 aa  549  1e-155  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2701  hydroxylamine reductase  49.37 
 
 
550 aa  549  1e-155  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0988  hydroxylamine reductase  52.08 
 
 
539 aa  547  1e-154  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.160693 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1390  hydroxylamine reductase  50.82 
 
 
550 aa  545  1e-154  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1666  hydroxylamine reductase  50.18 
 
 
565 aa  547  1e-154  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.372025  normal  0.875893 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1173  hydroxylamine reductase  48.83 
 
 
549 aa  542  1e-153  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000032867  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00878  hydroxylamine reductase  50.27 
 
 
550 aa  540  9.999999999999999e-153  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2769  hybrid cluster protein  50.27 
 
 
550 aa  540  9.999999999999999e-153  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2458  hydroxylamine reductase  50.27 
 
 
550 aa  539  9.999999999999999e-153  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00884  hypothetical protein  50.27 
 
 
550 aa  540  9.999999999999999e-153  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1034  hydroxylamine reductase  50.27 
 
 
550 aa  539  9.999999999999999e-153  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0977  hydroxylamine reductase  50.27 
 
 
550 aa  540  9.999999999999999e-153  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0946  hydroxylamine reductase  50.27 
 
 
550 aa  540  9.999999999999999e-153  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.869117  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2723  hydroxylamine reductase  50.27 
 
 
550 aa  540  9.999999999999999e-153  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.18873  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0596  hydroxylamine reductase  49.09 
 
 
535 aa  536  1e-151  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0902  hydroxylamine reductase  50.09 
 
 
550 aa  538  1e-151  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.800969 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1054  hydroxylamine reductase  49.73 
 
 
550 aa  534  1e-150  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1004  hydroxylamine reductase  49.73 
 
 
550 aa  534  1e-150  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.97662  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0972  hydroxylamine reductase  49.73 
 
 
550 aa  534  1e-150  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0937  hydroxylamine reductase  49.73 
 
 
550 aa  534  1e-150  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.697919  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1035  hydroxylamine reductase  49.73 
 
 
550 aa  534  1e-150  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3228  hydroxylamine reductase  48.46 
 
 
568 aa  531  1e-149  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.892851 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2941  hydroxylamine reductase  47.37 
 
 
565 aa  526  1e-148  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0663  hydroxylamine reductase  48.82 
 
 
541 aa  528  1e-148  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.430546  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1033  hydroxylamine reductase  47.73 
 
 
568 aa  522  1e-147  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2834  hydroxylamine reductase  48.01 
 
 
547 aa  522  1e-147  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000787255  hitchhiker  0.00000000000275149 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0674  hydroxylamine reductase  47.75 
 
 
548 aa  520  1e-146  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.09718  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1364  hydroxylamine reductase  48.39 
 
 
549 aa  518  1.0000000000000001e-145  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.453221  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3188  hydroxylamine reductase  46.29 
 
 
544 aa  514  1e-144  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0212462 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2386  hydroxylamine reductase  47.89 
 
 
566 aa  512  1e-144  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00790044  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2641  hydroxylamine reductase  47.94 
 
 
537 aa  508  9.999999999999999e-143  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.897837  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3702  hydroxylamine reductase  47.73 
 
 
533 aa  505  9.999999999999999e-143  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.456407  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0213  hydroxylamine reductase  46.82 
 
 
533 aa  501  1e-140  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.8548  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4165  hydroxylamine reductase  45.44 
 
 
549 aa  500  1e-140  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2872  hydroxylamine reductase  45.8 
 
 
553 aa  494  9.999999999999999e-139  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.000000295577  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1201  hydroxylamine reductase  48.46 
 
 
531 aa  493  9.999999999999999e-139  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3576  hydroxylamine reductase  47.19 
 
 
531 aa  493  9.999999999999999e-139  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1239  hydroxylamine reductase  47.58 
 
 
549 aa  489  1e-137  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000262121  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2647  hydroxylamine reductase  47.01 
 
 
533 aa  491  1e-137  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.654819  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0585  hydroxylamine reductase  47.01 
 
 
533 aa  491  1e-137  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000760383  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0816  hydroxylamine reductase  44.88 
 
 
545 aa  490  1e-137  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0837  hydroxylamine reductase  45.18 
 
 
550 aa  486  1e-136  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00540032  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0845  hydroxylamine reductase  44.7 
 
 
545 aa  486  1e-136  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.633582  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3038  hydroxylamine reductase  46.75 
 
 
549 aa  486  1e-136  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2190  hydroxylamine reductase  45.23 
 
 
526 aa  484  1e-135  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.317395  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1168  hydroxylamine reductase  45.77 
 
 
552 aa  483  1e-135  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0974  hydroxylamine reductase  45.71 
 
 
546 aa  480  1e-134  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00100558  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3125  hydroxylamine reductase  45.59 
 
 
551 aa  481  1e-134  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18290  hydroxylamine reductase  45.12 
 
 
555 aa  477  1e-133  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000343984  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1424  hydroxylamine reductase  45.88 
 
 
522 aa  468  9.999999999999999e-131  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.013462  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4539  hydroxylamine reductase  43.55 
 
 
549 aa  466  9.999999999999999e-131  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0977  hydroxylamine reductase  42.45 
 
 
555 aa  465  1e-129  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.349617 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28240  hydroxylamine reductase  46.33 
 
 
525 aa  463  1e-129  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.230727 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1163  hydroxylamine reductase  44.36 
 
 
543 aa  464  1e-129  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0957  hydroxylamine reductase  43.73 
 
 
547 aa  461  9.999999999999999e-129  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2587  hydroxylamine reductase  42.7 
 
 
547 aa  451  1e-125  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000431874  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2909  hydroxylamine reductase  42.53 
 
 
547 aa  448  1.0000000000000001e-124  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1599  hybrid cluster protein  41.83 
 
 
549 aa  446  1.0000000000000001e-124  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000102791  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0754  hydroxylamine reductase  43.65 
 
 
552 aa  448  1.0000000000000001e-124  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0742  hydroxylamine reductase  44.76 
 
 
531 aa  446  1.0000000000000001e-124  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.483638  normal 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_12416  predicted protein  43.67 
 
 
551 aa  448  1.0000000000000001e-124  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2189  hydroxylamine reductase  44.51 
 
 
538 aa  443  1e-123  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.00125687  normal  0.781035 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>