45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A0211 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A0211  hypothetical protein  100 
 
 		 253 aa  504  9.999999999999999e-143  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.730473  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2377  hypothetical protein  36.76 
 
 		 174 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.388128 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3212  hypothetical protein  34.95 
 
 		 256 aa  116  3.9999999999999997e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1735  hypothetical protein  37.16 
 
 		 254 aa  115  6.9999999999999995e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.9552  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2571  hypothetical protein  37.91 
 
 		 259 aa  107  2e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.352522  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1335  putative chemotaxis phosphatase, CheZ  35.59 
 
 		 263 aa  107  2e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1840  hypothetical protein  35.75 
 
 		 260 aa  105  7e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0085031 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3002  putative chemotaxis phosphatase, CheZ  35.03 
 
 		 241 aa  104  2e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4723  hypothetical protein  35.2 
 
 		 259 aa  103  3e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2879  hypothetical protein  37.78 
 
 		 241 aa  103  3e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.364633  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3105  putative chemotaxis phosphatase, CheZ  37.78 
 
 		 241 aa  103  3e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.163127  normal  0.170192 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2836  hypothetical protein  38.83 
 
 		 259 aa  102  6e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4123  hypothetical protein  34.55 
 
 		 257 aa  100  2e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.40781 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3193  hypothetical protein  36.81 
 
 		 260 aa  100  2e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1674  hypothetical protein  32.22 
 
 		 237 aa  92  7e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0815  hypothetical protein  34.57 
 
 		 435 aa  92  8e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.872238  normal  0.105867 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0849  hypothetical protein  35.5 
 
 		 399 aa  90.1  3e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00517849 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0889  hypothetical protein  35.5 
 
 		 399 aa  90.1  3e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.135602 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5406  putative chemotaxis phosphatase, CheZ  33.52 
 
 		 238 aa  90.1  3e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0365  putative chemotaxis phosphatase, CheZ  32.02 
 
 		 183 aa  88.6  1e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0207321  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3649  hypothetical protein  32.97 
 
 		 236 aa  87  3e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0137828 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2224  putative chemotaxis phosphatase, CheZ  34.97 
 
 		 197 aa  87  3e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.659574  normal  0.116449 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0609  chemotaxis protein  35.59 
 
 		 229 aa  87  3e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.147414 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4931  hypothetical protein  34.92 
 
 		 288 aa  86.3  4e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.154084  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1950  hypothetical protein  33.85 
 
 		 440 aa  86.3  5e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.309179 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0191  putative chemotaxis phosphatase, CheZ  32.58 
 
 		 236 aa  85.5  7e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0876048  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4959  hypothetical protein  35.71 
 
 		 294 aa  83.6  0.000000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.096287  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0884  putative chemotaxis phosphatase, CheZ  33.33 
 
 		 177 aa  79.7  0.00000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.156124  hitchhiker  0.002075 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0387  putative chemotaxis phosphatase, CheZ  32.18 
 
 		 196 aa  78.6  0.00000000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0451  putative chemotaxis phosphatase, CheZ  31.03 
 
 		 178 aa  72.8  0.000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.149721  normal  0.211219 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0418  chemotaxis protein  31.03 
 
 		 178 aa  72.8  0.000000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.499236  normal  0.280148 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0488  putative chemotaxis phosphatase, CheZ  31.03 
 
 		 159 aa  71.6  0.00000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.405335  normal  0.531435 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1621  putative chemotaxis phosphatase, CheZ  36.32 
 
 		 248 aa  61.2  0.00000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0389  putative chemotaxis phosphatase, CheZ  31.33 
 
 		 211 aa  58.5  0.0000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.0037983  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0261  putative chemotaxis phosphatase, CheZ  30 
 
 		 248 aa  56.6  0.0000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.046719 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2148  chemotaxis protein CheZ, putative  38.18 
 
 		 242 aa  56.2  0.0000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.992761  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0749  chemotaxis phosphatase, CheZ  30.77 
 
 		 217 aa  51.6  0.00001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3732  hypothetical protein  32.82 
 
 		 121 aa  48.9  0.00008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0481  putative chemotaxis phosphatase, CheZ  35.43 
 
 		 242 aa  48.1  0.0001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2917  chemotaxis phosphatase, CheZ  23.89 
 
 		 245 aa  47.4  0.0002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2557  chemotaxis phosphatase, CheZ  22.95 
 
 		 245 aa  47.4  0.0002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.91816  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1361  chemotaxis phosphatase, CheZ  21.03 
 
 		 245 aa  44.7  0.002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.349045  normal  0.0601628 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1368  chemotaxis phosphatase, CheZ  21.03 
 
 		 245 aa  44.7  0.002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.724461  normal  0.296544 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1301  chemotaxis phosphatase, CheZ  21.03 
 
 		 245 aa  44.7  0.002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.194293  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3208  chemotaxis protein CheZ  21.31 
 
 		 245 aa  42.4  0.008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>