41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_1621 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008751  Dvul_1621  putative chemotaxis phosphatase, CheZ  100 
 
 		 248 aa  495  1e-139  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0261  putative chemotaxis phosphatase, CheZ  58.47 
 
 		 248 aa  290  2e-77  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.046719 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2148  chemotaxis protein CheZ, putative  55.24 
 
 		 242 aa  274  8e-73  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.992761  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0481  putative chemotaxis phosphatase, CheZ  45.56 
 
 		 242 aa  199  3e-50  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0389  putative chemotaxis phosphatase, CheZ  46.73 
 
 		 211 aa  176  4e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.0037983  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0211  hypothetical protein  36.32 
 
 		 253 aa  62.8  0.000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.730473  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1973  chemotaxis phosphatase, CheZ  24.44 
 
 		 261 aa  49.3  0.00005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3222  chemotaxis regulator CheZ  26.42 
 
 		 284 aa  49.3  0.00006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.504893  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27940  chemotaxis regulator CheZ  28.65 
 
 		 226 aa  48.9  0.00008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.000139196  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1674  hypothetical protein  28.29 
 
 		 237 aa  48.1  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1840  hypothetical protein  27.56 
 
 		 260 aa  48.1  0.0001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0085031 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1201  chemotaxis phosphatase, CheZ  25.33 
 
 		 245 aa  47.4  0.0002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0237799  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1528  chemotaxis phosphatase, CheZ  24.3 
 
 		 262 aa  47.8  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.298774  normal  0.476992 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1335  putative chemotaxis phosphatase, CheZ  28.77 
 
 		 263 aa  47.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1385  chemotaxis phosphatase, CheZ  24.17 
 
 		 245 aa  47.4  0.0002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00582364  normal  0.177515 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2836  hypothetical protein  32.39 
 
 		 259 aa  47.8  0.0002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4123  hypothetical protein  26.62 
 
 		 257 aa  46.2  0.0004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.40781 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4339  chemotaxis phosphatase, CheZ  23.83 
 
 		 262 aa  46.2  0.0005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.297829  normal  0.458128 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0192  putative chemotaxis phosphatase, CheZ  26.88 
 
 		 186 aa  45.8  0.0007  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00264382  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0609  chemotaxis protein  30.21 
 
 		 229 aa  45.4  0.0008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.147414 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2803  chemotaxis phosphatase, CheZ  23.79 
 
 		 262 aa  45.1  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.402968  normal  0.192895 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1380  chemotaxis phosphatase, CheZ  24.8 
 
 		 245 aa  43.9  0.002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.659888  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3908  chemotaxis phosphatase, CheZ  23.36 
 
 		 262 aa  44.3  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.925973  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0749  chemotaxis phosphatase, CheZ  27.27 
 
 		 217 aa  43.9  0.002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2452  chemotaxis regulator CheZ  34.38 
 
 		 214 aa  43.9  0.003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.657615  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2278  putative chemotaxis phosphatase, CheZ  25.93 
 
 		 245 aa  43.5  0.003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0191817  normal  0.62928 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1565  chemotaxis phosphatase, CheZ  23.04 
 
 		 262 aa  43.5  0.003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.058559  normal  0.0518536 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00955  chemotaxis phosphatase CheZ  26.77 
 
 		 208 aa  43.1  0.004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.417483  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06211  chemotaxis phosphatase CheZ  26.77 
 
 		 208 aa  43.1  0.004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.695232  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2907  chemotaxis phosphatase, CheZ  25.33 
 
 		 245 aa  43.5  0.004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.569265  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3665  chemotaxis phosphatase, CheZ  23.36 
 
 		 262 aa  42.7  0.005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.00761761  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4959  hypothetical protein  33.57 
 
 		 294 aa  42.7  0.005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.096287  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2978  chemotaxis regulator CheZ  31.25 
 
 		 214 aa  42.7  0.006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.943723  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2288  chemotaxis protein CheZ  31.37 
 
 		 239 aa  42.7  0.006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0191  putative chemotaxis phosphatase, CheZ  32.71 
 
 		 236 aa  42.4  0.006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0876048  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3091  chemotaxis phosphatase, CheZ  31.96 
 
 		 209 aa  42.4  0.007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1177  chemotaxis phosphatase, CheZ  30.43 
 
 		 258 aa  42.4  0.008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.169266  normal  0.394686 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1401  chemotaxis regulator CheZ  33.33 
 
 		 220 aa  42  0.008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.21819  normal  0.433138 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3870  chemotaxis protein CheZ  22.54 
 
 		 262 aa  42  0.009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.158166  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1456  chemotaxis phosphatase, CheZ  26.22 
 
 		 245 aa  42  0.01  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.26387  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1345  chemotaxis phosphatase, CheZ  25 
 
 		 245 aa  42  0.01  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>